Sökning: onr:"swepub:oai:prod.swepub.kib.ki.se:119818354" >
Inferring tumor pro...
Inferring tumor progression from genomic heterogeneity
- Artikel/kapitelEngelska2010
Förlag, utgivningsår, omfång ...
-
2009-11-10
-
Cold Spring Harbor Laboratory,2010
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:prod.swepub.kib.ki.se:119818354
-
http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:119818354URI
-
https://doi.org/10.1101/gr.099622.109DOI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Anmärkningar
-
Cancer progression in humans is difficult to infer because we do not routinely sample patients at multiple stages of their disease. However, heterogeneous breast tumors provide a unique opportunity to study human tumor progression because they still contain evidence of early and intermediate subpopulations in the form of the phylogenetic relationships. We have developed a method we call Sector-Ploidy-Profiling (SPP) to study the clonal composition of breast tumors. SPP involves macro-dissecting tumors, flow-sorting genomic subpopulations by DNA content, and profiling genomes using comparative genomic hybridization (CGH). Breast carcinomas display two classes of genomic structural variation: (1) monogenomic and (2) polygenomic. Monogenomic tumors appear to contain a single major clonal subpopulation with a highly stable chromosome structure. Polygenomic tumors contain multiple clonal tumor subpopulations, which may occupy the same sectors, or separate anatomic locations. In polygenomic tumors, we show that heterogeneity can be ascribed to a few clonal subpopulations, rather than a series of gradual intermediates. By comparing multiple subpopulations from different anatomic locations, we have inferred pathways of cancer progression and the organization of tumor growth.
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Krasnitz, A
(författare)
-
Rodgers, L
(författare)
-
Cook, K
(författare)
-
Meth, J
(författare)
-
Kendall, J
(författare)
-
Riggs, M
(författare)
-
Eberling, Y
(författare)
-
Troge, J
(författare)
-
Grubor, V
(författare)
-
Levy, D
(författare)
-
Lundin, P
(författare)
-
Maner, SKarolinska Institutet
(författare)
-
Zetterberg, AKarolinska Institutet
(författare)
-
Hicks, J
(författare)
-
Wigler, M
(författare)
-
Karolinska Institutet
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:Genome research: Cold Spring Harbor Laboratory20:1, s. 68-801549-54691088-9051
Internetlänk
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Navin, N
-
Krasnitz, A
-
Rodgers, L
-
Cook, K
-
Meth, J
-
Kendall, J
-
visa fler...
-
Riggs, M
-
Eberling, Y
-
Troge, J
-
Grubor, V
-
Levy, D
-
Lundin, P
-
Maner, S
-
Zetterberg, A
-
Hicks, J
-
Wigler, M
-
visa färre...
- Artiklar i publikationen
-
Genome research
- Av lärosätet
-
Karolinska Institutet