Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:47fe6723-9008-48ca-8680-9784606b4b6b" >
Clinical framework ...
Clinical framework for next generation sequencing based analysis of treatment predictive mutations and multiplexed gene fusion detection in non-small cell lung cancer
-
- Lindquist, Kajsa Ericson (författare)
- Regional Laboratories Region Skåne
-
- Karlsson, Anna (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine
-
- Levéen, Per (författare)
- Regional Laboratories Region Skåne
-
visa fler...
-
- Brunnström, Hans (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Tumörmikromiljö,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Tumor microenvironment,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Regional Laboratories Region Skåne
-
- Reuterswärd, Christel (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Forskningsgrupp Lungcancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Research Group Lung Cancer,Lund University Research Groups
-
- Holm, Karolina (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine
-
- Jönsson, Mats (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Forskningsgrupp Lungcancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Research Group Lung Cancer,Lund University Research Groups
-
- Annersten, Karin (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine
-
- Rosengren, Frida (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine
-
- Jirström, Karin (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Tumörmikromiljö,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Personlig patologi och cancerbehandling,Forskargrupper vid Lunds universitet,Tumor microenvironment,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Personalized Pathology & Cancer Therapy,Lund University Research Groups,Regional Laboratories Region Skåne
-
- Kosieradzki, Jaroslaw (författare)
- Skåne University Hospital
-
- Ek, Lars (författare)
- Skåne University Hospital
-
- Borg, Åke (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Create Health,Annan verksamhet, LTH,Lunds Tekniska Högskola,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Other operations, LTH,Faculty of Engineering, LTH,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine
-
- Planck, Maria (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Forskningsgrupp Lungcancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Research Group Lung Cancer,Lund University Research Groups,Skåne University Hospital
-
- Jönsson, Göran (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Create Health,Annan verksamhet, LTH,Lunds Tekniska Högskola,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Other operations, LTH,Faculty of Engineering, LTH,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine
-
- Staaf, Johan (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Create Health,Annan verksamhet, LTH,Lunds Tekniska Högskola,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Forskningsgrupp Lungcancer,Forskargrupper vid Lunds universitet,Other operations, LTH,Faculty of Engineering, LTH,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Research Group Lung Cancer,Lund University Research Groups
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2017-03-16
- 2017
- Engelska 15 s.
-
Ingår i: Oncotarget. - : Impact Journals, LLC. - 1949-2553. ; 8:21, s. 34796-34810
- Relaterad länk:
-
http://dx.doi.org/10... (free)
-
visa fler...
-
http://www.oncotarge...
-
https://lup.lub.lu.s...
-
https://doi.org/10.1...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Precision medicine requires accurate multi-gene clinical diagnostics. We describe the implementation of an Illumina TruSight Tumor (TST) clinical NGS diagnostic framework and parallel validation of a NanoString RNA-based ALK, RET, and ROS1 gene fusion assay for combined analysis of treatment predictive alterations in non-small cell lung cancer (NSCLC) in a regional healthcare region of Sweden (Scandinavia). The TST panel was clinically validated in 81 tumors (99% hotspot mutation concordance), after which 533 consecutive NSCLCs were collected during one-year of routine clinical analysis in the healthcare region (~90% advanced stage patients). The NanoString assay was evaluated in 169 of 533 cases. In the 533-sample cohort 79% had 1-2 variants, 12% >2 variants and 9% no detected variants. Ten gene fusions (five ALK, three RET, two ROS1) were detected in 135 successfully analyzed cases (80% analysis success rate). No ALK or ROS1 FISH fusion positive case was missed by the NanoString assay. Stratification of the 533-sample cohort based on actionable alterations in 11 oncogenes revealed that 66% of adenocarcinomas, 13% of squamous carcinoma (SqCC) and 56% of NSCLC not otherwise specified harbored ≥1 alteration. In adenocarcinoma, 10.6% of patients (50.3% if including KRAS) could potentially be eligible for emerging therapeutics, in addition to the 15.3% of patients eligible for standard EGFR or ALK inhibitors. For squamous carcinoma corresponding proportions were 4.4% (11.1% with KRAS) vs 2.2%. In conclusion, multiplexed NGS and gene fusion analyses are feasible in NSCLC for clinical diagnostics, identifying notable proportions of patients potentially eligible for emerging molecular therapeutics.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- art (ämneskategori)
- ref (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Lindquist, Kajsa ...
-
Karlsson, Anna
-
Levéen, Per
-
Brunnström, Hans
-
Reuterswärd, Chr ...
-
Holm, Karolina
-
visa fler...
-
Jönsson, Mats
-
Annersten, Karin
-
Rosengren, Frida
-
Jirström, Karin
-
Kosieradzki, Jar ...
-
Ek, Lars
-
Borg, Åke
-
Planck, Maria
-
Jönsson, Göran
-
Staaf, Johan
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Cancer och onkol ...
- Artiklar i publikationen
-
Oncotarget
- Av lärosätet
-
Lunds universitet