SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:research.chalmers.se:f193bcf6-21e9-4345-b9ec-e17ba61df171"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:research.chalmers.se:f193bcf6-21e9-4345-b9ec-e17ba61df171" > Homopolymer switche...

  • Kayhanian, HamzehUniversity College London (UCL) (författare)

Homopolymer switches mediate adaptive mutability in mismatch repair-deficient colorectal cancer

  • Artikel/kapitelEngelska2024

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2024
  • electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:research.chalmers.se:f193bcf6-21e9-4345-b9ec-e17ba61df171
  • https://doi.org/10.1038/s41588-024-01777-9DOI
  • https://research.chalmers.se/publication/541850URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype
  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype

Anmärkningar

  • Mismatch repair (MMR)-deficient cancer evolves through the stepwise erosion of coding homopolymers in target genes. Curiously, the MMR genes MutS homolog 6 (MSH6) and MutS homolog 3 (MSH3) also contain coding homopolymers, and these are frequent mutational targets in MMR-deficient cancers. The impact of incremental MMR mutations on MMR-deficient cancer evolution is unknown. Here we show that microsatellite instability modulates DNA repair by toggling hypermutable mononucleotide homopolymer runs in MSH6 and MSH3 through stochastic frameshift switching. Spontaneous mutation and reversion modulate subclonal mutation rate, mutation bias and HLA and neoantigen diversity. Patient-derived organoids corroborate these observations and show that MMR homopolymer sequences drift back into reading frame in the absence of immune selection, suggesting a fitness cost of elevated mutation rates. Combined experimental and simulation studies demonstrate that subclonal immune selection favors incremental MMR mutations. Overall, our data demonstrate that MMR-deficient colorectal cancers fuel intratumor heterogeneity by adapting subclonal mutation rate and diversity to immune selection.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Cross, WilliamUniversity of Westminster,University College London (UCL) (författare)
  • van der Horst, Suzanne E.M.University Medical Center Utrecht (författare)
  • Barmpoutis, PanagiotisUniversity College London (UCL) (författare)
  • Lakatos, Eszter,1990Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology(Swepub:cth)eszterl (författare)
  • Caravagna, GiulioUniversita degli Studi di Trieste,University of Trieste (författare)
  • Zapata, Luis (författare)
  • Van Hoeck, ArneUniversity Medical Center Utrecht (författare)
  • Middelkamp, Sjors (författare)
  • Litchfield, KevinUniversity College London (UCL) (författare)
  • Steele, ChristopherUniversity College London (UCL) (författare)
  • Waddingham, WilliamUniversity College London (UCL) (författare)
  • Patel, DominicUniversity College London (UCL) (författare)
  • Milite, SalvatoreUniversita degli Studi di Trieste,University of Trieste (författare)
  • Jin, ChenUniversity College London (UCL) (författare)
  • Baker, Ann Marie (författare)
  • Alexander, D. C.University College London (UCL) (författare)
  • Khan, KhurumUniversity College London (UCL) (författare)
  • Hochhauser, DanielUniversity College London (UCL) (författare)
  • Novelli, MarcoUniversity College London (UCL) (författare)
  • Werner, Benjamin (författare)
  • van Boxtel, RubenUniversity Medical Center Utrecht (författare)
  • Hageman, Joris H.University Medical Center Utrecht (författare)
  • Buissant des Amorie, Julian R.University Medical Center Utrecht (författare)
  • Linares, Josep (författare)
  • Ligtenberg, Marjolijn J.L.Radboud Universiteit,Radboud University (författare)
  • Nagtegaal, Iris D.Radboud Universiteit,Radboud University (författare)
  • Laclé, Miangela M.University Medical Center Utrecht (författare)
  • Moons, Leon M.G.University Medical Center Utrecht (författare)
  • Brosens, Lodewijk A.A.University Medical Center Utrecht (författare)
  • Pillay, NischalanUniversity College London (UCL) (författare)
  • Sottoriva, Andrea (författare)
  • Graham, Trevor A. (författare)
  • Rodriguez-Justo, ManuelUniversity College London (UCL) (författare)
  • Shiu, Kai KeenUniversity College London (UCL) (författare)
  • Snippert, Hugo J.G.University Medical Center Utrecht (författare)
  • Jansen, MarnixUniversity College London (UCL) (författare)
  • University College London (UCL)University of Westminster (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Nature Genetics56:7, s. 1420 -14331061-4036

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy