Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:d1c10df1-8cd4-4fa9-98ea-207019750bb1" >
Nine residues in HL...
Nine residues in HLA-DQ molecules determine with susceptibility and resistance to type 1 diabetes among young children in Sweden
-
- Zhao, Lue Ping (författare)
- Fred Hutchinson Cancer Research Center,Fred Hutchinson Canc Res Ctr, WA 98109 USA
-
- Papadopoulos, George K (författare)
- University of Ioannina,Univ Ioannina, Greece
-
- Moustakas, Antonis K (författare)
- Ionian University,Ionian Univ, Greece
-
visa fler...
-
- Bondinas, George P (författare)
- University of Ioannina,Univ Ioannina, Greece
-
- Carlsson, Annelie (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Pediatrisk autoimmunitet,Forskargrupper vid Lunds universitet,Pediatric Autoimmunity,Lund University Research Groups,Lund Univ, Sweden
-
- Larsson, Helena Elding (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Pediatrisk endokrinologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Paediatric Endocrinology,Lund University Research Groups,Skåne University Hospital,Lund Univ CRC, Sweden
-
- Ludvigsson, Johnny (författare)
- Linköpings universitet,Linköping University,Avdelningen för barns och kvinnors hälsa,Medicinska fakulteten,Region Östergötland, H.K.H. Kronprinsessan Victorias barn- och ungdomssjukhus
-
- Marcus, Claude (författare)
- Karolinska Institutet,Karolinska Institute,Karolinska Inst, Sweden; Karolinska Inst, Sweden
-
- Persson, Martina (författare)
- Karolinska Institutet,Karolinska Institute,Karolinska Inst, Sweden
-
- Samuelsson, Ulf, 1951- (författare)
- Linköpings universitet,Linköping University,Avdelningen för barns och kvinnors hälsa,Medicinska fakulteten,Region Östergötland, H.K.H. Kronprinsessan Victorias barn- och ungdomssjukhus
-
- Wang, Ruihan (författare)
- Fred Hutchinson Cancer Research Center,Fred Hutchinson Canc Res Ctr, WA 98104 USA
-
- Pyo, Chul-Woo (författare)
- Fred Hutchinson Cancer Research Center,Fred Hutchinson Canc Res Ctr, WA 98104 USA
-
- Geraghty, Daniel E (författare)
- Fred Hutchinson Cancer Research Center,Fred Hutchinson Canc Res Ctr, WA 98104 USA
-
- Lernmark, Åke (författare)
- Lund University,Lunds universitet,Celiaki och diabetes,Forskargrupper vid Lunds universitet,Celiac Disease and Diabetes Unit,Lund University Research Groups,Skåne University Hospital,Lund Univ CRC, Sweden
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2021-04-23
- 2021
- Engelska.
-
Ingår i: Scientific Reports. - : Springer Science and Business Media LLC. - 2045-2322. ; 11:1
- Relaterad länk:
-
http://dx.doi.org/10... (free)
-
visa fler...
-
https://www.nature.c...
-
https://liu.diva-por... (primary) (Raw object)
-
https://lup.lub.lu.s...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://urn.kb.se/re...
-
http://kipublication...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- HLA-DQ molecules account over 50% genetic risk of type 1 diabetes (T1D), but little is known about associated residues. Through next generation targeted sequencing technology and deep learning of DQ residue sequences, the aim was to uncover critical residues and their motifs associated with T1D. Our analysis uncovered (αa1, α44, α157, α196) and (β9, β30, β57, β70, β135) on the HLA-DQ molecule. Their motifs captured all known susceptibility and resistant T1D associations. Three motifs, "DCAA-YSARD" (OR = 2.10, p = 1.96*10-20), "DQAA-YYARD" (OR = 3.34, 2.69*10-72) and "DQDA-YYARD" (OR = 3.71, 1.53*10-6) corresponding to DQ2.5 and DQ8.1 (the latter two motifs) associated with susceptibility. Ten motifs were significantly associated with resistance to T1D. Collectively, homozygous DQ risk motifs accounted for 43% of DQ-T1D risk, while homozygous DQ resistant motifs accounted for 25% protection to DQ-T1D risk. Of the identified nine residues five were within or near anchoring pockets of the antigenic peptide (α44, β9, β30, β57 and β70), one was the N-terminal of the alpha chain (αa1), one in the CD4-binding region (β135), one in the putative cognate TCR-induced αβ homodimerization process (α157), and one in the intra-membrane domain of the alpha chain (α196). Finding these critical residues should allow investigations of fundamental properties of host immunity that underlie tolerance to self and organ-specific autoimmunity.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Endokrinologi och diabetes (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Endocrinology and Diabetes (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Pediatrik (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Pediatrics (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Strukturbiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Structural Biology (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- art (ämneskategori)
- ref (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Zhao, Lue Ping
-
Papadopoulos, Ge ...
-
Moustakas, Anton ...
-
Bondinas, George ...
-
Carlsson, Anneli ...
-
Larsson, Helena ...
-
visa fler...
-
Ludvigsson, John ...
-
Marcus, Claude
-
Persson, Martina
-
Samuelsson, Ulf, ...
-
Wang, Ruihan
-
Pyo, Chul-Woo
-
Geraghty, Daniel ...
-
Lernmark, Åke
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Endokrinologi oc ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Pediatrik
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Strukturbiologi
- Artiklar i publikationen
-
Scientific Repor ...
- Av lärosätet
-
Lunds universitet
-
Linköpings universitet
-
Karolinska Institutet