SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/186081"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/186081" > Transcriptome signa...

  • Nookaew, Intawat,1977Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology (författare)

Transcriptome signatures in Helicobacter pylori-infected mucosa identifies acidic mammalian chitinase loss as a corpus atrophy marker

  • Artikel/kapitelEngelska2013

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2013-10-11
  • Springer Science and Business Media LLC,2013
  • electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:gup.ub.gu.se/186081
  • https://gup.ub.gu.se/publication/186081URI
  • https://doi.org/10.1186/1755-8794-6-41DOI
  • https://research.chalmers.se/publication/186081URI
  • http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:127933911URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • The majority of gastric cancer cases are believed to be caused by chronic infection with the bacterium Helicobacter pylori, and atrophic corpus gastritis is a predisposing condition to gastric cancer development. We aimed to increase understanding of the molecular details of atrophy by performing a global transcriptome analysis of stomach tissue. Biopsies from patients with different stages of H. pylori infection were taken from both the antrum and corpus mucosa and analyzed on microarrays. The stages included patients without current H. pylori infection, H. pylori-infected without corpus atrophy and patients with current or past H. pylori-infection with corpus-predominant atrophic gastritis. Using clustering and integrated analysis, we found firm evidence for antralization of the corpus mucosa of atrophy patients. This antralization harbored gain of gastrin expression, as well as loss of expression of corpus-related genes, such as genes associated with acid production, energy metabolism and blood clotting. The analyses provided detailed molecular evidence for simultaneous intestinal metaplasia (IM) and spasmolytic polypeptide expressing metaplasia (SPEM) in atrophic corpus tissue. Finally, acidic mammalian chitinase, a chitin-degrading enzyme produced by chief cells, was shown to be strongly down-regulated in corpus atrophy. Transcriptome analysis revealed several gene groups which are related to development of corpus atrophy, some of which were increased also in H. pylori-infected non-atrophic patients. Furthermore, loss of acidic chitinase expression is a promising marker for corpus atrophy.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Thorell, Kaisa,1983Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för mikrobiologi och immunologi,Institute of Biomedicine, Department of Microbiology and Immunology,University of Gothenburg,Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology(Swepub:cth)thorellk (författare)
  • Worah, Kuntal,1982Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för mikrobiologi och immunologi,Institute of Biomedicine, Department of Microbiology and Immunology,Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology,University of Gothenburg(Swepub:cth)worah (författare)
  • Wang, ShuguiKarolinska universitetssjukhuset,Karolinska University Hospital,National Cancer Centre, Singapore (författare)
  • Hibberd, Martin LloydGenome Institute of Singapore (författare)
  • Sjövall, Henrik,1954Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för invärtesmedicin och klinisk nutrition,Institute of Medicine, Department of Internal Medicine and Clinical Nutrition,University of Gothenburg(Swepub:gu)xsjovh (författare)
  • Pettersson, SvenKarolinska Institutet (författare)
  • Nielsen, Jens B,1962Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology(Swepub:cth)nielsenj (författare)
  • Lundin, Samuel B,1970Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för mikrobiologi och immunologi,Institute of Biomedicine, Department of Microbiology and Immunology,University of Gothenburg(Swepub:gu)xlusam (författare)
  • Chalmers tekniska högskolaInstitutionen för biomedicin, avdelningen för mikrobiologi och immunologi (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:BMC Medical Genomics: Springer Science and Business Media LLC6:411755-8794

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy