Sökning: onr:"swepub:oai:research.chalmers.se:38bfe803-1bea-4b43-9f12-d0ccefeffce9" >
A consensus S. cere...
A consensus S. cerevisiae metabolic model Yeast8 and its ecosystem for comprehensively probing cellular metabolism
-
- Lu, Hongzhong, 1987 (författare)
- Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology
-
- Li, Feiran, 1993 (författare)
- Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology
-
- Sánchez, Benjamín José, 1988 (författare)
- Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology
-
visa fler...
-
- Zhu, Zhengming, 1989 (författare)
- Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology,Jiangnan University
-
- Li, Gang, 1991 (författare)
- Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology
-
- Domenzain Del Castillo Cerecer, Iván, 1991 (författare)
- Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology
-
- Marcisauskas, Simonas, 1988 (författare)
- Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology
-
- Anton, Petre Mihail, 1989 (författare)
- Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology
-
- Lappa, Dimitra, 1988 (författare)
- Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology
-
- Lieven, Christian (författare)
- Danmarks Tekniske Universitet,Technical University of Denmark
-
- Beber, Moritz Emanuel (författare)
- Danmarks Tekniske Universitet,Technical University of Denmark
-
- Sonnenschein, N. (författare)
- Danmarks Tekniske Universitet,Technical University of Denmark
-
- Kerkhoven, Eduard, 1985 (författare)
- Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology
-
- Nielsen, Jens B, 1962 (författare)
- Danmarks Tekniske Universitet,Technical University of Denmark,Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology,BioInnovation Institute (BII)
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2019-08-08
- 2019
- Engelska.
-
Ingår i: Nature Communications. - : Springer Science and Business Media LLC. - 2041-1723 .- 2041-1723. ; 10:1
- Relaterad länk:
-
https://research.cha... (primary) (free)
-
visa fler...
-
https://www.nature.c...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://research.cha...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Genome-scale metabolic models (GEMs) represent extensive knowledgebases that provide a platform for model simulations and integrative analysis of omics data. This study introduces Yeast8 and an associated ecosystem of models that represent a comprehensive computational resource for performing simulations of the metabolism of Saccharomyces cerevisiae––an important model organism and widely used cell-factory. Yeast8 tracks community development with version control, setting a standard for how GEMs can be continuously updated in a simple and reproducible way. We use Yeast8 to develop the derived models panYeast8 and coreYeast8, which in turn enable the reconstruction of GEMs for 1,011 different yeast strains. Through integration with enzyme constraints (ecYeast8) and protein 3D structures (proYeast8DB), Yeast8 further facilitates the exploration of yeast metabolism at a multi-scale level, enabling prediction of how single nucleotide variations translate to phenotypic traits.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Data- och informationsvetenskap -- Bioinformatik (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Computer and Information Sciences -- Bioinformatics (hsv//eng)
- TEKNIK OCH TEKNOLOGIER -- Elektroteknik och elektronik -- Reglerteknik (hsv//swe)
- ENGINEERING AND TECHNOLOGY -- Electrical Engineering, Electronic Engineering, Information Engineering -- Control Engineering (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Data- och informationsvetenskap -- Datavetenskap (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Computer and Information Sciences -- Computer Sciences (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- art (ämneskategori)
- ref (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Lu, Hongzhong, 1 ...
-
Li, Feiran, 1993
-
Sánchez, Benjamí ...
-
Zhu, Zhengming, ...
-
Li, Gang, 1991
-
Domenzain Del Ca ...
-
visa fler...
-
Marcisauskas, Si ...
-
Anton, Petre Mih ...
-
Lappa, Dimitra, ...
-
Lieven, Christia ...
-
Beber, Moritz Em ...
-
Sonnenschein, N.
-
Kerkhoven, Eduar ...
-
Nielsen, Jens B, ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Data och informa ...
-
och Bioinformatik
-
- TEKNIK OCH TEKNOLOGIER
-
TEKNIK OCH TEKNO ...
-
och Elektroteknik oc ...
-
och Reglerteknik
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Data och informa ...
-
och Datavetenskap
- Artiklar i publikationen
-
Nature Communica ...
- Av lärosätet
-
Chalmers tekniska högskola