SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/293969"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/293969" > The ancillary N-ter...

LIBRIS Formathandbok  (Information om MARC21)
FältnamnIndikatorerMetadata
00003462naa a2200385 4500
001oai:gup.ub.gu.se/293969
003SwePub
008240528s2020 | |||||||||||000 ||eng|
024a https://gup.ub.gu.se/publication/2939692 URI
024a https://doi.org/10.1093/NAR/GKAA3162 DOI
040 a (SwePub)gu
041 a eng
042 9 SwePub
072 7a ref2 swepub-contenttype
072 7a art2 swepub-publicationtype
100a Maciaszczyk-Dziubinska, Ewa4 aut
2451 0a The ancillary N-terminal region of the yeast AP-1 transcription factor Yap8 contributes to its DNA binding specificity.
264 1c 2020
520 a Activator protein 1 (AP-1) is one of the largest families of basic leucine zipper (bZIP) transcription factors in eukaryotic cells. How AP-1 proteins achieve target DNA binding specificity remains elusive. In Saccharomyces cerevisiae, the AP-1-like protein (Yap) family comprises eight members (Yap1 to Yap8) that display distinct genomic target sites despite high sequence homology of their DNA binding bZIP domains. In contrast to the other members of the Yap family, which preferentially bind to short (7-8 bp) DNA motifs, Yap8 binds to an unusually long DNA motif (13 bp). It has been unclear what determines this unique specificity of Yap8. In this work, we use molecular and biochemical analyses combined with computer-based structural design and molecular dynamics simulations of Yap8-DNA interactions to better understand the structural basis of DNA binding specificity determinants. We identify specific residues in the N-terminal tail preceding the basic region, which define stable association of Yap8 with its target promoter. We propose that the N-terminal tail directly interacts with DNA and stabilizes Yap8 binding to the 13 bp motif. Thus, beside the core basic region, the adjacent N-terminal region contributes to alternative DNA binding selectivity within the AP-1 family.
650 7a NATURVETENSKAPx Biologix Mikrobiologi0 (SwePub)106062 hsv//swe
650 7a NATURAL SCIENCESx Biological Sciencesx Microbiology0 (SwePub)106062 hsv//eng
650 7a NATURVETENSKAPx Kemix Fysikalisk kemi0 (SwePub)104022 hsv//swe
650 7a NATURAL SCIENCESx Chemical Sciencesx Physical Chemistry0 (SwePub)104022 hsv//eng
650 7a NATURVETENSKAPx Biologix Biokemi och molekylärbiologi0 (SwePub)106022 hsv//swe
650 7a NATURAL SCIENCESx Biological Sciencesx Biochemistry and Molecular Biology0 (SwePub)106022 hsv//eng
700a Reymer, Anna,d 1983u Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kemi och molekylärbiologi,Department of Chemistry and Molecular Biology4 aut0 (Swepub:gu)xreyan
700a Kumar, Nallani Vijayu Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kemi och molekylärbiologi,Department of Chemistry and Molecular Biology4 aut
700a Białek, Wojciech4 aut
700a Mizio, Katarzyna4 aut
700a Tamás, Markus J.,d 1970u Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kemi och molekylärbiologi,Department of Chemistry and Molecular Biology4 aut0 (Swepub:gu)xtamma
700a Wysocki, Robert4 aut
710a Göteborgs universitetb Institutionen för kemi och molekylärbiologi4 org
773t Nucleic acids researchg 48:10, s. 5426-5441q 48:10<5426-5441x 1362-4962
8564 8u https://gup.ub.gu.se/publication/293969
8564 8u https://doi.org/10.1093/NAR/GKAA316

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Sök utanför SwePub

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy