onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-73267"
Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-73267" > Genome-wide predict...
- 1 av 1
- Föregående post
- Nästa post
- Till träfflistan
- Näslund, KalleUppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi,Evolutionsbiologi (författare)
Genome-wide prediction of human VNTRs
- Artikel/kapitelEngelska2005
Förlag, utgivningsår, omfång ...
- Elsevier BV,2005
- printrdacarrier
Nummerbeteckningar
- LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-73267
- https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-73267URI
- https://doi.org/10.1016/j.ygeno.2004.10.009DOI
Kompletterande språkuppgifter
- Språk:engelska
- Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
- SwePubSwePub
Klassifikation
Anmärkningar
- Polymorphic minisatellites, also known as variable number of tandem repeats (VNTRs), are tandem repeat regions that show variation in the number of repeat units among chromosomes in a population. Currently, there are no general methods for predicting which minisatellites have a high probability of being polymorphic, given their sequence characteristics. An earlier approach has focused on potentially highly polymorphic and hypervariable minisatellites, which make up only a small fraction of all minisatellites in the human genome. We have developed a model, based on available minisatellite and VNTR sequence data, that predicts the probability that a minisatellite (unit size > or = 6 bp) identified by the computer program Tandem Repeats Finder is polymorphic (VNTR). According to the model, minisatellites with high copy number and high degree of sequence similarity are most likely to be VNTRs. This approach was used to scan the draft sequence of the human genome for VNTRs. A total of 157,549 minisatellite repeats were found, of which 29,224 are predicted to be VNTRs. Contrary to previous results, VNTRs appear to be widespread and abundant throughout the human genome, with an estimated density of 9.1 VNTRs/Mb.
Ämnesord och genrebeteckningar
- NATURVETENSKAP Biologi Genetik hsv//swe
- NATURAL SCIENCES Biological Sciences Genetics hsv//eng
- VNTR
- Minisatellite
- Genetics
- Genetik
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
- Saetre, PeterUppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi,Evolutionsbiologi(Swepub:uu)pesae517 (författare)
- von Salomé, JennyUppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi,Evolutionsbiologi(Swepub:uu)jennsalo (författare)
- Bergström, TomasUppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi,Centrum för bioinformatik,Evolutionsbiologi(Swepub:uu)tomasbs (författare)
- Jareborg, Niclas (författare)
- Jazin, ElenaUppsala universitet,Evolutionsbiologi(Swepub:uu)elenjazi (författare)
- Uppsala universitetInstitutionen för genetik och patologi (creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
- Ingår i:Genomics: Elsevier BV85:1, s. 24-350888-75431089-8646
Internetlänk
- 1 av 1
- Föregående post
- Nästa post
- Till träfflistan
Hitta mer i SwePub
- Av författaren/redakt...
- Näslund, Kalle
- Saetre, Peter
- von Salomé, Jenn ...
- Bergström, Tomas
- Jareborg, Niclas
- Jazin, Elena
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
- NATURVETENSKAP
- och Biologi
- och Genetik
- Artiklar i publikationen
- Genomics
- Av lärosätet
- Uppsala universitet
Sök utanför SwePub
- Sök vidare i:
- Google Book Search
- Google Scholar
Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.
- Copyright © LIBRIS - Nationella bibliotekssystem
- LIBRIS.kb.se
