| 1. |
- Ejhed, Heléne, et al.
(author)
-
Näringsbelastningen på Östersjön och Västerhavet 2014 : Sveriges underlag till Helcoms sjätte Pollution Load Compilation
- 2016
-
Reports (other academic/artistic)abstract
- Denna rapport presenterar den senaste mest detaljerade och tillförlitliga bedömningen av närsaltsbelastning från svenska källor som hittills genomförts. Denna rapport, tillsammans med underlagsrapporter, redovisar resultat, underlagsdata, och beräkningsmetoder på detaljnivå för att uppnå transparens och spårbarhet samt för att möjliggöra vidareanvändning i arbetet inom svensk vattenförvaltning.Havs- och vattenmyndigheten har gett SMED1 i uppdrag att genomföra beräkningar av källor till kväve- och fosforbelastning avseende år 2014 på sjöar, vattendrag och havet för hela Sverige. Syftet var att ge underlag till Sveriges rapportering till Helcom ”Pollution Load Compilation 6 - PLC6” samt till vattenförvaltningens arbete i Sverige. Liknande beräkningar har genomförts tidigare men aldrig med så hög upplösning i flera av underlagen. Arbetet innebär att stora mängder data har bearbetats och beräknats för att ge heltäckande information för hela Sverige fördelat på cirka 23 000 vattenförekomstområden. Den ökade upplösningen, tillsammans med bättre kvalitet på indata och nyutvecklade beräkningsrutiner ger bättre tillförlitlighet i resultaten av total belastning även på lokal nivå. Utvecklingen som genomförts kommer att ligga till grund för nästa belastningsrapportering, PLC 7, samt den fördjupade uppföljningen av miljökvalitetsmålet Ingen övergödning (FUT) och framtida arbeten inom havs- och vattenförvaltningen.De nya beräkningarna bygger på nya högupplösta markanvändnings- och jordartskartor, nya underlag avseende rening i små avloppsanläggningar och dagvatten samt en ny höjddatabas (2 meters upplösning). Höjddatabasen har använts för beräkning av markens lutning, vilket har stor betydelse för fosforläckaget. Nya mätningar i skogsområden i sydvästra Sverige har lett till en bättre beskrivning av skogsmarkens läckage och att en ny modell för beräkning av näringsämnesretentionen har tagits fram. Dessa förfinade indata och förbättrade beräkningsverktyg gör att resultaten är säkrare även på lokal skala eller för enskilda vattenförekomster.Resultaten är tillgängliga för alla via webbverktyget Tekniskt Beräkningssystem Vatten (TBV, tbv.smhi.se). Resultaten presenteras som brutto- samt nettobelastning. Bruttobelastning är den mängd näringsämnen som släpps ut vid källan till ett vattendrag eller sjö från till exempel ett avloppsreningsverk eller ett jordbruksfält. Nettobelastning är den del av bruttobelastningen som når havet. Dessutom presenteras resultat som antropogen- och totalbelastning. Antropogen belastning kommer från mänskliga aktiviteter, såsom odling av jordbruksmark eller industriutsläpp. Totalbelastning är summan av antropogen belastning och bakgrundsbelastning, den naturliga belastning som skulle ske oberoende av människan. Avgränsningen mellan vad som är bakgrundsbelastning och antropogen belastning har baserats på Helcoms definition och all markanvändning bidrar med en naturlig belastning samt eventuell antropogen belastning. Till exempel anses belastning från mark bevuxen med skog helt vara bakgrund, medan belastningen från hygge och jordbruksmark anses vara en summa av bakgrund och antropogen belastning. I resultat där antropogen belastning presenteras, så har bakgrundsbelastningen tagits bort.Jordbruks- and skogsmark är de två största källorna till den totala belastningen på havet för både kväve och fosfor, med 34 100 respektive 34 900 ton kväve, samt 1 130 resp. 850 ton fosfor år 2014. Tillsammans står dessa källor för cirka 60 % av den totala belastningen. Av den antropogena belastningen står jordbruket för den största andelen (23 300 ton samt 460 ton fosfor), följt av utsläpp från avloppsreningsverk (14 000 ton kväve samt 240 ton fosfor). Belastningen från skogsmark ingår enbart i bakgrund och den antropogena belastningen från hyggen bidrar endast med 1500 ton kväve och 20 ton fosfor Bottenhavet, Egentliga Östersjön och Kattegatt är de bassänger som tar emot mest kväve av Sveriges totala belastning på havet (29 500 ton, 29 400 ton respektive 28 700 ton, vilket motsvarar cirka 25 % vardera). I Bottenhavet är dock en stor del av belastningen naturlig bakgrundsbelastning. Egentliga Östersjön och Kattegatt tar emot mest av Sveriges antropogena belastning, 33 % respektive 31 %. I jämförelse mellan vilka havsbassänger som är mest belastade av fosfor, så är det Bottenhavet som tar emot mest (990 ton eller 30 % av den totala belastningen). Strax under en fjärdedel av Sveriges totala belastning på havet, belastar Egentliga Östersjön (780 ton) och omkring en femtedel belastar Kattegatt och Bottenviken (680 respektive 630 ton). Aktionsplanen för Östersjön (Baltic Sea Action Plan, BSAP) anger utsläppsmål, med syfte att nå God miljöstatus i Östersjön och Kattegatt. För fosfor är målet uppnått i alla bassänger utom Egentliga Östersjön, där det är ett utmanande mål och det kommer att bli mycket svårt att minska fosforbelastningen under belastningstaket (308 ton). Det krävs omfattande åtgärder av de antropogena källorna, och dessutom utgör bakgrundsbelastningen en betydande del av den totala belastningen. Total nettobelastning av fosfor till Egentliga Östersjön är 780 ton enligt dessa beräkningar, varav 370 ton är beräknat som bakgrundsbelastning. Det innebär att åtgärder måste minska även bakgrundsbelastningen, t.ex. genom skapande av våtmarker. För att Egentliga Östersjön ska kunna uppnå god miljöstatus med avseende på övergödning kommer det även att behövas åtgärder i Östersjöns andra delbassänger.På grund av stora skillnader i metoder och indata, är det inte möjligt att direkt jämföra hur belastningen har ändrats sedan PLC 5 och den fördjupade uppföljningen av miljökvalitetsmålet Ingen övergödning. Som exempel har arealen jordbruksmark minskat med omkring 1900 km2 sedan tidigare sammanställningar, och det har lett till minskat näringsämnesläckage. Storleksordningen på denna minskning kan i nuläget inte utläsas från beräkningarna eftersom de är gjorda med förfinad underlagsinformation jämfört med tidigare år. Faktum är att vid en direkt jämförelse mellan belastning år 2006 (PLC5) och år 2011 (FUT) så är den totala fosforbelastningen från jordbruksmarken högre år 2014 (PLC6) jämfört med Havs- och vattenmyndighetens rapport 2016:12 10 tidigare. Samtidigt visar de nya beräkningarna på att den antropogena delen är lägre än vad som tidigare beräknats. Det krävs omräkningar av gamla PLCdata med den nya metoden för att få klarhet i hur mycket av dessa ändringar som beror på åtgärder inom jordbruket och hur mycket som är på grund av förfinade indata och förbättrade metoder. Belastningen från punktkällorna beräknas på samma sätt som förr och där är det tydligt att utsläppen till havet har minskat. I PLC6 (år 2014) stod avloppsreningsverk för 240 ton fosfor samt 14 000 ton kväve, medan i PLC5 (2006) var belastningen 350 ton fosfor- samt 17 000 ton kvävebelastning (netto). Industrier har också minskat sin belastning på havet och svarar nu för 250 ton fosfor samt 3 800 ton kväve, jämfört med 320 fosfor och 4 800 ton kväve år 2006.
|
|
| 2. |
- Gyarmati, Péter, et al.
