Sökning: onr:"swepub:oai:research.chalmers.se:5518e747-f651-4a0c-8d97-c926e6bdbc58" >
Linking Genotype an...
-
Madsen, Karina M.Danmarks Tekniske Universitet,Technical University of Denmark
(författare)
Linking Genotype and Phenotype of Saccharomyces cerevisiae Strains Reveals Metabolic Engineering Targets and Leads to Triterpene Hyper-Producers
- Artikel/kapitelEngelska2011
Förlag, utgivningsår, omfång ...
-
2011-03-18
-
Public Library of Science (PLoS),2011
-
electronicrdacarrier
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:research.chalmers.se:5518e747-f651-4a0c-8d97-c926e6bdbc58
-
https://research.chalmers.se/publication/138368URI
-
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0014763DOI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Anmärkningar
-
BackgroundMetabolic engineering is an attractive approach in order to improve the microbial production of drugs. Triterpenes is a chemically diverse class of compounds and many among them are of interest from a human health perspective. A systematic experimental or computational survey of all feasible gene modifications to determine the genotype yielding the optimal triterpene production phenotype is a laborious and time-consuming process.Methodology/Principal FindingsBased on the recent genome-wide sequencing of Saccharomyces cerevisiae CEN.PK 113-7D and its phenotypic differences with the S288C strain, we implemented a strategy for the construction of a β-amyrin production platform. The genes Erg8, Erg9 and HFA1 contained non-silent SNPs that were computationally analyzed to evaluate the changes that cause in the respective protein structures. Subsequently, Erg8, Erg9 and HFA1 were correlated with the increased levels of ergosterol and fatty acids in CEN.PK 113-7D and single, double, and triple gene over-expression strains were constructed.ConclusionsThe six out of seven gene over-expression constructs had a considerable impact on both ergosterol and β-amyrin production. In the case of β-amyrin formation the triple over-expression construct exhibited a nearly 500% increase over the control strain making our metabolic engineering strategy the most successful design of triterpene microbial producers.
Ämnesord och genrebeteckningar
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Udatha, Gupta,1984Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology(Swepub:cth)udatha
(författare)
-
Semba, SaoriUniversity of Tokyo, Japan
(författare)
-
Otero, José Manuel,1979Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology(Swepub:cth)mjose
(författare)
-
Koetter, PeterJohann Wolfgang Goethe Universität Frankfurt am Main,Goethe University Frankfurt
(författare)
-
Nielsen, Jens B,1962Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology(Swepub:cth)nielsenj
(författare)
-
Ebizuka, YutakaUniversity of Tokyo, Japan
(författare)
-
Kushiro, TetsuoUniversity of Tokyo, Japan
(författare)
-
Panagiotou, Gianni,1974Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology(Swepub:cth)gianni
(författare)
-
Danmarks Tekniske UniversitetChalmers tekniska högskola
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:PLoS ONE: Public Library of Science (PLoS)6:3, s. e14763-1932-62031932-6203
Internetlänk
Hitta via bibliotek
-
PLoS ONE
(Sök värdpublikationen i LIBRIS)
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Madsen, Karina M ...
-
Udatha, Gupta, 1 ...
-
Semba, Saori
-
Otero, José Manu ...
-
Koetter, Peter
-
Nielsen, Jens B, ...
-
visa fler...
-
Ebizuka, Yutaka
-
Kushiro, Tetsuo
-
Panagiotou, Gian ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Bioinformatik oc ...
-
- TEKNIK OCH TEKNOLOGIER
-
TEKNIK OCH TEKNO ...
-
och Industriell biot ...
-
och Biokatalys och e ...
-
- TEKNIK OCH TEKNOLOGIER
-
TEKNIK OCH TEKNO ...
-
och Industriell biot ...
-
och Annan industriel ...
- Artiklar i publikationen
-
PLoS ONE
- Av lärosätet
-
Chalmers tekniska högskola