SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:research.chalmers.se:e0de8302-fb7a-4a4b-a35a-09d38ee7d1da"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:research.chalmers.se:e0de8302-fb7a-4a4b-a35a-09d38ee7d1da" > Data sharing in Pre...

  • Low, Dorrain YanwenUniversité Clermont Auvergne,Clermont Auvergne University (författare)

Data sharing in PredRet for accurate prediction of retention time: Application to plant food bioactive compounds

  • Artikel/kapitelEngelska2021

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • Elsevier BV,2021
  • electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:research.chalmers.se:e0de8302-fb7a-4a4b-a35a-09d38ee7d1da
  • https://doi.org/10.1016/j.foodchem.2021.129757DOI
  • https://research.chalmers.se/publication/523578URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype
  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype

Anmärkningar

  • Prediction of retention times (RTs) is increasingly considered in untargeted metabolomics to complement MS/MS matching for annotation of unidentified peaks. We tested the performance of PredRet (http://predret.org/) to predict RTs for plant food bioactive metabolites in a data sharing initiative containing entry sets of 29–103 compounds (totalling 467 compounds, >30 families) across 24 chromatographic systems (CSs). Between 27 and 667 predictions were obtained with a median prediction error of 0.03–0.76 min and interval width of 0.33–8.78 min. An external validation test of eight CSs showed high prediction accuracy. RT prediction was dependent on shape and type of LC gradient, and number of commonly measured compounds. Our study highlights PredRet's accuracy and ability to transpose RT data acquired from one CS to another CS. We recommend extensive RT data sharing in PredRet by the community interested in plant food bioactive metabolites to achieve a powerful community-driven open-access tool for metabolomics annotation.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Micheau, PierreUniversité Clermont Auvergne,Clermont Auvergne University (författare)
  • Koistinen, Ville MikaelItä-Suomen Yliopisto,University of Eastern Finland,Turun Yliopisto,University of Turku (författare)
  • Hanhineva, Kati,1972Turun Yliopisto,University of Turku,Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology,Itä-Suomen Yliopisto,University of Eastern Finland(Swepub:cth)kati (författare)
  • Abrankó, László (författare)
  • Rodriguez-Mateos, AnaKing's College London (författare)
  • da Silva, Andreia BentoNova University of Lisbon, Portugal,Universidade de Lisboa,University of Lisbon (författare)
  • Van Poucke, Christof (författare)
  • Almeida, ConceiçãoNova University of Lisbon, Portugal (författare)
  • Andres-Lacueva, CristinaUniversitat de Barcelona,University of Barcelona,Instituto de Salud Carlos III (ISCIII),Institute of Health Carlos III (ISCIII) (författare)
  • Rai, Dilip K.Teagasc - Irish Agriculture and Food Development Authority (författare)
  • Capanoglu, EsraIstanbul Teknik Universitesi (ITÜ),Istanbul Technical University (ITÜ) (författare)
  • Tomás-Barberán, Francisco A.Taif University (författare)
  • Mattivi, FulvioUniversita degli Studi di Trento,University of Trento (författare)
  • Schmidt, GesineNorwegian Institute of Food, Fisheries and Aquaculture Research (Nofima) (författare)
  • Gürdeniz, GözdeKöpenhamns universitet,University of Copenhagen (författare)
  • Valentová, KateřinaChinese Academy of Sciences (författare)
  • Bresciani, LetiziaUniversita degli Studi di Parma,University of Parma (författare)
  • Petrásková, LucieChinese Academy of Sciences (författare)
  • Dragsted, Lars OveKöpenhamns universitet,University of Copenhagen (författare)
  • Philo, Mark (författare)
  • Ulaszewska, Marynka M. (författare)
  • Mena, PedroUniversita degli Studi di Parma,University of Parma (författare)
  • González-Domínguez, RaúlInstituto de Salud Carlos III (ISCIII),Institute of Health Carlos III (ISCIII),Universitat de Barcelona,University of Barcelona (författare)
  • Garcia-Villalba, Rocío (författare)
  • Kamiloglu, SenemIstanbul Teknik Universitesi (ITÜ),Istanbul Technical University (ITÜ),Bursa Uludağ Üniversitesi (författare)
  • de Pascual-Teresa, SoniaCSIC - Instituto de Ciencia y Tecnologia de Alimentos y Nutricion (ICTAN) (författare)
  • Durand, StéphanieUniversité Clermont Auvergne,Clermont Auvergne University (författare)
  • Wiczkowski, WiesławPolish Academy of Sciences (författare)
  • Bronze, MariaNova University of Lisbon, Portugal,Instituto de Biologia Experimental e Tecnologica,Universidade de Lisboa,University of Lisbon (författare)
  • Stanstrup, JanKöpenhamns universitet,University of Copenhagen (författare)
  • Manach, ClaudineUniversité Clermont Auvergne,Clermont Auvergne University (författare)
  • Université Clermont AuvergneItä-Suomen Yliopisto (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Food Chemistry: Elsevier BV3570308-81461873-7072

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy