Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:72afdccf-8ed2-422b-a5d0-34b3c146db47" >
A quantitative prot...
A quantitative proteomics approach identifies ETV6 and IKZF1 as new regulators of an ERG-driven transcriptional network
-
- Unnikrishnan, Ashwin (författare)
- University of New South Wales
-
Guan, Yi F (författare)
-
Huang, Yizhou (författare)
-
visa fler...
-
- Beck, Dominik (författare)
- University of Technology Sydney
-
Thoms, Julie A I (författare)
-
- Peirs, Sofie (författare)
- Ghent University
-
Knezevic, Kathy (författare)
-
Ma, Shiyong (författare)
-
de Walle, Inge V (författare)
-
- de Jong, Ineke (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för molekylärmedicin och genterapi,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Stamcellscentrum (SCC),Avdelningen för stamcellsforskning,Division of Molecular Medicine and Gene Therapy,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Stem Cell Center,Division of stem cell research
-
- Ali, Zara (författare)
- Children's Cancer Institute Australia for Medical Research
-
- Zhong, Ling (författare)
- University of New South Wales
-
Raftery, Mark J (författare)
-
Taghon, Tom (författare)
-
- Larsson, Jonas (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för molekylärmedicin och genterapi,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Stamcellscentrum (SCC),Avdelningen för stamcellsforskning,Division of Molecular Medicine and Gene Therapy,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine,Stem Cell Center,Division of stem cell research
-
MacKenzie, Karen L (författare)
-
Van Vlierberghe, Pieter (författare)
-
Wong, Jason W H (författare)
-
- Pimanda, John E (författare)
- Prince of Wales Hospital
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2016-09-06
- 2016
- Engelska.
-
Ingår i: Nucleic Acids Research. - : Oxford University Press (OUP). - 1362-4962 .- 0305-1048. ; 44:22, s. 10644-10661
- Relaterad länk:
-
http://dx.doi.org/10... (free)
-
visa fler...
-
https://academic.oup...
-
https://lup.lub.lu.s...
-
https://doi.org/10.1...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Aberrant stem cell-like gene regulatory networks are a feature of leukaemogenesis. The ETS-related gene (ERG), an important regulator of normal haematopoiesis, is also highly expressed in T-ALL and acute myeloid leukaemia (AML). However, the transcriptional regulation of ERG in leukaemic cells remains poorly understood. In order to discover transcriptional regulators of ERG, we employed a quantitative mass spectrometry-based method to identify factors binding the 321 bp ERG +85 stem cell enhancer region in MOLT-4 T-ALL and KG-1 AML cells. Using this approach, we identified a number of known binders of the +85 enhancer in leukaemic cells along with previously unknown binders, including ETV6 and IKZF1. We confirmed that ETV6 and IKZF1 were also bound at the +85 enhancer in both leukaemic cells and in healthy human CD34+ haematopoietic stem and progenitor cells. Knockdown experiments confirmed that ETV6 and IKZF1 are transcriptional regulators not just of ERG, but also of a number of genes regulated by a densely interconnected network of seven transcription factors. At last, we show that ETV6 and IKZF1 expression levels are positively correlated with expression of a number of heptad genes in AML and high expression of all nine genes confers poorer overall prognosis.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Medicinsk genetik (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Medical Genetics (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Mikrobiologi inom det medicinska området (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Microbiology in the medical area (hsv//eng)
Nyckelord
- Base Sequence
- Binding Sites
- Cell Line, Tumor
- Consensus Sequence
- Enhancer Elements, Genetic
- Gene Expression Regulation, Leukemic
- Gene Regulatory Networks
- Humans
- Ikaros Transcription Factor/physiology
- Kaplan-Meier Estimate
- Leukemia, Myeloid, Acute/genetics
- Prognosis
- Proportional Hazards Models
- Protein Binding
- Proteome
- Proteomics
- Proto-Oncogene Proteins c-ets/physiology
- Repressor Proteins/physiology
- Transcription, Genetic
- Transcriptional Regulator ERG/physiology
Publikations- och innehållstyp
- art (ämneskategori)
- ref (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Unnikrishnan, As ...
-
Guan, Yi F
-
Huang, Yizhou
-
Beck, Dominik
-
Thoms, Julie A I
-
Peirs, Sofie
-
visa fler...
-
Knezevic, Kathy
-
Ma, Shiyong
-
de Walle, Inge V
-
de Jong, Ineke
-
Ali, Zara
-
Zhong, Ling
-
Raftery, Mark J
-
Taghon, Tom
-
Larsson, Jonas
-
MacKenzie, Karen ...
-
Van Vlierberghe, ...
-
Wong, Jason W H
-
Pimanda, John E
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Medicinsk geneti ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Mikrobiologi ino ...
- Artiklar i publikationen
-
Nucleic Acids Re ...
- Av lärosätet
-
Lunds universitet