Sökning: onr:"swepub:oai:research.chalmers.se:ca04f4a5-fb3a-41fe-b6e6-4d3dcbad8f22" >
The chimeric nature...
The chimeric nature of the genomes of marine magnetotactic coccoid-ovoid bacteria defines a novel group of Proteobacteria
-
- Ji, Boyang, 1983 (författare)
- Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology
-
- Zhang, S. D. (författare)
- Chinese Academy of Sciences,Centre national de la recherche scientifique (CNRS),Laboratoire de Chimie Bacterienne
-
- Zhang, W. J. (författare)
- Centre national de la recherche scientifique (CNRS),Chinese Academy of Sciences,China Agricultural University,Laboratoire de Chimie Bacterienne
-
visa fler...
-
- Rouy, Z. (författare)
- Université d'Évry Val-d'Essonne,University of Évry Val d'Essonne,Genomique Metabolique,Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
-
- Alberto, F. (författare)
- Laboratoire de Chimie Bacterienne,Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
-
- Santini, C. L. (författare)
- Laboratoire de Chimie Bacterienne,Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
-
- Mangenot, S. (författare)
- Le Commissariat à l’Énergie Atomique et aux Énergies Alternatives (CEA),The French Alternative Energies and Atomic Energy Commission (CEA)
-
- Gagnot, S. (författare)
- Laboratoire de Chimie Bacterienne
-
- Philippe, N. (författare)
- Laboratoire de Chimie Bacterienne,Aix-Marseille Université,Aix Marseille University
-
- Pradel, N. (författare)
- Centre national de la recherche scientifique (CNRS),Aix-Marseille Université,Aix Marseille University
-
- Zhang, L. C. (författare)
- Laboratoire de Chimie Bacterienne
-
- Tempel, S. (författare)
- Laboratoire de Chimie Bacterienne
-
- Li, Y. (författare)
- China Agricultural University,Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
-
- Medigue, C. (författare)
- Université d'Évry Val-d'Essonne,University of Évry Val d'Essonne,Centre national de la recherche scientifique (CNRS),Genomique Metabolique
-
- Henrissat, B. (författare)
- Aix-Marseille Université,Aix Marseille University
-
- Coutinho, P. M. (författare)
- Aix-Marseille Université,Aix Marseille University
-
- Barbe, V. (författare)
- Le Commissariat à l’Énergie Atomique et aux Énergies Alternatives (CEA),The French Alternative Energies and Atomic Energy Commission (CEA)
-
- Talla, E. (författare)
- Laboratoire de Chimie Bacterienne
-
- Wu, L. F. (författare)
- Laboratoire de Chimie Bacterienne,Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2017-02-01
- 2017
- Engelska.
-
Ingår i: Environmental Microbiology. - : Wiley. - 1462-2920 .- 1462-2912. ; 19:3, s. 1103-1119
- Relaterad länk:
-
http://dx.doi.org/10...
-
visa fler...
-
https://research.cha...
-
https://doi.org/10.1...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Magnetotactic bacteria (MTB) are a group of phylogenetically and physiologically diverse Gram-negative bacteria that synthesize intracellular magnetic crystals named magnetosomes. MTB are affiliated with three classes of Proteobacteria phylum, Nitrospirae phylum, Omnitrophica phylum and probably with the candidate phylum Latescibacteria. The evolutionary origin and physiological diversity of MTB compared with other bacterial taxonomic groups remain to be illustrated. Here, we analysed the genome of the marine magneto-ovoid strain MO-1 and found that it is closely related to Magnetococcus marinus MC-1. Detailed analyses of the ribosomal proteins and whole proteomes of 390 genomes reveal that, among the Proteobacteria analysed, only MO-1 and MC-1 have coding sequences (CDSs) with a similarly high proportion of origins from Alphaproteobacteria, Betaproteobacteria, Deltaproteobacteria and Gammaproteobacteria. Interestingly, a comparative metabolic network analysis with anoxic network enzymes from sequenced MTB and non-MTB successfully allows the eventual prediction of an organism with a metabolic profile compatible for magnetosome production. Altogether, our genomic analysis reveals multiple origins of MO-1 and M. marinus MC-1 genomes and suggests a metabolism-restriction model for explaining whether a bacterium could become an MTB upon acquisition of magnetosome encoding genes.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences (hsv//eng)
Nyckelord
- LCB
- apparatus
- France.
- reveals
- magnetosome gene clusters
- RS
- Marseille
- flagellar
- sequence
- phylum nitrospirae
- metabolic networks
- candidatus magnetobacterium
Publikations- och innehållstyp
- art (ämneskategori)
- ref (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Ji, Boyang, 1983
-
Zhang, S. D.
-
Zhang, W. J.
-
Rouy, Z.
-
Alberto, F.
-
Santini, C. L.
-
visa fler...
-
Mangenot, S.
-
Gagnot, S.
-
Philippe, N.
-
Pradel, N.
-
Zhang, L. C.
-
Tempel, S.
-
Li, Y.
-
Medigue, C.
-
Henrissat, B.
-
Coutinho, P. M.
-
Barbe, V.
-
Talla, E.
-
Wu, L. F.
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
- Artiklar i publikationen
-
Environmental Mi ...
- Av lärosätet
-
Chalmers tekniska högskola