Sökning: onr:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/184152" >
Predicting Enzyme-S...
Predicting Enzyme-Substrate Specificity with QM/MM Methods: A Case Study of the Stereospecificity of D-Glucarate Dehydratase
-
Tian, B. X. (författare)
-
Wallrapp, F. (författare)
-
Kalyanaraman, C. (författare)
-
visa fler...
-
Zhao, S. W. (författare)
-
- Eriksson, Leif A, 1964 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kemi och molekylärbiologi,Department of Chemistry and Molecular Biology
-
Jacobson, M. P. (författare)
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2013-08-09
- 2013
- Engelska.
-
Ingår i: Biochemistry. - : American Chemical Society (ACS). - 0006-2960 .- 1520-4995. ; 52:33, s. 5511-5513
- Relaterad länk:
-
https://europepmc.or...
-
visa fler...
-
https://gup.ub.gu.se...
-
https://doi.org/10.1...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- The stereospecificity of D-glucarate dehydratase (GlucD) is explored by QM/MM calculations. Both the substrate binding and the chemical steps of GlucD contribute to substrate specificity. Although the identification of transition states remains computationally intensive, we suggest that QM/MM computations on ground states or intermediates can capture aspects of specificity that cannot be obtained using docking or molecular mechanics methods.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Cell- och molekylärbiologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Cell and Molecular Biology (hsv//eng)
Nyckelord
- MANDELATE RACEMASE ENZYME
- D-GALACTONATE DEHYDRATASE
- GENERAL ACID
- CATALYST
- ENOLASE SUPERFAMILY
- ESCHERICHIA-COLI
- ACTIVE-SITE
- COMPUTER-SIMULATIONS
- PSEUDOMONAS-PUTIDA
- MOLECULAR-DYNAMICS
- UNKNOWN
- FUNCTION
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas