Sökning: onr:"swepub:oai:research.chalmers.se:a3371523-91a3-4dae-a750-ae1dac73b5c9" >
In vivo analysis of...
In vivo analysis of the viable microbiota and Helicobacter pylori transcriptome in gastric infection and early stages of carcinogenesis
-
- Thorell, Kaisa, 1983 (författare)
- Karolinska Institutet,Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för mikrobiologi och immunologi,Institute of Biomedicine, Department of Microbiology and Immunology
-
- Bengtsson-Palme, Johan, 1985 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar,CARe - Centrum för antibiotikaresistensforskning,Institute of Biomedicine, Department of Infectious Medicine,Centre for antibiotic resistance research, CARe
-
- Liu, Oscar Hsin Fu (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för mikrobiologi och immunologi,Institute of Biomedicine, Department of Microbiology and Immunology
-
visa fler...
-
- Gonzales, Reyna Victoria Palacios (författare)
- Salud Integral Hospital
-
- Nookaew, Intawat, 1977 (författare)
- Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology
-
- Rabeneck, L. (författare)
- University of Toronto
-
- Paszat, L. (författare)
- University of Toronto
-
- Graham, D. Y. (författare)
- Baylor College of Medicine
-
- Nielsen, Jens B, 1962 (författare)
- Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology
-
- Lundin, Samuel B, 1970 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för mikrobiologi och immunologi,Institute of Biomedicine, Department of Microbiology and Immunology
-
- Sjöling, Åsa, 1968 (författare)
- Karolinska Institutet,Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för mikrobiologi och immunologi,Institute of Biomedicine, Department of Microbiology and Immunology
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2017
- 2017
- Engelska.
-
Ingår i: Infection and Immunity. - 1098-5522 .- 0019-9567. ; 85:10
- Relaterad länk:
-
https://doi.org/10.1...
-
visa fler...
-
https://research.cha...
-
https://gup.ub.gu.se...
-
http://kipublication...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Emerging evidence shows that the human microbiota plays a larger role in disease progression and health than previously anticipated. Helicobacter pylori, the causative agent of gastric cancer and duodenal and gastric ulcers, was early associated with gastric disease, but it has also been proposed that the accompanying microbiota in Helicobacter pylori-infected individuals might affect disease progression and gastric cancer development. In this study, the composition of the transcriptionally active microbial community and H. pylori gene expression were determined using metatranscriptomic RNA sequencing of stomach biopsy specimens from individuals with different H. pylori infection statuses and premalignant tissue changes. The results show that H. pylori completely dominates the microbiota not only in infected individuals but also in most individuals classified as H. pylori uninfected using conventional methods. Furthermore, H. pylori abundance is positively correlated with the presence of Campylobacter, Deinococcus, and Sulfurospirillum. Finally, we quantified the expression of a large number of Helicobacter pylori genes and found high expression of genes involved in pH regulation and nickel transport. Our study is the first to dissect the viable microbiota of the human stomach by metatranscriptomic analysis, and it shows that metatranscriptomic analysis of the gastric microbiota is feasible and can provide new insights into how bacteria respond in vivo to variations in the stomach microenvironment and at different stages of disease progression.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Mikrobiologi inom det medicinska området (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Microbiology in the medical area (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)
Nyckelord
- Atrophic gastritis
- Gastric carcinogenesis
- Stomach microbiota
- Metatranscriptomics
- Helicobacter pylori
Publikations- och innehållstyp
- art (ämneskategori)
- ref (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Thorell, Kaisa, ...
-
Bengtsson-Palme, ...
-
Liu, Oscar Hsin ...
-
Gonzales, Reyna ...
-
Nookaew, Intawat ...
-
Rabeneck, L.
-
visa fler...
-
Paszat, L.
-
Graham, D. Y.
-
Nielsen, Jens B, ...
-
Lundin, Samuel B ...
-
Sjöling, Åsa, 19 ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Mikrobiologi ino ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Cancer och onkol ...
- Artiklar i publikationen
-
Infection and Im ...
- Av lärosätet
-
Chalmers tekniska högskola
-
Göteborgs universitet
-
Karolinska Institutet