Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:4dc9c2a9-6488-4464-abd3-0aa02cdc253b" >
Bacteriophage strai...
Bacteriophage strain typing by rapid single molecule analysis.
-
- Grunwald, Assaf (författare)
- Tel-Aviv University,Tel Aviv University
-
- Dahan, Moran (författare)
- Tel-Aviv University,Tel Aviv University
-
- Giesbertz, Anna (författare)
- RWTH Aachen University,Rheinisch-Westfaelische Technische Hochschule Aachen
-
visa fler...
-
- Nilsson, Adam (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Atomfysik,Fysiska institutionen,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Atomic Physics,Department of Physics,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH
-
- Nyberg, Lena, 1979 (författare)
- Chalmers University of Technology,Chalmers tekniska högskola
-
- Weinhold, Elmar (författare)
- RWTH Aachen University,Rheinisch-Westfaelische Technische Hochschule Aachen
-
- Ambjörnsson, Tobias (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Beräkningsbiologi och biologisk fysik - Genomgår omorganisation,Institutionen för astronomi och teoretisk fysik - Genomgår omorganisation,Naturvetenskapliga fakulteten,Computational Biology and Biological Physics - Undergoing reorganization,Department of Astronomy and Theoretical Physics - Undergoing reorganization,Faculty of Science
-
- Westerlund, Fredrik, 1978 (författare)
- Chalmers University of Technology,Chalmers tekniska högskola
-
- Ebenstein, Yuval (författare)
- Tel-Aviv University,Tel Aviv University
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2015-05-27
- 2015
- Engelska.
-
Ingår i: Nucleic Acids Research. - : Oxford University Press (OUP). - 1362-4962 .- 0305-1048. ; 43:18, s. 117-117
- Relaterad länk:
-
http://dx.doi.org/10... (free)
-
visa fler...
-
https://academic.oup...
-
http://publications.... (primary) (free)
-
https://lup.lub.lu.s...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://research.cha...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Rapid characterization of unknown biological samples is under the focus of many current studies. Here we report a method for screening of biological samples by optical mapping of their DNA. We use a novel, one-step chemo-enzymatic reaction to covalently bind fluorophores to DNA at the four-base recognition sites of a DNA methyltransferase. Due to the diffraction limit of light, the dense distribution of labels results in a continuous fluorescent signal along the DNA. The amplitude modulations (AM) of the fluorescence intensity along the stretched DNA molecules exhibit a unique molecular fingerprint that can be used for identification. We show that this labelling scheme is highly informative, allowing accurate genotyping. We demonstrate the method by labelling the genomes of λ and T7 bacteriophages, resulting in a consistent, unique AM profile for each genome. These profiles are also successfully used for identification of the phages from a background phage library. Our method may provide a facile route for screening and typing of various organisms and has potential applications in metagenomics studies of various ecosystems.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Biofysik (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Biophysics (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Fysik -- Annan fysik (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Physical Sciences -- Other Physics Topics (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Biokemi och molekylärbiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Biochemistry and Molecular Biology (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- art (ämneskategori)
- ref (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Grunwald, Assaf
-
Dahan, Moran
-
Giesbertz, Anna
-
Nilsson, Adam
-
Nyberg, Lena, 19 ...
-
Weinhold, Elmar
-
visa fler...
-
Ambjörnsson, Tob ...
-
Westerlund, Fred ...
-
Ebenstein, Yuval
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Biofysik
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Fysik
-
och Annan fysik
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Biokemi och mole ...
- Artiklar i publikationen
-
Nucleic Acids Re ...
- Av lärosätet
-
Lunds universitet
-
Chalmers tekniska högskola