Sökning: onr:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/307093" >
CAFE: a software su...
CAFE: a software suite for analysis of paired-sample transposon insertion sequencing data
-
- Abramova, Anna, 1990 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar,CARe - Centrum för antibiotikaresistensforskning,Institute of Biomedicine, Department of Infectious Medicine,Centre for antibiotic resistance research, CARe
-
- Osinska, Adriana (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,CARe - Centrum för antibiotikaresistensforskning,Institutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar,Centre for antibiotic resistance research, CARe,Institute of Biomedicine, Department of Infectious Medicine
-
- Kunche, Haveela (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,CARe - Centrum för antibiotikaresistensforskning,Institutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar,Centre for antibiotic resistance research, CARe,Institute of Biomedicine, Department of Infectious Medicine
-
visa fler...
-
- Burman, Emil (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,CARe - Centrum för antibiotikaresistensforskning,Institutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar,Centre for antibiotic resistance research, CARe,Institute of Biomedicine, Department of Infectious Medicine
-
- Bengtsson-Palme, Johan, 1985 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,CARe - Centrum för antibiotikaresistensforskning,Institutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar,Centre for antibiotic resistance research, CARe,Institute of Biomedicine, Department of Infectious Medicine
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2021-01-04
- 2021
- Engelska.
-
Ingår i: Bioinformatics. - : Oxford University Press (OUP). - 1367-4803 .- 1460-2059. ; 37:1, s. 121-122
- Relaterad länk:
-
https://academic.oup...
-
visa fler...
-
https://gup.ub.gu.se...
-
https://doi.org/10.1...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Sequencing of transposon insertion libraries is used to determine the relative fitness of individual mutants at a large scale. However, there is a lack of tools for specifically analyzing data from such experiments with paired sample designs. Here, we introduce CAFE-Coefficient-based Analysis of Fitness by read Enrichment-a software package that can analyze data from paired transposon mutant sequencing experiments, generate fitness coefficients for each gene and condition and perform appropriate statistical testing on these fitness coefficients.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Biokemi och molekylärbiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Biochemistry and Molecular Biology (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Matematik (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Mathematics (hsv//eng)
Nyckelord
- Biochemistry & Molecular Biology
- Biotechnology & Applied Microbiology
- Computer Science
- Mathematical & Computational Biology
- Mathematics
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas