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- Roland, P, et al.
(author)
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A database generator for human brain imaging
- 2001
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In: TINS - Trends in Neurosciences. - 0166-2236 .- 1878-108X. ; 24:10, s. 562-564
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Journal article (peer-reviewed)abstract
- Sharing scientific data containing complex information requires new concepts and new technology. NEUROGENERATOR is a database generator for the neuroimaging community. A database generator is a database that generates new databases. The scientists submit raw PET and fMRI data to NEUROGENERATOR, which then processes the data in a uniform way to create databases of homogenous data suitable for data sharing, met-analysis and modelling the human brain at the systems level. These databases are then distributed to the scientists.
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- Banhart, S., et al.
(author)
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Identification of a new Association between Genogroup G10557 (G7072) and Cefixime Resistance by means of molecular Typing of Neisseria gonorrhoeae Isolates in Germany (2014-2017)
- 2021
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In: Der Hautarzt. - : Springer. - 0017-8470 .- 1432-1173. ; 72:Suppl. 1, s. S8-S9
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Journal article (other academic/artistic)abstract
- Hintergrund/Fragestellung: Die Behandlung von Neisseria gonorrhoeae-Infektionen ist aufgrund sich neu entwickelnder Antibiotikaresistenzen gefährdet. Folglich sind Surveillance-Programme zur Beschreibung der antimikrobiellen Resistenz (AMR) und molekularen Epidemiologie bei Gonokokken auf nationaler und internationaler Ebene dringend erfor-derlich. In Deutschland wurde hierfür im Jahr 2013 das Gonokokken-Resistenznetzwerk (GORENET) etabliert. Unser Ziel war es, die geneti-sche Diversität von N. gonorrhoeae-Isolaten in Deutschland von 2014 bis 2017 mittels NG-MAST (N. gonorrhoeae multi-antigen sequence typing) zu beschreiben.Methoden: N. gonorrhoeae-Isolate aus den Jahren 2014–2017 (n=1220; 106 aus 2014, 122 aus 2015, 511 aus 2016 und 481 aus 2017) wurden deutschlandweit eingesandt und mittels AMR-Testung und NG-MAST charakterisiert.Ergebnisse: 88,4% aller Isolate stammten von Männern, 11,2% von Frauen. Das mediane Alter lag bei 32 Jahren (Interquartalsabstand; IQA: 25–44 Jahre). Insgesamt wurden 432 verschiedene NG-MAST-Sequenztypen (STs) einschließlich 146 neuer STs detektiert. Daraus resultieren 17 verschiedene Genogruppen, welche 59,2% aller Isolate beinhalten. Genogruppen G1407 und G10557 (G7072) waren signifikant mit Cefixim-Resistenz assoziiert. Dabei sank der Anteil dieser Genogruppen von 2014–2017 von 14,2 auf 6,2% (G1407) bzw. von 6,6 auf 3,1% (G10557 (G7072)),wohingegen der Anteil mehrerer Cefixim-empfindlicher Genogruppen (G11461, von 0,0 auf 5,6%; G17420, von 0,0 auf 5,0%; und G5441, von 0,9 und 4,8%) im gleichen Zeitraum anstieg.Schlussfolgerungen: In dieser Arbeit beschreiben wir Neisseria gonorrhoeae in Deutschland als eine genetisch diverse und variable Population und identifizieren eine neue Assoziation zwischen Genogruppe G10557 (G7072) und Cefixim-Resistenz. Diese Ergebnisse unterstreichen die Bedeutung der AMR-Überwachung auf der detaillierten Ebene molekularer Typisierung. Darüber hinaus deuten unsere Daten darauf hin, dass es mit Einführung einer dualen Therapie aus Ceftriaxon und Azithromycin und dem konsekutiv verminderten Einsatz von Cefixim zu einem Rückgang von Cefixim-resistenten Stämmen gekommen ist.
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- Warnke, C, et al.
(author)
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An assay to quantify species-specific anti-JC virus antibody levels in MS patients
- 2013
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In: Multiple sclerosis (Houndmills, Basingstoke, England). - : SAGE Publications. - 1477-0970 .- 1352-4585. ; 19:9, s. 1137-1144
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Journal article (peer-reviewed)abstract
- The StratifyJCV® test is a qualitative assay to classify MS patients as anti-JC virus (JCV) antibody positive or negative. Quantification of anti-JCV antibody levels in serum and cerebrospinal fluid (CSF) of multiple sclerosis (MS) patients might add to the progressive multifocal leukoencephalopathy (PML) risk assessment.Objective:The objective of this study is to test sera of patients in a quantitative anti-JCV antibody assay, and to compare the results with preexisting data from the StratifyJCV® test.Methods:Sera of a total of 175 MS patients and matched non-MS-controls were tested for anti-JCV antibodies using glutathione S-transferase-tagged-VP1 as antigen. Antibody reactivity was quantified in arbitrary units using human immunoglobulin as standard.Results:The comparison of our assay with StratifyJCV® showed good inter-assay agreement (kappa 0.6), and strong correlation for antibody reactivity ( r2= 0.94). Discordant samples had low-reactive positivity, and a higher proportion (13% vs. 4%) tested positive in the StratifyJCV® test only.Conclusions:The method presented is a tool for the reliable quantification of anti-JCV antibodies, which demonstrates good agreement with results from StratifyJCV®. In contrast to StratifyJCV®, we pre-adsorbed all of the sera with BK virus (BKV) VP1 protein to reduce cross-reactivity. This step may account for a higher species-specificity of our assay. As such, our assay might be a promising additional tool for PML risk assessment.
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