Sökning: onr:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/242395" >
Structural Insights...
Structural Insights into the Polyphyletic Origins of Glycyl tRNA Synthetases
-
Valencia-Sanchez, M. I. (författare)
-
Rodriguez-Hernandez, A. (författare)
-
- Ferreira, Ruben, 1982 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kemi och molekylärbiologi,Department of Chemistry and Molecular Biology,University of Gothenburg
-
visa fler...
-
Santamaria-Suarez, H. A. (författare)
-
Arciniega, M. (författare)
-
Dock-Bregeon, A. C. (författare)
-
Moras, D. (författare)
-
Beinsteiner, B. (författare)
-
Mertens, H. (författare)
-
Svergun, D. (författare)
-
Brieba, L. G. (författare)
-
- Grøtli, Morten, 1966 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kemi och molekylärbiologi,Department of Chemistry and Molecular Biology,University of Gothenburg
-
Torres-Larios, A. (författare)
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2016
- 2016
- Engelska.
-
Ingår i: Journal of Biological Chemistry. - 0021-9258 .- 1083-351X. ; 291:28, s. 14430-14446
- Relaterad länk:
-
http://dx.doi.org/10...
-
visa fler...
-
https://gup.ub.gu.se...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://research.cha...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Glycyl tRNA synthetase (GlyRS) provides a unique case among class II aminoacyl tRNA synthetases, with two clearly widespread types of enzymes: a dimeric ((2)) species present in some bacteria, archaea, and eukaryotes; and a heterotetrameric form ((22)) present in most bacteria. Although the differences between both types of GlyRS at the anticodon binding domain level are evident, the extent and implications of the variations in the catalytic domain have not been described, and it is unclear whether the mechanism of amino acid recognition is also dissimilar. Here, we show that the -subunit of the (22) GlyRS from the bacterium Aquifex aeolicus is able to perform the first step of the aminoacylation reaction, which involves the activation of the amino acid with ATP. The crystal structure of the -subunit in the complex with an analog of glycyl adenylate at 2.8 angstrom resolution presents a conformational arrangement that properly positions the cognate amino acid. This work shows that glycine is recognized by a subset of different residues in the two types of GlyRS. A structural and sequence analysis of class II catalytic domains shows that bacterial GlyRS is closely related to alanyl tRNA synthetase, which led us to define a new subclassification of these ancient enzymes and to propose an evolutionary path of (22) GlyRS, convergent with (2) GlyRS and divergent from AlaRS, thus providing a possible explanation for the puzzling existence of two proteins sharing the same fold and function but not a common ancestor.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Cell- och molekylärbiologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Cell and Molecular Biology (hsv//eng)
Nyckelord
- aminoacyl tRNA synthetase
- crystal structure
- molecular evolution
- structure-function
- substrate
- horizontal gene-transfer
- ribonucleic-acid synthetase
- escherichia-coli
- thermus-thermophilus
- sequence alignment
- protein structures
- crystal-structure
- acceptor-stem
- alpha-subunit
- beta-subunit
- protein structures
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Valencia-Sanchez ...
-
Rodriguez-Hernan ...
-
Ferreira, Ruben, ...
-
Santamaria-Suare ...
-
Arciniega, M.
-
Dock-Bregeon, A. ...
-
visa fler...
-
Moras, D.
-
Beinsteiner, B.
-
Mertens, H.
-
Svergun, D.
-
Brieba, L. G.
-
Grøtli, Morten, ...
-
Torres-Larios, A ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Cell och molekyl ...
- Artiklar i publikationen
-
Journal of Biolo ...
- Av lärosätet
-
Göteborgs universitet
-
Chalmers tekniska högskola