Sökning: onr:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/265618" >
The neuroendocrine ...
The neuroendocrine phenotype, genomic profile and therapeutic sensitivity of GEPNET cell lines
-
- Hofving, Tobias, 1989 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Sahlgrenska Cancer Center,Institutionen för biomedicin, avdelningen för patologi,Institute of Biomedicine, Department of Pathology
-
- Arvidsson, Yvonne, 1960 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för patologi,Sahlgrenska Cancer Center,Institute of Biomedicine, Department of Pathology
-
- Almobarak, Bilal (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för patologi,Sahlgrenska Cancer Center,Institute of Biomedicine, Department of Pathology
-
visa fler...
-
- Inge, Linda (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Sahlgrenska Cancer Center,Institutionen för biomedicin, avdelningen för patologi,Institute of Biomedicine, Department of Pathology
-
Pfragner, R. (författare)
-
- Persson, Marta, 1979 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för patologi,Sahlgrenska Cancer Center,Institute of Biomedicine, Department of Pathology
-
- Stenman, Göran, 1953 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för patologi,Sahlgrenska Cancer Center,Institute of Biomedicine, Department of Pathology
-
- Kristiansson, Erik, 1978 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för matematiska vetenskaper,Department of Mathematical Sciences
-
- Johanson, Viktor, 1958 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kliniska vetenskaper, Avdelningen för kirurgi,Institute of Clinical Sciences, Department of Surgery
-
- Nilsson, Ola, 1957 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för patologi,Sahlgrenska Cancer Center,Institute of Biomedicine, Department of Pathology
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- Bioscientifica, 2018
- 2018
- Engelska.
-
Ingår i: Endocrine-Related Cancer. - : Bioscientifica. - 1351-0088 .- 1479-6821. ; 25:3, s. 367-380
- Relaterad länk:
-
https://erc.bioscien...
-
visa fler...
-
https://gup.ub.gu.se...
-
https://doi.org/10.1...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Experimental models of neuroendocrine tumour disease are scarce, and no comprehensive characterisation of existing gastroenteropancreatic neuroendocrine tumour (GEPNET) cell lines has been reported. In this study, we aimed to define the molecular characteristics and therapeutic sensitivity of these cell lines. We therefore performed immunophenotyping, copy number profiling, whole-exome sequencing and a large-scale inhibitor screening of seven GEPNET cell lines. Four cell lines, GOT1, P-STS, BON-1 and QGP-1, displayed a neuroendocrine phenotype while three others, KRJ-I, L-STS and H-STS, did not. Instead, these three cell lines were identified as lymphoblastoid. Characterisation of remaining authentic GEPNET cell lines by copy number profiling showed that GOT1, among other chromosomal alterations, harboured losses on chromosome 18 encompassing the SMAD4 gene, while P-STS had a loss on 11q. BON-1 had a homozygous loss of CDKN2A and CDKN2B, and QGP-1 harboured amplifications of MDM2 and HMGA2. Whole-exome sequencing revealed both disease-characteristic mutations (e.g. ATRX mutation in QGP-1) and, for patient tumours, rare genetic events (e.g. TP53 mutation in P-STS, BON-1 and QGP-1). A large-scale inhibitor screening showed that cell lines from pancreatic NETs to a greater extent, when compared to small intestinal NETs, were sensitive to inhibitors of MEK. Similarly, neuroendocrine NET cells originating from the small intestine were considerably more sensitive to a group of HDAC inhibitors. Taken together, our results provide a comprehensive characterisation of GEPNET cell lines, demonstrate their relevance as neuroendocrine tumour models and explore their therapeutic sensitivity to a broad range of inhibitors.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Endokrinologi och diabetes (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Endocrinology and Diabetes (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)
Nyckelord
- neuroendocrine tumour
- GEPNET
- immunophenotyping
- copy number alterations
- exome
- nude-mice
- ileal carcinoids
- gene-expression
- sequencing data
- valproic
- acid
- mtor pathway
- tumor-cells
- establishment
- cancer
- landscape
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Hofving, Tobias, ...
-
Arvidsson, Yvonn ...
-
Almobarak, Bilal
-
Inge, Linda
-
Pfragner, R.
-
Persson, Marta, ...
-
visa fler...
-
Stenman, Göran, ...
-
Kristiansson, Er ...
-
Johanson, Viktor ...
-
Nilsson, Ola, 19 ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Endokrinologi oc ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Cancer och onkol ...
- Artiklar i publikationen
-
Endocrine-Relate ...
- Av lärosätet
-
Göteborgs universitet