Sökning: onr:"swepub:oai:prod.swepub.kib.ki.se:141113030" >
Community assessmen...
Community assessment to advance computational prediction of cancer drug combinations in a pharmacogenomic screen
-
Menden, MP (författare)
-
Wang, D (författare)
-
Mason, MJ (författare)
-
visa fler...
-
Szalai, B (författare)
-
Bulusu, KC (författare)
-
Guan, YF (författare)
-
Yu, T (författare)
-
Kang, J (författare)
-
Jeon, M (författare)
-
Wolfinger, R (författare)
-
Nguyen, T (författare)
-
Zaslavskiy, M (författare)
-
Jang, IS (författare)
-
Ghazoui, Z (författare)
-
Ahsen, ME (författare)
-
Vogel, R (författare)
-
Neto, EC (författare)
-
Norman, T (författare)
-
Tang, EKY (författare)
-
Garnett, MJ (författare)
-
Di Veroli, GY (författare)
-
Fawell, S (författare)
-
Stolovitzky, G (författare)
-
Guinney, J (författare)
-
Dry, JR (författare)
-
Saez-Rodriguez, J (författare)
-
Abante, J (författare)
-
Abecassis, BS (författare)
-
Aben, N (författare)
-
Aghamirzaie, D (författare)
-
Aittokallio, T (författare)
-
Akhtari, FS (författare)
-
Al-lazikani, B (författare)
-
Alam, T (författare)
-
Allam, A (författare)
-
Allen, C (författare)
-
de Almeida, MP (författare)
-
Altarawy, D (författare)
-
Alves, V (författare)
-
Amadoz, A (författare)
-
Anchang, B (författare)
-
Antolin, AA (författare)
-
Ash, JR (författare)
-
Aznar, VR (författare)
-
Ba-alawi, W (författare)
-
Bagheri, M (författare)
-
Bajic, V (författare)
-
Ball, G (författare)
-
Ballester, PJ (författare)
-
Baptista, D (författare)
-
Bare, C (författare)
-
Bateson, M (författare)
-
Bender, A (författare)
-
Bertrand, D (författare)
-
Wijayawardena, B (författare)
-
Boroevich, KA (författare)
-
Bosdriesz, E (författare)
-
Bougouffa, S (författare)
-
Bounova, G (författare)
-
Brouwer, T (författare)
-
Bryant, B (författare)
-
Calaza, M (författare)
-
Calderone, A (författare)
-
Calza, S (författare)
-
Capuzzi, S (författare)
-
Carbonell-Caballero, J (författare)
-
Carlin, D (författare)
-
Carter, H (författare)
-
Castagnoli, L (författare)
-
Celebi, R (författare)
-
Cesareni, G (författare)
-
Chang, H (författare)
-
Chen, GC (författare)
-
Chen, HR (författare)
-
Chen, HY (författare)
-
Cheng, LJ (författare)
-
Chernomoretz, A (författare)
-
Chicco, D (författare)
-
Cho, KH (författare)
-
Cho, S (författare)
-
Choi, D (författare)
-
Choi, J (författare)
-
Choi, K (författare)
-
Choi, M (författare)
-
De Cock, M (författare)
-
Coker, E (författare)
-
Cortes-Ciriano, I (författare)
-
Cserzo, M (författare)
-
Cubuk, C (författare)
-
Curtis, C (författare)
-
Van Daele, D (författare)
-
Dang, CC (författare)
-
Dijkstra, T (författare)
-
Dopazo, J (författare)
-
Draghici, S (författare)
-
Drosou, A (författare)
-
Dumontier, M (författare)
-
Ehrhart, F (författare)
-
Eid, FE (författare)
-
ElHefnawi, M (författare)
-
Elmarakeby, H (författare)
-
van Engelen, B (författare)
-
Engin, HB (författare)
-
de Esch, I (författare)
-
Evelo, C (författare)
-
Falcao, AO (författare)
-
Farag, S (författare)
-
Fernandez-Lozano, C (författare)
-
Fisch, K (författare)
-
Flobak, A (författare)
-
Fornari, C (författare)
-
Foroushani, ABK (författare)
-
Fotso, DC (författare)
-
Fourches, D (författare)
-
Friend, S (författare)
-
Frigessi, A (författare)
-
Gao, F (författare)
-
Gao, XT (författare)
-
Gerold, JM (författare)
-
Gestraud, P (författare)
-
Ghosh, S (författare)
-
Gillberg, J (författare)
-
Godoy-Lorite, A (författare)
-
Godynyuk, L (författare)
-
Godzik, A (författare)
-
Goldenberg, A (författare)
-
- Gomez-Cabrero, D (författare)
- Karolinska Institutet
-
Gonen, M (författare)
-
de Graaf, C (författare)
-
Gray, H (författare)
-
Grechkin, M (författare)
