Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:d0ff0b81-d2f5-44b8-af03-a4505c102064" >
Quantitative Proteo...
Quantitative Proteomics Profiling of Primary Lung Adenocarcinoma Tumors Reveals Functional Perturbations in Tumor Metabolism
-
- Pernemalm, Maria (författare)
- Karolinska Institutet
-
- De Petris, Luigi (författare)
- Karolinska Institutet
-
- Branca, Rui M. (författare)
- Karolinska Institutet
-
visa fler...
-
- Forshed, Jenny (författare)
- Karolinska Institutet
-
- Kanter, Lena (författare)
- Karolinska Institutet
-
Soria, Jean-Charles (författare)
-
Girard, Philippe (författare)
-
Validire, Pierre (författare)
-
- Pawitan, Yudi (författare)
- Karolinska Institutet
-
van den Oord, Joost (författare)
-
Lazar, Vladimir (författare)
-
- Påhlman, Sven (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Avdelningen för translationell cancerforskning,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Division of Translational Cancer Research,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine
-
- Lewensohn, Rolf (författare)
- Karolinska Institutet
-
- Lehtio, Janne (författare)
- Karolinska Institutet
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2013-08-13
- 2013
- Engelska.
-
Ingår i: Journal of Proteome Research. - : American Chemical Society (ACS). - 1535-3893 .- 1535-3907. ; 12:9, s. 3934-3943
- Relaterad länk:
-
http://dx.doi.org/10...
-
visa fler...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://lup.lub.lu.s...
-
https://doi.org/10.1...
-
http://kipublication...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- In this study, we have analyzed human primary lung adenocarcinoma tumors using global mass spectrometry to elucidate the biological mechanisms behind relapse post surgery. In total, we identified over 3000 proteins with high confidence. Supervised multivariate analysis was used to select 132 proteins separating the prognostic groups. Based on in-depth bioinformatics analysis, we hypothesized that the tumors with poor prognosis had a higher glycolytic activity and HIF activation. By measuring the bioenergetic cellular index of the tumors, we could detect a higher dependency of glycolysis among the tumors with poor prognosis. Further, we could also detect an up-regulation of HIF1 alpha mRNA expression in tumors with early relapse. Finally, we selected three proteins that were upregulated in the poor prognosis group (cathepsin D, ENO1, and VDAC1) to confirm that the proteins indeed originated from the tumor and not from a stromal or inflammatory component. Overall, these findings show how in-depth analysis of clinical material can lead to an increased understanding of the molecular mechanisms behind tumor progression.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)
Nyckelord
- NSCLC
- adenocarcinoma
- relapse
- glycolysis
- hypoxia
- HIF1
- ENO1
- VDAC1
- CTSD
- Warburg
- prognosis
- peptide isoelectric focusing
Publikations- och innehållstyp
- art (ämneskategori)
- ref (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Pernemalm, Maria
-
De Petris, Luigi
-
Branca, Rui M.
-
Forshed, Jenny
-
Kanter, Lena
-
Soria, Jean-Char ...
-
visa fler...
-
Girard, Philippe
-
Validire, Pierre
-
Pawitan, Yudi
-
van den Oord, Jo ...
-
Lazar, Vladimir
-
Påhlman, Sven
-
Lewensohn, Rolf
-
Lehtio, Janne
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Cancer och onkol ...
- Artiklar i publikationen
-
Journal of Prote ...
- Av lärosätet
-
Lunds universitet
-
Karolinska Institutet