Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:44ab7865-4c9d-405f-acb1-0fe274fd23b5" >
Improved chromosome...
Improved chromosome-level genome assembly of the Glanville fritillary butterfly (Melitaea cinxia) integrating Pacific Biosciences long reads and a high-density linkage map
-
- Smolander, Olli Pekka (författare)
- Tallinn University of Technology,University of Helsinki
-
- Blande, Daniel (författare)
- University of Helsinki
-
- Ahola, Virpi (författare)
- Karolinska Institute,University of Helsinki
-
visa fler...
-
- Rastas, Pasi (författare)
- University of Helsinki
-
- Tanskanen, Jaakko (författare)
- Natural Resources Institute Finland (Luke)
-
- Kammonen, Juhana I. (författare)
- University of Helsinki
-
- Oostra, Vicencio (författare)
- University of Liverpool,University of Helsinki
-
- Pellegrini, Lorenzo (författare)
- University of Helsinki,University of Warwick
-
- Ikonen, Suvi (författare)
- University of Helsinki
-
- Dallas, Tad (författare)
- Louisiana State University
-
- Dileo, Michelle F. (författare)
- University of Helsinki
-
- Duplouy, Anne (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Biodiversitet,Biologiska institutionen,Naturvetenskapliga fakulteten,Biodiversity,Department of Biology,Faculty of Science,University of Helsinki
-
- Duru, Ilhan Cem (författare)
- University of Helsinki
-
- Halimaa, Pauliina (författare)
- University of Eastern Finland
-
- Kahilainen, Aapo (författare)
- University of Helsinki
-
- Kuwar, Suyog S. (författare)
- Florida Museum Natural History
-
- Kärenlampi, Sirpa O. (författare)
- University of Eastern Finland
-
- Lafuente, Elvira (författare)
- Eawag: Swiss Federal Institute of Aquatic Science and Technology
-
- Luo, Shiqi (författare)
- China Agricultural University
-
- Makkonen, Jenny (författare)
- University of Eastern Finland
-
- Nair, Abhilash (författare)
- University of Helsinki
-
- Celorio-Mancera, Maria de la Paz, 1978- (författare)
- Stockholms universitet,Stockholm University,Zoologiska institutionen
-
- Pennanen, Ville (författare)
- University of Helsinki
-
- Ruokolainen, Annukka (författare)
- University of Helsinki
-
- Sundell, Tarja (författare)
- University of Helsinki
-
- Tervahauta, Arja I. (författare)
- University of Eastern Finland
-
- Twort, Victoria (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Biodiversitet,Biologiska institutionen,Naturvetenskapliga fakulteten,Systematisk biologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Biodiversity,Department of Biology,Faculty of Science,Systematic Biology Group,Lund University Research Groups,Finnish Museum of Natural History
-
- Van Bergen, Erik (författare)
- University of Helsinki
-
- Österman-Udd, Janina (författare)
- University of Helsinki
-
- Paulin, Lars (författare)
- University of Helsinki
-
- Frilander, Mikko J. (författare)
- University of Helsinki
-
- Auvinen, Petri (författare)
- University of Helsinki
-
- Saastamoinen, Marjo (författare)
- University of Helsinki
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2022-01-12
- 2022
- Engelska.
-
Ingår i: GigaScience. - : Oxford University Press (OUP). - 2047-217X. ; 11
- Relaterad länk:
-
http://dx.doi.org/10... (free)
-
visa fler...
-
https://academic.oup...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://lup.lub.lu.s...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://urn.kb.se/re...
-
http://kipublication...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Background: The Glanville fritillary (Melitaea cinxia) butterfly is a model system for metapopulation dynamics research in fragmented landscapes. Here, we provide a chromosome-level assembly of the butterfly's genome produced from Pacific Biosciences sequencing of a pool of males, combined with a linkage map from population crosses. Results: The final assembly size of 484 Mb is an increase of 94 Mb on the previously published genome. Estimation of the completeness of the genome with BUSCO indicates that the genome contains 92-94% of the BUSCO genes in complete and single copies. We predicted 14,810 genes using the MAKER pipeline and manually curated 1,232 of these gene models. Conclusions: The genome and its annotated gene models are a valuable resource for future comparative genomics, molecular biology, transcriptome, and genetics studies on this species.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Genetik (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Genetics (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Evolutionsbiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Evolutionary Biology (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences (hsv//eng)
Nyckelord
- genome
- Glanville fritillary
- Melitaea cinxia
- spatial ecology
- Melitaea cinxia
Publikations- och innehållstyp
- art (ämneskategori)
- ref (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Smolander, Olli ...
-
Blande, Daniel
-
Ahola, Virpi
-
Rastas, Pasi
-
Tanskanen, Jaakk ...
-
Kammonen, Juhana ...
-
visa fler...
-
Oostra, Vicencio
-
Pellegrini, Lore ...
-
Ikonen, Suvi
-
Dallas, Tad
-
Dileo, Michelle ...
-
Duplouy, Anne
-
Duru, Ilhan Cem
-
Halimaa, Pauliin ...
-
Kahilainen, Aapo
-
Kuwar, Suyog S.
-
Kärenlampi, Sirp ...
-
Lafuente, Elvira
-
Luo, Shiqi
-
Makkonen, Jenny
-
Nair, Abhilash
-
Celorio-Mancera, ...
-
Pennanen, Ville
-
Ruokolainen, Ann ...
-
Sundell, Tarja
-
Tervahauta, Arja ...
-
Twort, Victoria
-
Van Bergen, Erik
-
Österman-Udd, Ja ...
-
Paulin, Lars
-
Frilander, Mikko ...
-
Auvinen, Petri
-
Saastamoinen, Ma ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Genetik
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Evolutionsbiolog ...
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
- Artiklar i publikationen
-
GigaScience
- Av lärosätet
-
Lunds universitet
-
Stockholms universitet
-
Karolinska Institutet