Sökning: onr:"swepub:oai:research.chalmers.se:55343f9e-5856-49f2-8416-6a59aa00bdb8" >
Ultra-fast proteomi...
Ultra-fast proteomics with Scanning SWATH
-
- Messner, Christoph B. (författare)
- Charité Universitätsmedizin Berlin,Charité University Medicine Berlin,The Francis Crick Institute
-
- Demichev, Vadim (författare)
- The Francis Crick Institute,University Of Cambridge,Charité Universitätsmedizin Berlin,Charité University Medicine Berlin
-
Bloomfield, Nic (författare)
-
visa fler...
-
- Yu, Jason S.L. (författare)
- The Francis Crick Institute
-
- White, Matthew (författare)
- The Francis Crick Institute
-
- Kreidl, Marco (författare)
- The Francis Crick Institute
-
- Egger, Anna Sophia (författare)
- The Francis Crick Institute
-
- Freiwald, Anja (författare)
- Charité Universitätsmedizin Berlin,Charité University Medicine Berlin
-
Ivosev, Gordana (författare)
-
Wasim, Fras (författare)
-
- Zelezniak, Aleksej, 1984 (författare)
- Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology,The Francis Crick Institute
-
- Jürgens, Linda (författare)
- Charité Universitätsmedizin Berlin,Charité University Medicine Berlin
-
- Suttorp, Norbert (författare)
- Charité Universitätsmedizin Berlin,Charité University Medicine Berlin
-
- Sander, Leif Erik (författare)
- Charité Universitätsmedizin Berlin,Charité University Medicine Berlin
-
- Kurth, Florian (författare)
- Universitatsklinikum Hamburg-Eppendorf und Medizinische Fakultat,Charité Universitätsmedizin Berlin,Charité University Medicine Berlin
-
- Lilley, Kathryn S. (författare)
- University Of Cambridge
-
- Mülleder, Michael (författare)
- Charité Universitätsmedizin Berlin,Charité University Medicine Berlin
-
Tate, Stephen (författare)
-
- Ralser, M. (författare)
- Charité Universitätsmedizin Berlin,Charité University Medicine Berlin,The Francis Crick Institute
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2021-03-25
- 2021
- Engelska.
-
Ingår i: Nature Biotechnology. - : Springer Science and Business Media LLC. - 1087-0156 .- 1546-1696. ; 39:7, s. 846-854
- Relaterad länk:
-
https://www.nature.c...
-
visa fler...
-
https://research.cha...
-
https://doi.org/10.1...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Accurate quantification of the proteome remains challenging for large sample series and longitudinal experiments. We report a data-independent acquisition method, Scanning SWATH, that accelerates mass spectrometric (MS) duty cycles, yielding quantitative proteomes in combination with short gradients and high-flow (800 µl min ) chromatography. Exploiting a continuous movement of the precursor isolation window to assign precursor masses to tandem mass spectrometry (MS/MS) fragment traces, Scanning SWATH increases precursor identifications by ~70% compared to conventional data-independent acquisition (DIA) methods on 0.5–5-min chromatographic gradients. We demonstrate the application of ultra-fast proteomics in drug mode-of-action screening and plasma proteomics. Scanning SWATH proteomes capture the mode of action of fungistatic azoles and statins. Moreover, we confirm 43 and identify 11 new plasma proteome biomarkers of COVID-19 severity, advancing patient classification and biomarker discovery. Thus, our results demonstrate a substantial acceleration and increased depth in fast proteomic experiments that facilitate proteomic drug screens and clinical studies. –1
Ämnesord
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Farmaceutiska vetenskaper (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Pharmaceutical Sciences (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Kemi -- Analytisk kemi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Chemical Sciences -- Analytical Chemistry (hsv//eng)
- TEKNIK OCH TEKNOLOGIER -- Medicinteknik -- Medicinsk bildbehandling (hsv//swe)
- ENGINEERING AND TECHNOLOGY -- Medical Engineering -- Medical Image Processing (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- art (ämneskategori)
- ref (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Messner, Christo ...
-
Demichev, Vadim
-
Bloomfield, Nic
-
Yu, Jason S.L.
-
White, Matthew
-
Kreidl, Marco
-
visa fler...
-
Egger, Anna Soph ...
-
Freiwald, Anja
-
Ivosev, Gordana
-
Wasim, Fras
-
Zelezniak, Aleks ...
-
Jürgens, Linda
-
Suttorp, Norbert
-
Sander, Leif Eri ...
-
Kurth, Florian
-
Lilley, Kathryn ...
-
Mülleder, Michae ...
-
Tate, Stephen
-
Ralser, M.
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Farmaceutiska ve ...
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Kemi
-
och Analytisk kemi
-
- TEKNIK OCH TEKNOLOGIER
-
TEKNIK OCH TEKNO ...
-
och Medicinteknik
-
och Medicinsk bildbe ...
- Artiklar i publikationen
-
Nature Biotechno ...
- Av lärosätet
-
Chalmers tekniska högskola