-
Guimera, R (författare)
-
Guney, E (författare)
-
Haibe-Kains, B (författare)
-
Han, Y (författare)
-
Hase, T (författare)
-
He, D (författare)
-
He, LY (författare)
-
Heath, LS (författare)
-
Hellton, KH (författare)
-
Helmer-Citterich, M (författare)
-
Hidalgo, MR (författare)
-
Hidru, D (författare)
-
Hill, SM (författare)
-
Hochreiter, S (författare)
-
Hong, S (författare)
-
Hovig, E (författare)
-
Hsueh, YC (författare)
-
Hu, ZY (författare)
-
Huang, JK (författare)
-
Huang, RS (författare)
-
Hunyady, L (författare)
-
Hwang, J (författare)
-
Hwang, TH (författare)
-
Hwang, W (författare)
-
Hwang, Y (författare)
-
Isayev, O (författare)
-
Walk, OBD (författare)
-
Jack, J (författare)
-
Jahandideh, S (författare)
-
Ji, JD (författare)
-
Jo, Y (författare)
-
Kamola, PJ (författare)
-
Kanev, GK (författare)
-
Karacosta, L (författare)
-
Karimi, M (författare)
-
Kaski, S (författare)
-
Kazanov, M (författare)
-
Khamis, AM (författare)
-
Khan, SA (författare)
-
- Kiani, NA (författare)
- Karolinska Institutet
-
Kim, A (författare)
-
Kim, J (författare)
-
Kim, J (författare)
-
Kim, K (författare)
-
Kim, K (författare)
-
Kim, S (författare)
-
Kim, Y (författare)
-
Kim, Y (författare)
-
Kirk, PDW (författare)
-
Kitano, H (författare)
-
Klambauer, G (författare)
-
Knowles, D (författare)
-
Ko, M (författare)
-
Kohn-Luque, A (författare)
-
Kooistra, AJ (författare)
-
Kuenemann, MA (författare)
-
Kuiper, M (författare)
-
Kurz, C (författare)
-
Kwon, M (författare)
-
van Laarhoven, T (författare)
-
Laegreid, A (författare)
-
Lederer, S (författare)
-
Lee, H (författare)
-
Lee, J (författare)
-
Lee, YW (författare)
-
Leppaho, E (författare)
-
Lewis, R (författare)
-
Li, J (författare)
-
Li, L (författare)
-
Liley, J (författare)
-
Lim, WK (författare)
-
Lin, C (författare)
-
Liu, YY (författare)
-
Lopez, Y (författare)
-
Low, J (författare)
-
Lysenko, A (författare)
-
Machado, D (författare)
-
Madhukar, N (författare)
-
De Maeyer, D (författare)
-
Malpartida, AB (författare)
-
Mamitsuka, H (författare)
-
- Marabita, F (författare)
- Karolinska Institutet
-
Marchal, K (författare)
-
Marttinen, P (författare)
-
Mason, D (författare)
-
Mazaheri, A (författare)
-
Mehmood, A (författare)
-
Mehreen, A (författare)
-
Michaut, M (författare)
-
Miller, RA (författare)
-
Mitsopoulos, C (författare)
-
Modos, D (författare)
-
Van Moerbeke, M (författare)
-
Moo, K (författare)
-
Motsinger-Reif, A (författare)
-
Movva, R (författare)
-
Muraru, S (författare)
-
Muratov, E (författare)
-
Mushthofa, M (författare)
-
Nagarajan, N (författare)
-
Nakken, S (författare)
-
Nath, A (författare)
-
Neuvial, P (författare)
-
Newton, R (författare)
-
Ning, Z (författare)
-
De Niz, C (författare)
-
Oliva, B (författare)
-
Olsen, C (författare)
-
Palmeri, A (författare)
-
Panesar, B (författare)
-
Papadopoulos, S (författare)
-
Park, J (författare)
-
Park, S (författare)
-
Park, S (författare)
-
Pawitan, Y (författare)
-
Peluso, D (författare)
-
Pendyala, S (författare)
-
Peng, J (författare)
-
Perfetto, L (författare)
-
Pirro, S (författare)
-
Plevritis, S (författare)
-
Politi, R (författare)
-
Poon, H (författare)
-
Porta, E (författare)
-
Prellner, I (författare)
-
Preuer, K (författare)
-
Pujana, MA (författare)
-
Ramnarine, R (författare)
-
Reid, JE (författare)
-
Reyal, F (författare)
-
Richardson, S (författare)
-
Ricketts, C (författare)
-
Rieswijk, L (författare)
-
Rocha, M (författare)
-
Rodriguez-Gonzalvez, C (författare)
-
Roell, K (författare)
-
Rotroff, D (författare)
-
de Ruiter, JR (författare)
-
Rukawa, P (författare)
-
Sadacca, B (författare)
-
Safikhani, Z (författare)
-
Safitri, F (författare)
-
Sales-Pardo, M (författare)
-
Sauer, S (författare)
-
Schlichting, M (författare)
-
Seoane, JA (författare)
-
Serra, J (författare)
-
- Shang, MM (författare)
- Karolinska Institutet
-
Sharma, A (författare)
-
Sharma, H (författare)
-
Shen, Y (författare)
-
Shiga, M (författare)
-
Shin, M (författare)
-
Shkedy, Z (författare)
-
Shopsowitz, K (författare)
-
Sinai, S (författare)
-
Skola, D (författare)
-
Smirnov, P (författare)
-
Soerensen, IF (författare)
-
Soerensen, P (författare)
-
Song, JH (författare)
-
Song, SO (författare)
-
Soufan, O (författare)
-
Spitzmueller, A (författare)
-
Steipe, B (författare)
-
Suphavilai, C (författare)
-
Tamayo, SP (författare)
-
- Tamborero, D (författare)
- Karolinska Institutet
-
Tang, J (författare)
-
Tanoli, ZUR (författare)
-
Tarres-Deulofeu, M (författare)
-
- Tegner, J (författare)
- Karolinska Institutet
-
Thommesen, L (författare)
-
Tonekaboni, SAM (författare)
-
Tran, H (författare)
-
De Troyer, E (författare)
-
Truong, A (författare)
-
Tsunoda, T (författare)
-
Turu, G (författare)
-
Tzeng, GY (författare)
-
Verbeke, L (författare)
-
Videla, S (författare)
-
Vis, D (författare)
-
Voronkov, A (författare)
-
Votis, K (författare)
-
Wang, A (författare)
-
Wang, HQH (författare)
-
Wang, PW (författare)
-
Wang, S (författare)
-
Wang, W (författare)
-
Wang, XC (författare)
-
Wang, X (författare)
-
Wennerberg, K (författare)
-
Wernisch, L (författare)
-
Wessels, L (författare)
-
van Westen, GJP (författare)
-
Westerman, BA (författare)
-
White, SR (författare)
-
Willighagen, E (författare)
-
Wurdinger, T (författare)
-
Xie, L (författare)
-
Xie, SL (författare)
-
Xu, H (författare)
-
Yadav, B (författare)
-
Yau, C (författare)
-
Yeerna, H (författare)
-
Yin, JW (författare)
-
Yu, M (författare)
-
Yu, M (författare)
-
Yun, SJ (författare)
-
Zakharov, A (författare)
-
Zamichos, A (författare)
-
Zanin, M (författare)
-
Zeng, L (författare)
-
Zenil, H (författare)
-
Zhang, F (författare)
-
Zhang, PY (författare)
-
Zhang, W (författare)
-
Zhao, HY (författare)
-
Zhao, L (författare)
-
Zheng, WJ (författare)
-
Zoufir, A (författare)
-
Zucknick, M (författare)
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2019-06-17
- 2019
- Engelska.
-
Ingår i: Nature communications. - : Springer Science and Business Media LLC. - 2041-1723. ; 10:1, s. 2674-
- Relaterad länk:
-
https://www.nature.c...
-
visa fler...
-
http://kipublication...
-
https://doi.org/10.1...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- The effectiveness of most cancer targeted therapies is short-lived. Tumors often develop resistance that might be overcome with drug combinations. However, the number of possible combinations is vast, necessitating data-driven approaches to find optimal patient-specific treatments. Here we report AstraZeneca’s large drug combination dataset, consisting of 11,576 experiments from 910 combinations across 85 molecularly characterized cancer cell lines, and results of a DREAM Challenge to evaluate computational strategies for predicting synergistic drug pairs and biomarkers. 160 teams participated to provide a comprehensive methodological development and benchmarking. Winning methods incorporate prior knowledge of drug-target interactions. Synergy is predicted with an accuracy matching biological replicates for >60% of combinations. However, 20% of drug combinations are poorly predicted by all methods. Genomic rationale for synergy predictions are identified, including ADAM17 inhibitor antagonism when combined with PIK3CB/D inhibition contrasting to synergy when combined with other PI3K-pathway inhibitors in PIK3CA mutant cells.
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Farmaceutiska vetenskaper (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Pharmaceutical Sciences (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Data- och informationsvetenskap -- Bioinformatik (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Computer and Information Sciences -- Bioinformatics (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Menden, MP
-
Wang, D
-
Mason, MJ
-
Szalai, B
-
Bulusu, KC
-
Guan, YF
-
visa fler...
-
Yu, T
-
Kang, J
-
Jeon, M
-
Wolfinger, R
-
Nguyen, T
-
Zaslavskiy, M
-
Jang, IS
-
Ghazoui, Z
-
Ahsen, ME
-
Vogel, R
-
Neto, EC
-
Norman, T
-
Tang, EKY
-
Garnett, MJ
-
Di Veroli, GY
-
Fawell, S
-
Stolovitzky, G
-
Guinney, J
-
Dry, JR
-
Saez-Rodriguez, ...
-
Abante, J
-
Abecassis, BS
-
Aben, N
-
Aghamirzaie, D
-
Aittokallio, T
-
Akhtari, FS
-
Al-lazikani, B
-
Alam, T
-
Allam, A
-
Allen, C
-
de Almeida, MP
-
Altarawy, D
-
Alves, V
-
Amadoz, A
-
Anchang, B
-
Antolin, AA
-
Ash, JR
-
Aznar, VR
-
Ba-alawi, W
-
Bagheri, M
-
Bajic, V
-
Ball, G
-
Ballester, PJ
-
Baptista, D
-
Bare, C
-
Bateson, M
-
Bender, A
-
Bertrand, D
-
Wijayawardena, B
-
Boroevich, KA
-
Bosdriesz, E
-
Bougouffa, S
-
Bounova, G
-
Brouwer, T
-
Bryant, B
-
Calaza, M
-
Calderone, A
-
Calza, S
-
Capuzzi, S
-
Carbonell-Caball ...
-
Carlin, D
-
Carter, H
-
Castagnoli, L
-
Celebi, R
-
Cesareni, G
-
Chang, H
-
Chen, GC
-
Chen, HR
-
Chen, HY
-
Cheng, LJ
-
Chernomoretz, A
-
Chicco, D
-
Cho, KH
-
Cho, S
-
Choi, D
-
Choi, J
-
Choi, K
-
Choi, M
-
De Cock, M
-
Coker, E
-
Cortes-Ciriano, ...
-
Cserzo, M
-
Cubuk, C
-
Curtis, C
-
Van Daele, D
-
Dang, CC
-
Dijkstra, T
-
Dopazo, J
-
Draghici, S
-
Drosou, A
-
Dumontier, M
-
Ehrhart, F
-
Eid, FE
-
ElHefnawi, M
-
Elmarakeby, H
-
van Engelen, B
-
Engin, HB
-
de Esch, I
-
Evelo, C
-
Falcao, AO
-
Farag, S
-
Fernandez-Lozano ...
-
Fisch, K
-
Flobak, A
-
Fornari, C
-
Foroushani, ABK
-
Fotso, DC
-
Fourches, D
-
Friend, S
-
Frigessi, A
-
Gao, F
-
Gao, XT
-
Gerold, JM
-
Gestraud, P
-
Ghosh, S
-
Gillberg, J
-
Godoy-Lorite, A
-
Godynyuk, L
-
Godzik, A
-
Goldenberg, A
-
Gomez-Cabrero, D
-
Gonen, M
-
de Graaf, C
-
Gray, H
-
Grechkin, M
-
Guimera, R
-
Guney, E
-
Haibe-Kains, B
-
Han, Y
-
Hase, T
-
He, D
-
He, LY
-
Heath, LS
-
Hellton, KH
-
Helmer-Citterich ...
