SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:9d7f3ffb-ae82-4b26-a6a5-9c5c1459dcf5"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:9d7f3ffb-ae82-4b26-a6a5-9c5c1459dcf5" > Human genetic varia...

  • Scepanovic, PetarSwiss Federal Institute of Technology,Swiss Institute for Bioinformatics (SIB) (författare)

Human genetic variants and age are the strongest predictors of humoral immune responses to common pathogens and vaccines

  • Artikel/kapitelEngelska2018

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2018-07-27
  • Springer Science and Business Media LLC,2018

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:lup.lub.lu.se:9d7f3ffb-ae82-4b26-a6a5-9c5c1459dcf5
  • https://lup.lub.lu.se/record/9d7f3ffb-ae82-4b26-a6a5-9c5c1459dcf5URI
  • https://doi.org/10.1186/s13073-018-0568-8DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype
  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype

Anmärkningar

  • Background: Humoral immune responses to infectious agents or vaccination vary substantially among individuals, and many of the factors responsible for this variability remain to be defined. Current evidence suggests that human genetic variation influences (i) serum immunoglobulin levels, (ii) seroconversion rates, and (iii) intensity of antigen-specific immune responses. Here, we evaluated the impact of intrinsic (age and sex), environmental, and genetic factors on the variability of humoral response to common pathogens and vaccines. Methods: We characterized the serological response to 15 antigens from common human pathogens or vaccines, in an age- and sex-stratified cohort of 1000 healthy individuals (Milieu Intérieur cohort). Using clinical-grade serological assays, we measured total IgA, IgE, IgG, and IgM levels, as well as qualitative (serostatus) and quantitative IgG responses to cytomegalovirus, Epstein-Barr virus, herpes simplex virus 1 and 2, varicella zoster virus, Helicobacter pylori, Toxoplasma gondii, influenza A virus, measles, mumps, rubella, and hepatitis B virus. Following genome-wide genotyping of single nucleotide polymorphisms and imputation, we examined associations between ~5 million genetic variants and antibody responses using single marker and gene burden tests. Results: We identified age and sex as important determinants of humoral immunity, with older individuals and women having higher rates of seropositivity for most antigens. Genome-wide association studies revealed significant associations between variants in the human leukocyte antigen (HLA) class II region on chromosome 6 and anti-EBV and anti-rubella IgG levels. We used HLA imputation to fine map these associations to amino acid variants in the peptide-binding groove of HLA-DRβ1 and HLA-DPβ1, respectively. We also observed significant associations for total IgA levels with two loci on chromosome 2 and with specific KIR-HLA combinations. Conclusions: Using extensive serological testing and genome-wide association analyses in a well-characterized cohort of healthy individuals, we demonstrated that age, sex, and specific human genetic variants contribute to inter-individual variability in humoral immunity. By highlighting genes and pathways implicated in the normal antibody response to frequently encountered antigens, these findings provide a basis to better understand disease pathogenesis.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Alanio, CécilePasteur Institute (författare)
  • Hammer, ChristianGenentech, Inc,Swiss Institute for Bioinformatics (SIB),Swiss Federal Institute of Technology (författare)
  • Hodel, FlaviaSwiss Federal Institute of Technology,Swiss Institute for Bioinformatics (SIB) (författare)
  • Bergstedt, JacobLund University,Lunds universitet,Institutionen för reglerteknik,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Department of Automatic Control,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH(Swepub:lu)cont-jan (författare)
  • Patin, EtienneThe French National Centre for Scientific Research (CNRS),Pasteur Institute (författare)
  • Thorball, Christian W.Swiss Federal Institute of Technology,Swiss Institute for Bioinformatics (SIB) (författare)
  • Chaturvedi, NimishaSwiss Institute for Bioinformatics (SIB),Swiss Federal Institute of Technology (författare)
  • Charbit, BrunoPasteur Institute (författare)
  • Abel, LaurentInstitut Gustave Roussy,Necker-Enfants Malades Hospital,Paris Descartes University,Rockefeller University (författare)
  • Quintana-Murci, LluisPasteur Institute,The French National Centre for Scientific Research (CNRS) (författare)
  • Duffy, DarraghPasteur Institute (författare)
  • Albert, Matthew L.Genentech, Inc (författare)
  • Fellay, JacquesSwiss Federal Institute of Technology,Swiss Institute for Bioinformatics (SIB),Lausanne University Hospital (författare)
  • Alcover, AndresPasteur Institute (författare)
  • Aschard, HuguesPasteur Institute (författare)
  • Bousso, PhilippePasteur Institute (författare)
  • Bruhns, PierrePasteur Institute (författare)
  • Cumano, AnaPasteur Institute (författare)
  • Demangel, CarolinePasteur Institute (författare)
  • Deriano, LudovicPasteur Institute (författare)
  • Di Santo, JamesPasteur Institute (författare)
  • Dromer, FrançoisePasteur Institute (författare)
  • Eberl, GérardPasteur Institute (författare)
  • Enninga, JostPasteur Institute (författare)
  • Gelpi, OdilePasteur Institute (författare)
  • Gomperts-Boneca, IvoPasteur Institute (författare)
  • Hasan, MilenaPasteur Institute (författare)
  • Leclerc, ClaudePasteur Institute (författare)
  • Mouquet, HugoPasteur Institute (författare)
  • Pellegrini, SandraPasteur Institute (författare)
  • Rogge, LarsPasteur Institute (författare)
  • Sakuntabhai, AnavajPasteur Institute (författare)
  • Schwartz, OlivierPasteur Institute (författare)
  • Schwikowski, BennoPasteur Institute (författare)
  • Shorte, SpencerPasteur Institute (författare)
  • Tangy, FrédéricPasteur Institute (författare)
  • Ungeheuer, Marie NoëllePasteur Institute (författare)
  • Astrom, KallaLund University,Lunds universitet,Matematikcentrum,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Centre for Mathematical Sciences,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH(Swepub:lu)math-kas (författare)
  • Hercberg, SergeSorbonne Paris Nord University (författare)
  • Touvier, MathildeSorbonne Paris Nord University (författare)
  • Lantz, OlivierCurie Institute, Paris (författare)
  • Soumelis, VassiliCurie Institute, Paris (författare)
  • Pol, StanislasCochin Hospital (författare)
  • Rausell, AntonioInstitut Gustave Roussy (författare)
  • Tartour, EricHôpital Européen Georges-Pompidou (författare)
  • Toubert, AntoineSaint-Louis Hospital, Paris (författare)
  • Swiss Federal Institute of TechnologySwiss Institute for Bioinformatics (SIB) (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Genome Medicine: Springer Science and Business Media LLC10:11756-994X

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy