Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:8d3dbce1-5605-4564-a819-63082c4da5a1" >
Meta-analysis of fe...
Meta-analysis of fecal metagenomes reveals global microbial signatures that are specific for colorectal cancer
-
- Wirbel, Jakob (författare)
- European Molecular Biology Laboratory Heidelberg
-
- Pyl, Paul Theodor (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,University of Copenhagen
-
- Kartal, Ece (författare)
- European Molecular Biology Laboratory Heidelberg
-
visa fler...
-
- Zych, Konrad (författare)
- European Molecular Biology Laboratory Heidelberg
-
- Kashani, Alireza (författare)
- University of Copenhagen
-
- Milanese, Alessio (författare)
- European Molecular Biology Laboratory Heidelberg
-
- Fleck, Jonas S. (författare)
- European Molecular Biology Laboratory Heidelberg
-
- Voigt, Anita Y. (författare)
- European Molecular Biology Laboratory Heidelberg
-
- Palleja, Albert (författare)
- University of Copenhagen
-
- Ponnudurai, Ruby (författare)
- European Molecular Biology Laboratory Heidelberg
-
- Sunagawa, Shinichi (författare)
- ETH Zürich,European Molecular Biology Laboratory Heidelberg
-
- Coelho, Luis Pedro (författare)
- Fudan University,European Molecular Biology Laboratory Heidelberg
-
- Schrotz-King, Petra (författare)
- German Cancer Research Centre
-
- Vogtmann, Emily (författare)
- National Cancer Institute, USA
-
- Habermann, Nina (författare)
- European Molecular Biology Laboratory Heidelberg
-
- Niméus, Emma (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Bröstcancerkirurgi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Breast Cancer Surgery,Lund University Research Groups,Skåne University Hospital
-
- Thomas, Andrew M. (författare)
- University of São Paulo,University of Trento
-
- Manghi, Paolo (författare)
- University of Trento
-
- Gandini, Sara (författare)
- European Institute of Oncology
-
- Serrano, Davide (författare)
- European Institute of Oncology
-
- Mizutani, Sayaka (författare)
- Tokyo Institute of Technology,Japan Society for the Promotion of Science
-
- Shiroma, Hirotsugu (författare)
- Tokyo Institute of Technology
-
- Shiba, Satoshi (författare)
- National Cancer Center Research Institute, Japan
-
- Shibata, Tatsuhiro (författare)
- National Cancer Center Research Institute, Japan
-
- Yachida, Shinichi (författare)
- Osaka University,National Cancer Center Research Institute, Japan
-
- Yamada, Takuji (författare)
- Japan Science and Technology Agency (JST),Tokyo Institute of Technology
-
- Waldron, Levi (författare)
- City University of New York
-
- Naccarati, Alessio (författare)
- Institute of Experimental Medicine, Czech Academy of Science
-
- Segata, Nicola (författare)
- University of Trento
-
- Sinha, Rashmi (författare)
- National Cancer Institute, USA
-
- Ulrich, Cornelia M. (författare)
- University of Utah
-
- Brenner, Hermann (författare)
- German Cancer Research Centre
-
- Arumugam, Manimozhiyan (författare)
- University of Copenhagen,University of Southern Denmark
-
- Bork, Peer (författare)
- Julius Maximilian University of Würzburg,Max Delbrück Center for Molecular Medicine (MDC),European Molecular Biology Laboratory Heidelberg
-
- Zeller, Georg (författare)
- European Molecular Biology Laboratory Heidelberg
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2019-04-01
- 2019
- Engelska 11 s.
-
Ingår i: Nature Medicine. - : Springer Science and Business Media LLC. - 1078-8956 .- 1546-170X. ; 25:4, s. 679-689
- Relaterad länk:
-
http://dx.doi.org/10...
-
visa fler...
-
https://www.ncbi.nlm...
-
https://lup.lub.lu.s...
-
https://doi.org/10.1...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Association studies have linked microbiome alterations with many human diseases. However, they have not always reported consistent results, thereby necessitating cross-study comparisons. Here, a meta-analysis of eight geographically and technically diverse fecal shotgun metagenomic studies of colorectal cancer (CRC, n = 768), which was controlled for several confounders, identified a core set of 29 species significantly enriched in CRC metagenomes (false discovery rate (FDR) < 1 × 10 −5 ). CRC signatures derived from single studies maintained their accuracy in other studies. By training on multiple studies, we improved detection accuracy and disease specificity for CRC. Functional analysis of CRC metagenomes revealed enriched protein and mucin catabolism genes and depleted carbohydrate degradation genes. Moreover, we inferred elevated production of secondary bile acids from CRC metagenomes, suggesting a metabolic link between cancer-associated gut microbes and a fat- and meat-rich diet. Through extensive validations, this meta-analysis firmly establishes globally generalizable, predictive taxonomic and functional microbiome CRC signatures as a basis for future diagnostics.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Medicinsk genetik (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Medical Genetics (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Bioinformatik och systembiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Bioinformatics and Systems Biology (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- art (ämneskategori)
- ref (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Wirbel, Jakob
-
Pyl, Paul Theodo ...
-
Kartal, Ece
-
Zych, Konrad
-
Kashani, Alireza
-
Milanese, Alessi ...
-
visa fler...
-
Fleck, Jonas S.
-
Voigt, Anita Y.
-
Palleja, Albert
-
Ponnudurai, Ruby
-
Sunagawa, Shinic ...
-
Coelho, Luis Ped ...
-
Schrotz-King, Pe ...
-
Vogtmann, Emily
-
Habermann, Nina
-
Niméus, Emma
-
Thomas, Andrew M ...
-
Manghi, Paolo
-
Gandini, Sara
-
Serrano, Davide
-
Mizutani, Sayaka
-
Shiroma, Hirotsu ...
-
Shiba, Satoshi
-
Shibata, Tatsuhi ...
-
Yachida, Shinich ...
-
Yamada, Takuji
-
Waldron, Levi
-
Naccarati, Aless ...
-
Segata, Nicola
-
Sinha, Rashmi
-
Ulrich, Cornelia ...
-
Brenner, Hermann
-
Arumugam, Manimo ...
-
Bork, Peer
-
Zeller, Georg
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Medicinsk geneti ...
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Bioinformatik oc ...
- Artiklar i publikationen
-
Nature Medicine
- Av lärosätet
-
Lunds universitet