-
Hidalgo, MR
-
Hidru, D
-
Hill, SM
-
Hochreiter, S
-
Hong, S
-
Hovig, E
-
Hsueh, YC
-
Hu, ZY
-
Huang, JK
-
Huang, RS
-
Hunyady, L
-
Hwang, J
-
Hwang, TH
-
Hwang, W
-
Hwang, Y
-
Isayev, O
-
Walk, OBD
-
Jack, J
-
Jahandideh, S
-
Ji, JD
-
Jo, Y
-
Kamola, PJ
-
Kanev, GK
-
Karacosta, L
-
Karimi, M
-
Kaski, S
-
Kazanov, M
-
Khamis, AM
-
Khan, SA
-
Kiani, NA
-
Kim, A
-
Kim, J
-
Kim, K
-
Kim, S
-
Kim, Y
-
Kirk, PDW
-
Kitano, H
-
Klambauer, G
-
Knowles, D
-
Ko, M
-
Kohn-Luque, A
-
Kooistra, AJ
-
Kuenemann, MA
-
Kuiper, M
-
Kurz, C
-
Kwon, M
-
van Laarhoven, T
-
Laegreid, A
-
Lederer, S
-
Lee, H
-
Lee, J
-
Lee, YW
-
Leppaho, E
-
Lewis, R
-
Li, J
-
Li, L
-
Liley, J
-
Lim, WK
-
Lin, C
-
Liu, YY
-
Lopez, Y
-
Low, J
-
Lysenko, A
-
Machado, D
-
Madhukar, N
-
De Maeyer, D
-
Malpartida, AB
-
Mamitsuka, H
-
Marabita, F
-
Marchal, K
-
Marttinen, P
-
Mason, D
-
Mazaheri, A
-
Mehmood, A
-
Mehreen, A
-
Michaut, M
-
Miller, RA
-
Mitsopoulos, C
-
Modos, D
-
Van Moerbeke, M
-
Moo, K
-
Motsinger-Reif, ...
-
Movva, R
-
Muraru, S
-
Muratov, E
-
Mushthofa, M
-
Nagarajan, N
-
Nakken, S
-
Nath, A
-
Neuvial, P
-
Newton, R
-
Ning, Z
-
De Niz, C
-
Oliva, B
-
Olsen, C
-
Palmeri, A
-
Panesar, B
-
Papadopoulos, S
-
Park, J
-
Park, S
-
Pawitan, Y
-
Peluso, D
-
Pendyala, S
-
Peng, J
-
Perfetto, L
-
Pirro, S
-
Plevritis, S
-
Politi, R
-
Poon, H
-
Porta, E
-
Prellner, I
-
Preuer, K
-
Pujana, MA
-
Ramnarine, R
-
Reid, JE
-
Reyal, F
-
Richardson, S
-
Ricketts, C
-
Rieswijk, L
-
Rocha, M
-
Rodriguez-Gonzal ...
-
Roell, K
-
Rotroff, D
-
de Ruiter, JR
-
Rukawa, P
-
Sadacca, B
-
Safikhani, Z
-
Safitri, F
-
Sales-Pardo, M
-
Sauer, S
-
Schlichting, M
-
Seoane, JA
-
Serra, J
-
Shang, MM
-
Sharma, A
-
Sharma, H
-
Shen, Y
-
Shiga, M
-
Shin, M
-
Shkedy, Z
-
Shopsowitz, K
-
Sinai, S
-
Skola, D
-
Smirnov, P
-
Soerensen, IF
-
Soerensen, P
-
Song, JH
-
Song, SO
-
Soufan, O
-
Spitzmueller, A
-
Steipe, B
-
Suphavilai, C
-
Tamayo, SP
-
Tamborero, D
-
Tang, J
-
Tanoli, ZUR
-
Tarres-Deulofeu, ...
-
Tegner, J
-
Thommesen, L
-
Tonekaboni, SAM
-
Tran, H
-
De Troyer, E
-
Truong, A
-
Tsunoda, T
-
Turu, G
-
Tzeng, GY
-
Verbeke, L
-
Videla, S
-
Vis, D
-
Voronkov, A
-
Votis, K
-
Wang, A
-
Wang, HQH
-
Wang, PW
-
Wang, S
-
Wang, W
-
Wang, XC
-
Wang, X
-
Wennerberg, K
-
Wernisch, L
-
Wessels, L
-
van Westen, GJP
-
Westerman, BA
-
White, SR
-
Willighagen, E
-
Wurdinger, T
-
Xie, L
-
Xie, SL
-
Xu, H
-
Yadav, B
-
Yau, C
-
Yeerna, H
-
Yin, JW
-
Yu, M
-
Yun, SJ
-
Zakharov, A
-
Zamichos, A
-
Zanin, M
-
Zeng, L
-
Zenil, H
-
Zhang, F
-
Zhang, PY
-
Zhang, W
-
Zhao, HY
-
Zhao, L
-
Zheng, WJ
-
Zoufir, A
-
Zucknick, M
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Farmaceutiska ve ...
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Data och informa ...
-
och Bioinformatik
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Cancer och onkol ...
- Artiklar i publikationen
-
Nature communica ...
- Av lärosätet
-
Karolinska Institutet