Sökning: onr:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/238966" >
Utilizing the Dog G...
Utilizing the Dog Genome in the Search for Novel Candidate Genes Involved in Glioma Development-Genome Wide Association Mapping followed by Targeted Massive Parallel Sequencing Identifies a Strongly Associated Locus
-
- Truvé, Katarina (författare)
- Swedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för medicinsk kemi och cellbiologi,Institute of Biomedicine, Department of Medical Biochemistry and Cell Biology,Institutionen för husdjursgenetik (HGEN),Department of Animal Breeding and Genetics,University of Gothenburg,Swedish Univ Agr Sci, Dept Anim Breeding & Genet, Uppsala, Sweden.;Univ Gothenburg, Sahlgrenska Acad, Bioinformat Core Facil, Gothenburg, Sweden.
-
- Dickinson, P. (författare)
- Univ Calif Davis, Sch Vet Med, Dept Surg & Radiol Sci, Davis, CA 95616 USA.
-
- Xiong, Anqi (författare)
- Uppsala universitet,Neuroonkologi
-
visa fler...
-
- York, D. (författare)
- Univ Calif Davis, Sch Vet Med, Dept Surg & Radiol Sci, Davis, CA 95616 USA.
-
- Jayashankar, K. (författare)
- Univ Calif Davis, Sch Vet Med, Dept Populat Hlth & Reprod, Davis, CA 95616 USA.
-
- Pielberg, Gerli (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi
-
- Koltookian, M. (författare)
- Broad Inst Harvard & Massachusetts Inst Technol M, Cambridge, MA USA.
-
- Murén, Eva (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi
-
- Fuxelius, Hans-Henrik (författare)
- Swedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för husdjursgenetik (HGEN),Department of Animal Breeding and Genetics,Swedish Univ Agr Sci, Dept Anim Breeding & Genet, Uppsala, Sweden.
-
- Weishaupt, Holger (författare)
- Uppsala universitet,Neuroonkologi
-
- Swartling, Fredrik J. (författare)
- Uppsala universitet,Neuroonkologi
-
- Andersson, Göran (författare)
- Swedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för husdjursgenetik (HGEN),Department of Animal Breeding and Genetics,Swedish Univ Agr Sci, Dept Anim Breeding & Genet, Uppsala, Sweden.
-
- Hedhammar, Åke (författare)
- Swedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för kliniska vetenskaper (KV),Department of Clinical Sciences,Swedish Univ Agr Sci, Dept Clin Sci, Uppsala, Sweden.
-
- Bongcam Rudloff, Erik (författare)
- Swedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för husdjursgenetik (HGEN),Department of Animal Breeding and Genetics,Swedish Univ Agr Sci, Dept Anim Breeding & Genet, Uppsala, Sweden.
-
- Forsberg-Nilsson, Karin (författare)
- Uppsala universitet,Neuroonkologi
-
- Bannasch, D. (författare)
- Univ Calif Davis, Sch Vet Med, Dept Populat Hlth & Reprod, Davis, CA 95616 USA.
-
- Lindblad-Toh, Kerstin (författare)
- Uppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi,Broad Inst Harvard & Massachusetts Inst Technol M, Cambridge, MA USA.
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
-
- 2016-05-12
- 2016
- Engelska.
-
Ingår i: Plos Genetics. - : Public Library of Science (PLoS). - 1553-7404 .- 1553-7390. ; 12:5
- Relaterad länk:
-
https://journals.plo...
-
visa fler...
-
https://uu.diva-port... (primary) (Raw object)
-
https://gup.ub.gu.se...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://res.slu.se/i...
-
https://urn.kb.se/re...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Gliomas are the most common form of malignant primary brain tumors in humans and second most common in dogs, occurring with similar frequencies in both species. Dogs are valuable spontaneous models of human complex diseases including cancers and may provide insight into disease susceptibility and oncogenesis. Several brachycephalic breeds such as Boxer, Bulldog and Boston Terrier have an elevated risk of developing glioma, but others, including Pug and Pekingese, are not at higher risk. To identify glioma-associated genetic susceptibility factors, an across-breed genome-wide association study (GWAS) was performed on 39 dog glioma cases and 141 controls from 25 dog breeds, identifying a genome-wide significant locus on canine chromosome (CFA) 26 (p = 2.8 x 10(-8)). Targeted re-sequencing of the 3.4 Mb candidate region was performed, followed by genotyping of the 56 SNVs that best fit the association pattern between the re-sequenced cases and controls. We identified three candidate genes that were highly associated with glioma susceptibility: CAMKK2, P2RX7 and DENR. CAMKK2 showed reduced expression in both canine and human brain tumors, and a non-synonymous variant in P2RX7, previously demonstrated to have a 50% decrease in receptor function, was also associated with disease. Thus, one or more of these genes appear to affect glioma susceptibility.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine (hsv//eng)
- LANTBRUKSVETENSKAPER -- Bioteknologi med applikationer på växter och djur -- Genetik och förädling inom lantbruksvetenskap (hsv//swe)
- AGRICULTURAL SCIENCES -- Agricultural Biotechnology -- Genetics and Breeding in Agricultural Sciences (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Genetik (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Genetics (hsv//eng)
Nyckelord
- central-nervous-system
- microglial activation
- p2x(7) receptor
- primary
- brain
- pdgfr-alpha
- tumors
- expression
- domestication
- model
- astrocytomas
- Genetics & Heredity
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Truvé, Katarina
-
Dickinson, P.
-
Xiong, Anqi
-
York, D.
-
Jayashankar, K.
-
Pielberg, Gerli
-
visa fler...
-
Koltookian, M.
-
Murén, Eva
-
Fuxelius, Hans-H ...
-
Weishaupt, Holge ...
-
Swartling, Fredr ...
-
Andersson, Göran
-
Hedhammar, Åke
-
Bongcam Rudloff, ...
-
Forsberg-Nilsson ...
-
Bannasch, D.
-
Lindblad-Toh, Ke ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
- LANTBRUKSVETENSKAPER
-
LANTBRUKSVETENSK ...
-
och Bioteknologi med ...
-
och Genetik och förä ...
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Genetik
- Artiklar i publikationen
-
Plos Genetics
- Av lärosätet
-
Göteborgs universitet
-
Sveriges Lantbruksuniversitet
-
Uppsala universitet