GBS-MeDIP: A protocol for parallel identification of genetic and epigenetic variation in the same reduced fraction of genomes across individuals

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-531498" > GBS-MeDIP :

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Rezaei, ShivaLinköpings universitet,Biologi,Tekniska fakulteten,University of Tabriz, Tabriz, Iran,Univ Tabriz, Fac Nat Sci, Dept Anim Biol, Tabriz 5166616471, Iran.;Linköping Univ, Dept Phys Chem & Biol IFM, Avian Behav Genom & Physiol Grp, S-58183 Linköping, Sweden. (författare)

GBS-MeDIP : A protocol for parallel identification of genetic and epigenetic variation in the same reduced fraction of genomes across individuals

Artikel/kapitelEngelska2022

Förlag, utgivningsår, omfång ...

Cell Press,2022
electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-531498
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-531498URI
https://doi.org/10.1016/j.xpro.2022.101202DOI
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:liu:diva-188044URI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska
Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

The GBS-MeDIP protocol combines two previously described techniques, Geno-type-by-Sequencing (GBS) and Methylated-DNA- Immunoprecipitation (MeDIP). Our method allows for parallel and cost-efficient interrogation of genetic and methylomic variants in the DNA of many reduced genomes, taking advantage of the barcoding of DNA samples performed in the GBS and the subsequent creation of DNA pools, then used as an input for the MeDIP. The GBS-MeDIP is particularly suitable to identify genetic and methylomic biomarkers when resources for whole genome interrogation are lacking.

Ämnesord och genrebeteckningar

NATURVETENSKAP Biologi Biokemi och molekylärbiologi hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences Biochemistry and Molecular Biology hsv//eng
NATURVETENSKAP Biologi Genetik hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences Genetics hsv//eng
NATURVETENSKAP Data- och informationsvetenskap hsv//swe
NATURAL SCIENCES Computer and Information Sciences hsv//eng
NATURVETENSKAP Biologi hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences hsv//eng
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper hsv//swe
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES Basic Medicine hsv//eng
Cancer
Clinical Protocol
Genomics
Sequencing
High Throughput Screening
Molecular Biology

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Uffenorde, JuliaLinköpings universitet,Avdelningen för neurobiologi,Medicinska fakulteten,Region Östergötland, Kirurgiska kliniken US,Linköping Univ, Dept Surg, S-58183 Linköping, Sweden.;Linköping Univ, Dept Biomed & Clin Sci BKV, S-58183 Linköping, Sweden.(Swepub:liu)juluf61 (författare)
Gimm, Oliver,1967-Linköpings universitet,Avdelningen för kirurgi, ortopedi och onkologi,Medicinska fakulteten,Region Östergötland, Kirurgiska kliniken US,Linköping Univ, Dept Surg, S-58183 Linköping, Sweden.;Linköping Univ, Dept Biomed & Clin Sci BKV, S-58183 Linköping, Sweden.(Swepub:liu)oligi51 (författare)
Feizi, Mohammad Ali HosseinpourUniv Tabriz, Fac Nat Sci, Dept Anim Biol, Tabriz 5166616471, Iran.,University of Tabriz, Tabriz, Iran (författare)
Miemczyk, StefanLinköpings universitet,Biologi,Tekniska fakulteten,Linköping Univ, Dept Phys Chem & Biol IFM, Avian Behav Genom & Physiol Grp, S-58183 Linköping, Sweden.(Swepub:liu)n/a (författare)
Lehman Coutinho, LuizUppsala universitet,Miljötoxikologi,Uppsala University, Sweden (författare)
Jensen, Per,1956-Linköpings universitet,Biologi,Tekniska fakulteten,Linköping Univ, Dept Phys Chem & Biol IFM, Avian Behav Genom & Physiol Grp, S-58183 Linköping, Sweden.(Swepub:liu)perje15 (författare)
Guerrero-Bosagna, Carlos,1975-Linköpings universitet,Uppsala universitet,Miljötoxikologi,Linköping Univ, Dept Phys Chem & Biol IFM, Avian Behav Genom & Physiol Grp, S-58183 Linköping, Sweden.,Biologi,Tekniska fakulteten,Uppsala University, Sweden(Swepub:liu)cargu13 (författare)
Pèrtille, FábioLinköpings universitet,Uppsala universitet,Miljötoxikologi,Linköping Univ, Dept Surg, S-58183 Linköping, Sweden.;Linköping Univ, Dept Biomed & Clin Sci BKV, S-58183 Linköping, Sweden.;Linköping Univ, Dept Phys Chem & Biol IFM, Avian Behav Genom & Physiol Grp, S-58183 Linköping, Sweden.;Univ Sao Paulo, Anim Sci Dept, Anim Biotechnol Lab, Luiz de Queiroz Coll Agr ESALQ, BR-1341890 Piracicaba, SP, Brazil.,Avdelningen för cellbiologi,Medicinska fakulteten,Biologi,Tekniska fakulteten,Uppsala University, Sweden; College of Agriculture (ESALQ), Brazil(Swepub:liu)fabpe91 (författare)
Linköpings universitetBiologi (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

Ingår i:STAR protocols: Cell Press3:12666-1667

Internetlänk

Hitta via bibliotek

STAR protocols (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Rezaei, Shiva; Uffenorde, Julia; Gimm, Oliver, 19 ...; Feizi, Mohammad ...; Miemczyk, Stefan; Lehman Coutinho, ...; visa fler...; Jensen, Per, 195 ...; Guerrero-Bosagna ...; Pèrtille, Fábio; visa färre...

Om ämnet

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi; och Biokemi och mole ...

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi; och Genetik

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Data och informa ...

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Medicinska och f ...

Artiklar i publikationen: STAR protocols

Av lärosätet: Uppsala universitet; Linköpings universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se