SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:f935f60b-9c89-4c9b-aefb-689523eabc54"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:f935f60b-9c89-4c9b-aefb-689523eabc54" > Partially methylate...

  • Brinkman, Arie B.Radboud University Nijmegen (författare)

Partially methylated domains are hypervariable in breast cancer and fuel widespread CpG island hypermethylation

  • Artikel/kapitelEngelska2019

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2019-04-15
  • Springer Science and Business Media LLC,2019

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:lup.lub.lu.se:f935f60b-9c89-4c9b-aefb-689523eabc54
  • https://lup.lub.lu.se/record/f935f60b-9c89-4c9b-aefb-689523eabc54URI
  • https://doi.org/10.1038/s41467-019-09828-0DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype
  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype

Anmärkningar

  • Global loss of DNA methylation and CpG island (CGI) hypermethylation are key epigenomic aberrations in cancer. Global loss manifests itself in partially methylated domains (PMDs) which extend up to megabases. However, the distribution of PMDs within and between tumor types, and their effects on key functional genomic elements including CGIs are poorly defined. We comprehensively show that loss of methylation in PMDs occurs in a large fraction of the genome and represents the prime source of DNA methylation variation. PMDs are hypervariable in methylation level, size and distribution, and display elevated mutation rates. They impose intermediate DNA methylation levels incognizant of functional genomic elements including CGIs, underpinning a CGI methylator phenotype (CIMP). Repression effects on tumor suppressor genes are negligible as they are generally excluded from PMDs. The genomic distribution of PMDs reports tissue-of-origin and may represent tissue-specific silent regions which tolerate instability at the epigenetic, transcriptomic and genetic level.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Nik-Zainal, SerenaWellcome Trust Sanger Institute,University of Cambridge (författare)
  • Simmer, FemkeRadboud University Nijmegen (författare)
  • Rodríguez-González, F. GermánErasmus University Medical Center (författare)
  • Smid, MarcelErasmus University Medical Center (författare)
  • Alexandrov, Ludmil B.Los Alamos National Laboratory,Wellcome Trust Sanger Institute (författare)
  • Butler, AdamWellcome Trust Sanger Institute (författare)
  • Martin, SanchaWellcome Trust Sanger Institute (författare)
  • Davies, HelenWellcome Trust Sanger Institute (författare)
  • Glodzik, DominikWellcome Trust Sanger Institute(Swepub:lu)do5123gl (författare)
  • Zou, XueqingWellcome Trust Sanger Institute (författare)
  • Ramakrishna, ManasaWellcome Trust Sanger Institute (författare)
  • Staaf, JohanLund University,Lunds universitet,Bröstcancer-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Breastcancer-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine(Swepub:lu)onk-jst (författare)
  • Ringnér, MarkusLund University,Lunds universitet,Molekylär cellbiologi,Biologiska institutionen,Naturvetenskapliga fakulteten,Molecular Cell Biology,Department of Biology,Faculty of Science(Swepub:lu)thep-mri (författare)
  • Sieuwerts, AnietaErasmus University Medical Center (författare)
  • Ferrari, AnthonyCentre Léon Bérard (författare)
  • Morganella, SandroWellcome Trust (författare)
  • Fleischer, ThomasNorwegian Radium Hospital (författare)
  • Kristensen, VesselaAkershus University Hospital,University of Oslo,Norwegian Radium Hospital (författare)
  • Gut, MartaUniversity of Barcelona (författare)
  • van de Vijver, Marc J.Academic Medical Center of University of Amsterdam (AMC) (författare)
  • Børresen-Dale, Anne LiseNorwegian Radium Hospital,University of Oslo (författare)
  • Richardson, Andrea L.Brigham and Women's Hospital / Harvard Medical School,Dana-Farber Cancer Institute (författare)
  • Thomas, GillesCentre Léon Bérard (författare)
  • Gut, Ivo G.University of Barcelona (författare)
  • Martens, John W.M.Erasmus University Medical Center (författare)
  • Foekens, John A.Erasmus University Medical Center (författare)
  • Stratton, Michael R.Wellcome Trust Sanger Institute (författare)
  • Stunnenberg, Hendrik G.Radboud University Nijmegen (författare)
  • Radboud University NijmegenWellcome Trust Sanger Institute (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Nature Communications: Springer Science and Business Media LLC10:12041-1723

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy