SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:c488309b-0f8f-4235-b508-fb069bcc87ca"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:c488309b-0f8f-4235-b508-fb069bcc87ca" > OCTAVVS : A graphic...

  • Troein, CarlLund University,Lunds universitet,MEMEG,Biologiska institutionen,Naturvetenskapliga fakulteten,Beräkningsbiologi och biologisk fysik - Har omorganiserats,Institutionen för astronomi och teoretisk fysik - Har omorganiserats,Beräkningsvetenskap för hälsa och miljö,Forskargrupper vid Lunds universitet,Department of Biology,Faculty of Science,Computational Biology and Biological Physics - Has been reorganised,Department of Astronomy and Theoretical Physics - Has been reorganised,Computational Science for Health and Environment,Lund University Research Groups (författare)

OCTAVVS : A graphical toolbox for high-throughput preprocessing and analysis of vibrational spectroscopy imaging data

  • Artikel/kapitelEngelska2020

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2020-05-01
  • MDPI AG,2020
  • 15 s.

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:lup.lub.lu.se:c488309b-0f8f-4235-b508-fb069bcc87ca
  • https://lup.lub.lu.se/record/c488309b-0f8f-4235-b508-fb069bcc87caURI
  • https://doi.org/10.3390/mps3020034DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype
  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype

Anmärkningar

  • Modern vibrational spectroscopy techniques enable the rapid collection of thousands of spectra in a single hyperspectral image, allowing researchers to study spatially heterogeneous samples at micrometer resolution. A number of algorithms have been developed to correct for effects such as atmospheric absorption, light scattering by cellular structures and varying baseline levels. After preprocessing, spectra are commonly decomposed and clustered to reveal informative patterns and subtle spectral changes. Several of these steps are slow, labor-intensive and require programming skills to make use of published algorithms and code. We here present a free and platform-independent graphical toolbox that allows rapid preprocessing of large sets of spectroscopic images, including atmospheric correction and a new algorithm for resonant Mie scattering with improved speed. The software also includes modules for decomposition into constituent spectra using the popular Multivariate Curve Resolution–Alternating Least Squares (MCR-ALS) algorithm, augmented by region-of-interest selection, as well as clustering and cluster annotation.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Siregar, SyahrilLund University,Lunds universitet,Beräkningsbiologi och biologisk fysik - Har omorganiserats,Institutionen för astronomi och teoretisk fysik - Har omorganiserats,Naturvetenskapliga fakulteten,Computational Biology and Biological Physics - Has been reorganised,Department of Astronomy and Theoretical Physics - Has been reorganised,Faculty of Science(Swepub:lu)sy4651si (författare)
  • Op De Beeck, MichielLund University,Lunds universitet,MEMEG,Biologiska institutionen,Naturvetenskapliga fakulteten,BECC: Biodiversity and Ecosystem services in a Changing Climate,Centrum för miljö- och klimatvetenskap (CEC),Molekylär ekologi och evolution,Forskargrupper vid Lunds universitet,Department of Biology,Faculty of Science,Centre for Environmental and Climate Science (CEC),Molecular Ecology and Evolution Lab,Lund University Research Groups(Swepub:lu)biol-mop (författare)
  • Peterson, CarstenLund University,Lunds universitet,Beräkningsbiologi och biologisk fysik - Har omorganiserats,Institutionen för astronomi och teoretisk fysik - Har omorganiserats,Naturvetenskapliga fakulteten,Beräkningsvetenskap för hälsa och miljö,Forskargrupper vid Lunds universitet,Computational Biology and Biological Physics - Has been reorganised,Department of Astronomy and Theoretical Physics - Has been reorganised,Faculty of Science,Computational Science for Health and Environment,Lund University Research Groups(Swepub:lu)thep-cpe (författare)
  • Tunlid, AndersLund University,Lunds universitet,MEMEG,Biologiska institutionen,Naturvetenskapliga fakulteten,BECC: Biodiversity and Ecosystem services in a Changing Climate,Centrum för miljö- och klimatvetenskap (CEC),Molekylär ekologi och evolution,Forskargrupper vid Lunds universitet,Department of Biology,Faculty of Science,Centre for Environmental and Climate Science (CEC),Molecular Ecology and Evolution Lab,Lund University Research Groups(Swepub:lu)mbek-atu (författare)
  • Persson, PerLund University,Lunds universitet,BECC: Biodiversity and Ecosystem services in a Changing Climate,Centrum för miljö- och klimatvetenskap (CEC),Naturvetenskapliga fakulteten,Molekylär ekologi och evolution,Forskargrupper vid Lunds universitet,Centre for Environmental and Climate Science (CEC),Faculty of Science,Molecular Ecology and Evolution Lab,Lund University Research Groups(Swepub:lu)cec-ppn (författare)
  • MEMEGBiologiska institutionen (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Methods and Protocols: MDPI AG3:2, s. 1-152409-9279

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...
Troein, Carl
Siregar, Syahril
Op De Beeck, Mic ...
Peterson, Carste ...
Tunlid, Anders
Persson, Per
Om ämnet
NATURVETENSKAP
NATURVETENSKAP
och Biologi
NATURVETENSKAP
NATURVETENSKAP
och Fysik
och Annan fysik
Artiklar i publikationen
Methods and Prot ...
Av lärosätet
Lunds universitet

Sök utanför SwePub

Wikipedia om författaren:
Carl_Troein
Troein, Carl
en

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy