SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/166029"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/166029" > Flavobacterium onco...

Flavobacterium oncorhynchi sp. nov., a new species isolated from rainbow trout (Oncorhynchus mykiss).

Zamora, L (författare)
Fernández-Garayzábal, J F (författare)
Svensson-Stadler, Liselott, 1971 (författare)
Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar,Institute of Biomedicine, Department of Infectious Medicine
visa fler...
Palacios, M A (författare)
Domínguez, L (författare)
Moore, Edward R.B. 1954 (författare)
Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar,Institute of Biomedicine, Department of Infectious Medicine
Vela, A I (författare)
visa färre...
 (creator_code:org_t)
Elsevier BV, 2012
2012
Engelska.
Ingår i: Systematic and applied microbiology. - : Elsevier BV. - 1618-0984 .- 0723-2020. ; 35:2, s. 86-91
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Eighteen isolates of a Gram-negative, catalase and oxidase-positive, rod-shaped bacterium, recovered from diseased rainbow trout (Oncorhynchus mykiss), were characterized, using a polyphasic taxonomic approach. Studies based on comparative 16S rRNA gene sequence analysis showed that that the eighteen new isolates shared 99.2-100% sequence similarities. Phylogenetic analysis revealed that isolates from trout belonged to the genus Flavobacterium, showing the highest sequence similarities to F. chungangense (98.6%), F. frigidimaris (98.1%), F. hercynium (97.9%) and F. aquidurense (97.8%). DNA-DNA reassociation values between the trout isolates (exemplified by strain 631-08(T)) and five type strains of the most closely related Flavobacterium species exhibited less than 27% similarity. The G+C content of the genomic DNA was 33.0 mol%. The major respiratory quinone was observed to be menaquinone 6 (MK-6) and iso-C(15:0), C(15:0) and C(16:1) ω7c the predominant fatty acids. The polar lipid profile of strain 631-08(T) consisted of phosphatidylethanolamine, unknown aminolipids AL1 and AL3, lipids L1, L2, L3 and L4 and phospholipid PL1. The novel isolates were differentiated from related Flavobacterium species by physiological and biochemical tests. On the basis of the evidence from this polyphasic study, it is proposed that the isolates from rainbow trout be classified as a new species of the genus Flavobacterium, Flavobacterium oncorhynchi sp. nov. The type strain is 631-08(T) (= CECT 7678(T) = CCUG 59446(T)).

Ämnesord

NATURVETENSKAP  -- Biologi -- Mikrobiologi (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences -- Microbiology (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin -- Infektionsmedicin (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine -- Infectious Medicine (hsv//eng)

Nyckelord

Animals
Bacterial Typing Techniques
Base Composition
Base Sequence
DNA
Bacterial
analysis
genetics
DNA
Ribosomal
analysis
genetics
Flavobacteriaceae Infections
microbiology
Flavobacterium
classification
genetics
isolation & purification
Molecular Sequence Data
Oncorhynchus mykiss
microbiology
Phylogeny
RNA
Ribosomal
16S
analysis
genetics
Sequence Alignment
Sequence Analysis
DNA

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy