Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:8d3dbce1-5605-4564-a819-63082c4da5a1" >
Meta-analysis of fe...
-
Wirbel, JakobEuropean Molecular Biology Laboratory Heidelberg
(författare)
Meta-analysis of fecal metagenomes reveals global microbial signatures that are specific for colorectal cancer
- Artikel/kapitelEngelska2019
Förlag, utgivningsår, omfång ...
-
2019-04-01
-
Springer Science and Business Media LLC,2019
-
11 s.
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:lup.lub.lu.se:8d3dbce1-5605-4564-a819-63082c4da5a1
-
https://lup.lub.lu.se/record/8d3dbce1-5605-4564-a819-63082c4da5a1URI
-
https://doi.org/10.1038/s41591-019-0406-6DOI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Anmärkningar
-
Association studies have linked microbiome alterations with many human diseases. However, they have not always reported consistent results, thereby necessitating cross-study comparisons. Here, a meta-analysis of eight geographically and technically diverse fecal shotgun metagenomic studies of colorectal cancer (CRC, n = 768), which was controlled for several confounders, identified a core set of 29 species significantly enriched in CRC metagenomes (false discovery rate (FDR) < 1 × 10 −5 ). CRC signatures derived from single studies maintained their accuracy in other studies. By training on multiple studies, we improved detection accuracy and disease specificity for CRC. Functional analysis of CRC metagenomes revealed enriched protein and mucin catabolism genes and depleted carbohydrate degradation genes. Moreover, we inferred elevated production of secondary bile acids from CRC metagenomes, suggesting a metabolic link between cancer-associated gut microbes and a fat- and meat-rich diet. Through extensive validations, this meta-analysis firmly establishes globally generalizable, predictive taxonomic and functional microbiome CRC signatures as a basis for future diagnostics.
Ämnesord och genrebeteckningar
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Pyl, Paul TheodorLund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,University of Copenhagen(Swepub:lu)pa7707py
(författare)
-
Kartal, EceEuropean Molecular Biology Laboratory Heidelberg
(författare)
-
Zych, KonradEuropean Molecular Biology Laboratory Heidelberg
(författare)
-
Kashani, AlirezaUniversity of Copenhagen
(författare)
-
Milanese, AlessioEuropean Molecular Biology Laboratory Heidelberg
(författare)
-
Fleck, Jonas S.European Molecular Biology Laboratory Heidelberg
(författare)
-
Voigt, Anita Y.European Molecular Biology Laboratory Heidelberg
(författare)
-
Palleja, AlbertUniversity of Copenhagen
(författare)
-
Ponnudurai, RubyEuropean Molecular Biology Laboratory Heidelberg
(författare)
-
Sunagawa, ShinichiETH Zürich,European Molecular Biology Laboratory Heidelberg
(författare)
-
Coelho, Luis PedroEuropean Molecular Biology Laboratory Heidelberg,Fudan University
(författare)
-
Schrotz-King, PetraGerman Cancer Research Centre
(författare)
-
Vogtmann, EmilyNational Cancer Institute, USA
(författare)
-
Habermann, NinaEuropean Molecular Biology Laboratory Heidelberg
(författare)
-
Niméus, EmmaLund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Bröstcancerkirurgi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Breast Cancer Surgery,Lund University Research Groups,Skåne University Hospital(Swepub:lu)onk-ens
(författare)
-
Thomas, Andrew M.University of São Paulo,University of Trento
(författare)
-
Manghi, PaoloUniversity of Trento
(författare)
-
Gandini, SaraEuropean Institute of Oncology
(författare)
-
Serrano, DavideEuropean Institute of Oncology
(författare)
-
Mizutani, SayakaJapan Society for the Promotion of Science,Tokyo Institute of Technology
(författare)
-
Shiroma, HirotsuguTokyo Institute of Technology
(författare)
-
Shiba, SatoshiNational Cancer Center Research Institute, Japan
(författare)
-
Shibata, TatsuhiroNational Cancer Center Research Institute, Japan
(författare)
-
Yachida, ShinichiNational Cancer Center Research Institute, Japan,Osaka University
(författare)
-
Yamada, TakujiTokyo Institute of Technology,Japan Science and Technology Agency (JST)
(författare)
-
Waldron, LeviCity University of New York
(författare)
-
Naccarati, AlessioInstitute of Experimental Medicine, Czech Academy of Science
(författare)
-
Segata, NicolaUniversity of Trento
(författare)
-
Sinha, RashmiNational Cancer Institute, USA
(författare)
-
Ulrich, Cornelia M.University of Utah
(författare)
-
Brenner, HermannGerman Cancer Research Centre
(författare)
-
Arumugam, ManimozhiyanUniversity of Southern Denmark,University of Copenhagen
(författare)
-
Bork, PeerMax Delbrück Center for Molecular Medicine (MDC),Julius Maximilian University of Würzburg,European Molecular Biology Laboratory Heidelberg
(författare)
-
Zeller, GeorgEuropean Molecular Biology Laboratory Heidelberg
(författare)
-
European Molecular Biology Laboratory HeidelbergBröstcancer-genetik
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:Nature Medicine: Springer Science and Business Media LLC25:4, s. 679-6891078-89561546-170X
Internetlänk
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Wirbel, Jakob
-
Pyl, Paul Theodo ...
-
Kartal, Ece
-
Zych, Konrad
-
Kashani, Alireza
-
Milanese, Alessi ...
-
visa fler...
-
Fleck, Jonas S.
-
Voigt, Anita Y.
-
Palleja, Albert
-
Ponnudurai, Ruby
-
Sunagawa, Shinic ...
-
Coelho, Luis Ped ...
-
Schrotz-King, Pe ...
-
Vogtmann, Emily
-
Habermann, Nina
-
Niméus, Emma
-
Thomas, Andrew M ...
-
Manghi, Paolo
-
Gandini, Sara
-
Serrano, Davide
-
Mizutani, Sayaka
-
Shiroma, Hirotsu ...
-
Shiba, Satoshi
-
Shibata, Tatsuhi ...
-
Yachida, Shinich ...
-
Yamada, Takuji
-
Waldron, Levi
-
Naccarati, Aless ...
-
Segata, Nicola
-
Sinha, Rashmi
-
Ulrich, Cornelia ...
-
Brenner, Hermann
-
Arumugam, Manimo ...
-
Bork, Peer
-
Zeller, Georg
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Medicinsk geneti ...
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Bioinformatik oc ...
- Artiklar i publikationen
-
Nature Medicine
- Av lärosätet
-
Lunds universitet