SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:prod.swepub.kib.ki.se:136551013"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:prod.swepub.kib.ki.se:136551013" > Meta-signature of h...

  • Altmae, S (författare)

Meta-signature of human endometrial receptivity: a meta-analysis and validation study of transcriptomic biomarkers

  • Artikel/kapitelEngelska2017

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2017-08-30
  • Springer Science and Business Media LLC,2017

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:prod.swepub.kib.ki.se:136551013
  • http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:136551013URI
  • https://doi.org/10.1038/s41598-017-10098-3DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Previous transcriptome studies of the human endometrium have revealed hundreds of simultaneously up- and down-regulated genes that are involved in endometrial receptivity. However, the overlap between the studies is relatively small, and we are still searching for potential diagnostic biomarkers. Here we perform a meta-analysis of endometrial-receptivity associated genes on 164 endometrial samples (76 from ‘pre-receptive’ and 88 from mid-secretory, ‘receptive’ phase endometria) using a robust rank aggregation (RRA) method, followed by enrichment analysis, and regulatory microRNA prediction. We identify a meta-signature of endometrial receptivity involving 57 mRNA genes as putative receptivity markers, where 39 of these we confirm experimentally using RNA-sequencing method in two separate datasets. The meta-signature genes highlight the importance of immune responses, the complement cascade pathway and the involvement of exosomes in mid-secretory endometrial functions. Bioinformatic prediction identifies 348 microRNAs that could regulate 30 endometrial-receptivity associated genes, and we confirm experimentally the decreased expression of 19 microRNAs with 11 corresponding up-regulated meta-signature genes in our validation experiments. The 57 identified meta-signature genes and involved pathways, together with their regulatory microRNAs could serve as promising and sought-after biomarkers of endometrial receptivity, fertility and infertility.

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Koel, M (författare)
  • Vosa, U (författare)
  • Adler, P (författare)
  • Suhorutsenko, M (författare)
  • Laisk-Podar, T (författare)
  • Kukushkina, V (författare)
  • Saare, M (författare)
  • Velthut-Meikas, A (författare)
  • Krjutskov, K (författare)
  • Aghajanova, L (författare)
  • Lalitkumar, PGKarolinska Institutet (författare)
  • Gemzell-Danielsson, KKarolinska Institutet (författare)
  • Giudice, L (författare)
  • Simon, C (författare)
  • Salumets, A (författare)
  • Karolinska Institutet (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Scientific reports: Springer Science and Business Media LLC7:1, s. 10077-2045-2322

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy