Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:500b1e69-ddff-4e31-a216-89678fa416cc" >
Escape from nonsens...
Escape from nonsense-mediated decay associates with anti-tumor immunogenicity
-
- Litchfield, Kevin (författare)
- Francis Crick Institute,University College London
-
- Reading, James L. (författare)
- University College London
-
- Lim, Emilia L. (författare)
- Francis Crick Institute
-
visa fler...
-
- Xu, Hang (författare)
- Francis Crick Institute
-
- Liu, Po (författare)
- Francis Crick Institute
-
- Al-Bakir, Maise (författare)
- Francis Crick Institute
-
- Wong, Yien Ning Sophia (författare)
- University College London
-
- Rowan, Andrew (författare)
- Francis Crick Institute
-
- Funt, Samuel A. (författare)
- Cornell University
-
- Merghoub, Taha (författare)
- Cornell University
-
- Perkins, David (författare)
- Francis Crick Institute
-
- Lauss, Martin (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Melanoma Genomics,Forskargrupper vid Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Lund University Research Groups,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments
-
- Svane, Inge Marie (författare)
- Herlev Hospital
-
- Jönsson, Göran (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Melanoma Genomics,Forskargrupper vid Lunds universitet,LUCC: Lunds universitets cancercentrum,Övriga starka forskningsmiljöer,Lund University Research Groups,LUCC: Lund University Cancer Centre,Other Strong Research Environments
-
- Herrero, Javier (författare)
- University College London
-
- Larkin, James (författare)
- Royal Marsden Hospital, London
-
- Quezada, Sergio A. (författare)
- University College London
-
- Hellmann, Matthew D. (författare)
- Memorial Sloan-Kettering Cancer Center,Cornell University
-
- Turajlic, Samra (författare)
- Royal Marsden Hospital, London,Francis Crick Institute
-
- Swanton, Charles (författare)
- University College London,Francis Crick Institute
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2020-07-30
- 2020
- Engelska.
-
Ingår i: Nature Communications. - : Springer Science and Business Media LLC. - 2041-1723. ; 11:1
- Relaterad länk:
-
http://dx.doi.org/10... (free)
-
visa fler...
-
https://www.nature.c...
-
https://lup.lub.lu.s...
-
https://doi.org/10.1...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Frameshift insertion/deletions (fs-indels) are an infrequent but highly immunogenic mutation subtype. Although fs-indels are degraded through the nonsense-mediated decay (NMD) pathway, we hypothesise that some fs-indels escape degradation and elicit anti-tumor immune responses. Using allele-specific expression analysis, expressed fs-indels are enriched in genomic positions predicted to escape NMD, and associated with higher protein expression, consistent with degradation escape (NMD-escape). Across four independent melanoma cohorts, NMD-escape mutations are significantly associated with clinical-benefit to checkpoint inhibitor (CPI) therapy (Pmeta = 0.0039). NMD-escape mutations are additionally found to associate with clinical-benefit in the low-TMB setting. Furthermore, in an adoptive cell therapy treated melanoma cohort, NMD-escape mutation count is the most significant biomarker associated with clinical-benefit. Analysis of functional T cell reactivity screens from personalized vaccine studies shows direct evidence of fs-indel derived neoantigens eliciting immune response, particularly those with highly elongated neo open reading frames. NMD-escape fs-indels represent an attractive target for biomarker optimisation and immunotherapy design.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- art (ämneskategori)
- ref (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Litchfield, Kevi ...
-
Reading, James L ...
-
Lim, Emilia L.
-
Xu, Hang
-
Liu, Po
-
Al-Bakir, Maise
-
visa fler...
-
Wong, Yien Ning ...
-
Rowan, Andrew
-
Funt, Samuel A.
-
Merghoub, Taha
-
Perkins, David
-
Lauss, Martin
-
Svane, Inge Mari ...
-
Jönsson, Göran
-
Herrero, Javier
-
Larkin, James
-
Quezada, Sergio ...
-
Hellmann, Matthe ...
-
Turajlic, Samra
-
Swanton, Charles
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Cancer och onkol ...
- Artiklar i publikationen
-
Nature Communica ...
- Av lärosätet
-
Lunds universitet