Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:9ba2fa50-a7d6-4f07-a932-dc05e72d79e5" >
Construction of a m...
Construction of a map-based reference genome sequence for barley, Hordeum vulgare L.
-
- Beier, Sebastian (författare)
- Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research
-
- Himmelbach, Axel (författare)
- Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research
-
- Colmsee, Christian (författare)
- Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research
-
visa fler...
-
- Zhang, Xiao Qi (författare)
- Murdoch University
-
- Barrero, Roberto A. (författare)
- Murdoch University
-
- Zhang, Qisen (författare)
- Australian Export Grains Innovation Centre
-
- Li, Lin (författare)
- University of Minnesota
-
- Bayer, Micha (författare)
- James Hutton Institute
-
- Bolser, Daniel (författare)
- European Bioinformatics Institute
-
- Taudien, Stefan (författare)
- Leibniz Institute on Aging - Fritz Lipmann Institute (FLI)
-
- Groth, Marco (författare)
- Leibniz Institute on Aging - Fritz Lipmann Institute (FLI)
-
- Felder, Marius (författare)
- Leibniz Institute on Aging - Fritz Lipmann Institute (FLI)
-
- Hastie, Alex (författare)
- BioNano Genomics Inc.
-
- Šimková, Hana (författare)
- Academy of Sciences of the Czech Republic
-
- Staňková, Helena (författare)
- Academy of Sciences of the Czech Republic
-
- Vrána, Jan (författare)
- Academy of Sciences of the Czech Republic
-
- Chan, Saki (författare)
- BioNano Genomics Inc.
-
- Muñoz-Amatriaín, María (författare)
- University of California, Riverside
-
- Ounit, Rachid (författare)
- University of California, Riverside
-
- Wanamaker, Steve (författare)
- University of California, Riverside
-
- Schmutzer, Thomas (författare)
- Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research
-
- Aliyeva-Schnorr, Lala (författare)
- Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research
-
- Grasso, Stefano (författare)
- University of Udine
-
- Tanskanen, Jaakko (författare)
- University of Helsinki
-
- Sampath, Dharanya (författare)
- Earlham Institute
-
- Heavens, Darren (författare)
- Earlham Institute
-
- Cao, Sujie (författare)
- Beijing Genomics Institute
-
- Chapman, Brett (författare)
- Murdoch University
-
- Dai, Fei (författare)
- Zhejiang University
-
- Han, Yong (författare)
- Zhejiang University
-
- Li, Hua (författare)
- Beijing Genomics Institute
-
- Li, Xuan (författare)
- Beijing Genomics Institute
-
- Lin, Chongyun (författare)
- Beijing Genomics Institute
-
- McCooke, John K. (författare)
- Murdoch University
-
- Tan, Cong (författare)
- Murdoch University
-
- Wang, Songbo (författare)
- Beijing Genomics Institute
-
- Yin, Shuya (författare)
- Zhejiang University
-
- Zhou, Gaofeng (författare)
- Murdoch University
-
- Poland, Jesse A. (författare)
- Kansas State University
-
- Bellgard, Matthew I. (författare)
- Murdoch University
-
- Houben, Andreas (författare)
- Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research
-
- Doležel, Jaroslav (författare)
- Academy of Sciences of the Czech Republic
-
- Ayling, Sarah (författare)
- Earlham Institute
-
- Lonardi, Stefano (författare)
- University of California, Riverside
-
- Langridge, Peter (författare)
- University of Adelaide
-
- Muehlbauer, Gary J. (författare)
- University of Minnesota
-
- Kersey, Paul (författare)
- European Bioinformatics Institute
-
- Clark, Matthew D. (författare)
- Earlham Institute,University of East Anglia
-
- Caccamo, Mario (författare)
- Earlham Institute,National Institute of Agricultural Botany
-
- Schulman, Alan H. (författare)
- University of Helsinki
-
- Platzer, Matthias (författare)
- Leibniz Institute on Aging - Fritz Lipmann Institute (FLI)
-
- Close, Timothy J. (författare)
- University of California, Riverside
-
- Hansson, Mats (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Biologiska institutionen,Naturvetenskapliga fakulteten,Department of Biology,Faculty of Science
-
- Zhang, Guoping (författare)
- Zhejiang University
-
- Braumann, Ilka (författare)
- Carlsberg Research Center / Carlsberg Laboratory
-
- Li, Chengdao (författare)
- Yangtze University,Department of Agriculture and Food Western Australia,Murdoch University
-
- Waugh, Robbie (författare)
- University of Dundee,James Hutton Institute
-
- Scholz, Uwe (författare)
- Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research
-
- Stein, Nils (författare)
- University of Western Australia, Crawley,Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research
-
- Mascher, Martin (författare)
- Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research,German Centre for Integrative Biodiversity Research (iDiv)
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2017-04-27
- 2017
- Engelska.
