Sökning: onr:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/209743" >
Identification of c...
Identification of chondroitin sulfate linkage region glycopeptides reveals prohormones as a novel class of proteoglycans.
-
- Noborn, Fredrik (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för klinisk kemi och transfusionsmedicin,Institute of Biomedicine, Department of Clinical Chemistry and Transfusion Medicine
-
- Toledo, Alejandro Gomez (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för klinisk kemi och transfusionsmedicin,Institute of Biomedicine, Department of Clinical Chemistry and Transfusion Medicine
-
- Sihlbom, Carina, 1973 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Core Facilities, Proteomics,Core Facilities, Proteomics
-
visa fler...
-
- Lengqvist, Johan (författare)
- Karolinska Institutet,Gothenburg University,Göteborgs universitet,Core Facilities, Proteomics,Core Facilities, Proteomics
-
- Fries, Erik (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi
-
- Kjellen, Lena (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi
-
- Nilsson, Jonas, 1970 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för klinisk kemi och transfusionsmedicin,Institute of Biomedicine, Department of Clinical Chemistry and Transfusion Medicine
-
- Larson, Göran, 1953 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för klinisk kemi och transfusionsmedicin,Institute of Biomedicine, Department of Clinical Chemistry and Transfusion Medicine
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2015
- 2015
- Engelska.
-
Ingår i: Molecular & cellular proteomics : MCP. - 1535-9484 .- 1535-9476. ; 14:1, s. 41-9
- Relaterad länk:
-
https://gup.ub.gu.se...
-
visa fler...
-
https://doi.org/10.1...
-
http://kipublication...
-
https://urn.kb.se/re...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Vertebrates produce various chondroitin sulfate proteoglycans (CSPGs) that are important structural components of cartilage and other connective tissues. CSPGs also contribute to the regulation of more specialized processes such as neurogenesis and angiogenesis. Although many aspects of CSPGs have been studied extensively, little is known of where the CS chains are attached on the core proteins and so far, only a limited number of CSPGs have been identified. Obtaining global information on glycan structures and attachment sites would contribute to our understanding of the complex proteoglycan structures and may also assist in assigning CSPG specific functions. In the present work, we have developed a glycoproteomics approach that characterizes CS linkage regions, attachment sites, and identities of core proteins. CSPGs were enriched from human urine and cerebrospinal fluid samples by strong-anion-exchange chromatography, digested with chondroitinase ABC, a specific CS-lyase used to reduce the CS chain lengths and subsequently analyzed by nLC-MS/MS with a novel glycopeptide search algorithm. The protocol enabled the identification of 13 novel CSPGs, in addition to 13 previously established CSPGs, demonstrating that this approach can be routinely used to characterize CSPGs in complex human samples. Surprisingly, five of the identified CSPGs are traditionally defined as prohormones (cholecystokinin, chromogranin A, neuropeptide W, secretogranin-1, and secretogranin-3), typically stored and secreted from granules of endocrine cells. We hypothesized that the CS side chain may influence the assembly and structural organization of secretory granules and applied surface plasmon resonance spectroscopy to show that CS actually promotes the assembly of chromogranin A core proteins in vitro. This activity required mild acidic pH and suggests that the CS-side chains may also influence the self-assembly of chromogranin A in vivo giving a possible explanation to previous observations that chromogranin A has an inherent property to assemble in the acidic milieu of secretory granules.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Biokemi och molekylärbiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Biochemistry and Molecular Biology (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Klinisk laboratoriemedicin (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Clinical Laboratory Medicine (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Cell- och molekylärbiologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Cell and Molecular Biology (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Andra medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Other Basic Medicine (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinsk bioteknologi -- Medicinsk bioteknologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Medical Biotechnology -- Medical Biotechnology (hsv//eng)
Nyckelord
- proteoglycan
- mass spectrometry
- prohormone
- chromogranins
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Noborn, Fredrik
-
Toledo, Alejandr ...
-
Sihlbom, Carina, ...
-
Lengqvist, Johan
-
Fries, Erik
-
Kjellen, Lena
-
visa fler...
-
Nilsson, Jonas, ...
-
Larson, Göran, 1 ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Biokemi och mole ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Klinisk laborato ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Cell och molekyl ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Andra medicinska ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinsk biotek ...
-
och Medicinsk biotek ...
- Artiklar i publikationen
-
Molecular & cell ...
- Av lärosätet
-
Göteborgs universitet
-
Karolinska Institutet
-
Uppsala universitet