Sökning: onr:"swepub:oai:research.chalmers.se:c6ae3f58-7e62-4c4d-ae9c-cbc3a0eade5f" >
Nutritional prefere...
Nutritional preferences of human gut bacteria reveal their metabolic idiosyncrasies
-
- Tramontano, Melanie (författare)
- European Molecular Biology Laboratory
-
- Andrejev, Sergej (författare)
- European Molecular Biology Laboratory
-
- Pruteanu, Mihaela (författare)
- Humboldt-Universität zu Berlin,Humboldt University of Berlin,European Molecular Biology Laboratory
-
visa fler...
-
- Klünemann, Martina (författare)
- European Molecular Biology Laboratory
-
- Kuhn, Michael (författare)
- European Molecular Biology Laboratory
-
- Galardini, Marco (författare)
- Wellcome Trust
-
- Jouhten, Paula, 1978 (författare)
- European Molecular Biology Laboratory
-
- Zelezniak, Aleksej, 1984 (författare)
- Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology,European Molecular Biology Laboratory
-
- Zeller, Georg (författare)
- European Molecular Biology Laboratory
-
- Bork, Peer (författare)
- European Molecular Biology Laboratory,Julius-Maximilians Universität Würzburg,University of Würzburg,Max Delbrueck Centrum Fuer Molekulare Medizin,The Max Delbrück Center for Molecular Medicine
-
- Typas, Athanasios (författare)
- European Molecular Biology Laboratory
-
- Patil, K. R. (författare)
- European Molecular Biology Laboratory
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2018-03-19
- 2018
- Engelska.
-
Ingår i: Nature Microbiology. - : Springer Science and Business Media LLC. - 2058-5276. ; 3:4, s. 514-522
- Relaterad länk:
-
https://doi.org/10.1...
-
visa fler...
-
https://research.cha...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Bacterial metabolism plays a fundamental role in gut microbiota ecology and host-microbiome interactions. Yet the metabolic capabilities of most gut bacteria have remained unknown. Here we report growth characteristics of 96 phylogenetically diverse gut bacterial strains across 4 rich and 15 defined media. The vast majority of strains (76) grow in at least one defined medium, enabling accurate assessment of their biosynthetic capabilities. These do not necessarily match phylogenetic similarity, thus indicating a complex evolution of nutritional preferences. We identify mucin utilizers and species inhibited by amino acids and short-chain fatty acids. Our analysis also uncovers media for in vitro studies wherein growth capacity correlates well with in vivo abundance. Further value of the underlying resource is demonstrated by correcting pathway gaps in available genome-scale metabolic models of gut microorganisms. Together, the media resource and the extracted knowledge on growth abilities widen experimental and computational access to the gut microbiota.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Mikrobiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Microbiology (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Data- och informationsvetenskap -- Bioinformatik (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Computer and Information Sciences -- Bioinformatics (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Mikrobiologi inom det medicinska området (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Microbiology in the medical area (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- art (ämneskategori)
- ref (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Tramontano, Mela ...
-
Andrejev, Sergej
-
Pruteanu, Mihael ...
-
Klünemann, Marti ...
-
Kuhn, Michael
-
Galardini, Marco
-
visa fler...
-
Jouhten, Paula, ...
-
Zelezniak, Aleks ...
-
Zeller, Georg
-
Bork, Peer
-
Typas, Athanasio ...
-
Patil, K. R.
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Mikrobiologi
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Data och informa ...
-
och Bioinformatik
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Mikrobiologi ino ...
- Artiklar i publikationen
-
Nature Microbiol ...
- Av lärosätet
-
Chalmers tekniska högskola