-
Ingår i: Scientific Data. - : Springer Science and Business Media LLC. - 2052-4463. ; 4
- Relaterad länk:
-
http://dx.doi.org/10... (free)
-
visa fler...
-
https://www.nature.c...
-
https://lup.lub.lu.s...
-
https://doi.org/10.1...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Barley (Hordeum vulgare L.) is a cereal grass mainly used as animal fodder and raw material for the malting industry. The map-based reference genome sequence of barley cv. â € Morex' was constructed by the International Barley Genome Sequencing Consortium (IBSC) using hierarchical shotgun sequencing. Here, we report the experimental and computational procedures to (i) sequence and assemble more than 80,000 bacterial artificial chromosome (BAC) clones along the minimum tiling path of a genome-wide physical map, (ii) find and validate overlaps between adjacent BACs, (iii) construct 4,265 non-redundant sequence scaffolds representing clusters of overlapping BACs, and (iv) order and orient these BAC clusters along the seven barley chromosomes using positional information provided by dense genetic maps, an optical map and chromosome conformation capture sequencing (Hi-C). Integrative access to these sequence and mapping resources is provided by the barley genome explorer (BARLEX).
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Botanik (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Botany (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- art (ämneskategori)
- ref (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Beier, Sebastian
-
Himmelbach, Axel
-
Colmsee, Christi ...
-
Zhang, Xiao Qi
-
Barrero, Roberto ...
-
Zhang, Qisen
-
visa fler...
-
Li, Lin
-
Bayer, Micha
-
Bolser, Daniel
-
Taudien, Stefan
-
Groth, Marco
-
Felder, Marius
-
Hastie, Alex
-
Šimková, Hana
-
Staňková, Helena
-
Vrána, Jan
-
Chan, Saki
-
Muñoz-Amatriaín, ...
-
Ounit, Rachid
-
Wanamaker, Steve
-
Schmutzer, Thoma ...
-
Aliyeva-Schnorr, ...
-
Grasso, Stefano
-
Tanskanen, Jaakk ...
-
Sampath, Dharany ...
-
Heavens, Darren
-
Cao, Sujie
-
Chapman, Brett
-
Dai, Fei
-
Han, Yong
-
Li, Hua
-
Li, Xuan
-
Lin, Chongyun
-
McCooke, John K.
-
Tan, Cong
-
Wang, Songbo
-
Yin, Shuya
-
Zhou, Gaofeng
-
Poland, Jesse A.
-
Bellgard, Matthe ...
-
Houben, Andreas
-
Doležel, Jarosla ...
-
Ayling, Sarah
-
Lonardi, Stefano
-
Langridge, Peter
-
Muehlbauer, Gary ...
-
Kersey, Paul
-
Clark, Matthew D ...
-
Caccamo, Mario
-
Schulman, Alan H ...
-
Platzer, Matthia ...
-
Close, Timothy J ...
-
Hansson, Mats
-
Zhang, Guoping
-
Braumann, Ilka
-
Li, Chengdao
-
Waugh, Robbie
-
Scholz, Uwe
-
Stein, Nils
-
Mascher, Martin
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Botanik
- Artiklar i publikationen
-
Scientific Data
- Av lärosätet
-
Lunds universitet