Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:ab43a332-5aec-4446-bde6-09b9546317f5" >
The topography of m...
-
Morganella, SandroEuropean Bioinformatics Institute
(författare)
The topography of mutational processes in breast cancer genomes
- Artikel/kapitelEngelska2016
Förlag, utgivningsår, omfång ...
-
2016-05-02
-
Springer Science and Business Media LLC,2016
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:lup.lub.lu.se:ab43a332-5aec-4446-bde6-09b9546317f5
-
https://lup.lub.lu.se/record/ab43a332-5aec-4446-bde6-09b9546317f5URI
-
https://doi.org/10.1038/ncomms11383DOI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Anmärkningar
-
Somatic mutations in human cancers show unevenness in genomic distribution that correlate with aspects of genome structure and function. These mutations are, however, generated by multiple mutational processes operating through the cellular lineage between the fertilized egg and the cancer cell, each composed of specific DNA damage and repair components and leaving its own characteristic mutational signature on the genome. Using somatic mutation catalogues from 560 breast cancer whole-genome sequences, here we show that each of 12 base substitution, 2 insertion/deletion (indel) and 6 rearrangement mutational signatures present in breast tissue, exhibit distinct relationships with genomic features relating to transcription, DNA replication and chromatin organization. This signature-based approach permits visualization of the genomic distribution of mutational processes associated with APOBEC enzymes, mismatch repair deficiency and homologous recombinational repair deficiency, as well as mutational processes of unknown aetiology. Furthermore, it highlights mechanistic insights including a putative replication-dependent mechanism of APOBEC-related mutagenesis.
Ämnesord och genrebeteckningar
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Alexandrov, Ludmil B.Los Alamos National Laboratory
(författare)
-
Glodzik, DominikWellcome Trust Sanger Institute
(författare)
-
Zou, XueqingWellcome Trust Sanger Institute
(författare)
-
Davies, HelenWellcome Trust Sanger Institute
(författare)
-
Staaf, JohanLund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine(Swepub:lu)onk-jst
(författare)
-
Sieuwerts, Anieta M.Erasmus University Medical Center
(författare)
-
Brinkman, Arie B.Radboud University Nijmegen
(författare)
-
Martin, SanchaWellcome Trust Sanger Institute
(författare)
-
Ramakrishna, ManasaWellcome Trust Sanger Institute
(författare)
-
Butler, AdamWellcome Trust Sanger Institute
(författare)
-
Kim, Hyung YongHanyang University
(författare)
-
Borg, ÅkeLund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine(Swepub:lu)onk-abo
(författare)
-
Sotiriou, ChristosInstitut Jules Bordet
(författare)
-
Futreal, P. AndrewUniversity of Texas
(författare)
-
Campbell, Peter J.Wellcome Trust Sanger Institute
(författare)
-
Span, Paul N.Radboud University Nijmegen
(författare)
-
Van Laere, StevenUniversity of Antwerp
(författare)
-
Lakhani, Sunil R.Royal Brisbane and Women's Hospital
(författare)
-
Eyfjord, Jorunn E.University of Iceland
(författare)
-
Thompson, Alastair M.Ninewells Hospital and Medical School
(författare)
-
Stunnenberg, Hendrik G.Radboud University Nijmegen
(författare)
-
Van De Vijver, Marc J.Academic Medical Center of University of Amsterdam (AMC)
(författare)
-
Martens, John W MErasmus University Medical Center
(författare)
-
Børresen-Dale, Anne LiseUniversity of Oslo
(författare)
-
Richardson, Andrea L.Dana-Farber Cancer Institute
(författare)
-
Kong, GuHanyang University
(författare)
-
Thomas, GillesCentre Léon Bérard
(författare)
-
Sale, JulianMRC Laboratory of Molecular Biology
(författare)
-
Rada, CristinaMRC Laboratory of Molecular Biology
(författare)
-
Stratton, Michael R.Wellcome Trust Sanger Institute
(författare)
-
Birney, EwanEuropean Bioinformatics Institute
(författare)
-
Nik-Zainal, SerenaCambridge University Hospitals NHS Foundation Trust
(författare)
-
European Bioinformatics InstituteLos Alamos National Laboratory
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:Nature Communications: Springer Science and Business Media LLC72041-1723
Internetlänk
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Morganella, Sand ...
-
Alexandrov, Ludm ...
-
Glodzik, Dominik
-
Zou, Xueqing
-
Davies, Helen
-
Staaf, Johan
-
visa fler...
-
Sieuwerts, Aniet ...
-
Brinkman, Arie B ...
-
Martin, Sancha
-
Ramakrishna, Man ...
-
Butler, Adam
-
Kim, Hyung Yong
-
Borg, Åke
-
Sotiriou, Christ ...
-
Futreal, P. Andr ...
-
Campbell, Peter ...
-
Span, Paul N.
-
Van Laere, Steve ...
-
Lakhani, Sunil R ...
-
Eyfjord, Jorunn ...
-
Thompson, Alasta ...
-
Stunnenberg, Hen ...
-
Van De Vijver, M ...
-
Martens, John W ...
-
Børresen-Dale, A ...
-
Richardson, Andr ...
-
Kong, Gu
-
Thomas, Gilles
-
Sale, Julian
-
Rada, Cristina
-
Stratton, Michae ...
-
Birney, Ewan
-
Nik-Zainal, Sere ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Cancer och onkol ...
- Artiklar i publikationen
-
Nature Communica ...
- Av lärosätet
-
Lunds universitet