(author)
-
Universal detection of hepatitis E virus by two real-time PCR assays : TaqMan((R)) and Primer-Probe Energy Transfer
- 2007
-
In: Journal of Virological Methods. - : Elsevier BV. - 0166-0934 .- 1879-0984. ; 146:1-2, s. 226-235
-
Journal article (peer-reviewed)abstract
- Hepatitis E virus (HEV) is a major cause of food- and waterborne diseases in countries with poor sanitation. Furthermore, travellers to such countries are also at risk of contracting the virus. Noteworthily, during the last decade an increasing number of non-travel-related cases were recorded even in countries with high sanitary standards. An alternative, direct route of infection, from animals to humans (zoonotic transmission) is suspected to be the cause of recent cases of hepatitis E. In order to provide rapid and sensitive methods for detecting the virus in various hosts, two real-time PCR methods were developed and compared: a TaqMan (R) and Primer-Probe Energy Transfer (PriProET) assay. These highly sensitive novel methods provide valuable diagnostic tools to investigate zoonotic transmission, to detect the virus in the food chain and in research related to the potential of hepatitis E virus to cross the species barrier. The results show that the two novel PCR assays are robust, highly sensitive and specific for broad range detection of the four genotypes of HEV. Compared to PriProET, the TaqMan (R) assay appears to perform slightly better, with higher fluorescence values for positive samples. However, the PriProET has the benefit of better tolerating the point mutations in the target nucleic acids. Thus, it provides a more powerful tool to detect new virus variants. These new molecular diagnostic assays are practical tools that can be employed in the area of public health, for disease diagnosis and for tracking outbreaks. In basic research the methods provide new tools to study HEV biology, including virus-host interactions and transmission between various host species.
|
|
| 3. |
- Hansson, Katarina, et al.
(author)
-
Näringsbelastningen på Östersjön och Västerhavet 2017 : Sveriges underlag till HELCOM:s sjunde Pollution Load Compilation
- 2019
-
Reports (other academic/artistic)abstract
- Havs- och vattenmyndigheten har gett SMED i uppdrag att genomföra beräkningar av kväve- och fosforbelastning från olika källor för år 2017 till sjöar, vattendrag och havet för hela Sverige. Syftet är att ge underlag till Sveriges rapportering till HELCOM PLC7 samt till vattenförvaltningens arbete i Sverige. Denna rapport, tillsammans med underlagsrapporter, redovisar resultat, underlagsdata, och beräkningsmetoder på detaljnivå för att uppnå transparens och spårbarhet samt för att möjliggöra vidareanvändning i arbetet inom svensk vattenförvaltning.Beräkningarna genomfördes i så stor utsträckning som möjligt med den metodiken som togs fram inom föregående projekt (PLC6). Arbetet innebär att stora mängder data har bearbetats och beräknats för att ge heltäckande information för hela Sverige fördelat på cirka 24 500 vattenförekomstområden. Resultaten är tillgängliga för alla via webbverktyget Tekniskt Beräkningssystem Vatten (TBV, tbv.smhi.se). Resultaten presenteras som brutto- samt nettobelastning för varje näringskälla, fördelat på total, antropogen och bakgrundsbelastning. Bruttobelastning är den mängd näringsämnen som släpps ut vid källan till ett vattendrag eller sjö. Nettobelastning är den del av bruttobelastningen som når havet. Skillnaden mellan brutto- och nettobelastningen benämns retention. Jordbruks- och skogsmark är de två största källorna till den totala belastningen på havet (nettobelastning) för både kväve och fosfor, med 33 400 respektive 31 670 ton/år kväve, samt 1 010 respektive 870 ton/år fosfor år 2017. Tillsammans står dessa källor för cirka 60 % av den totala belastningen. Av den antropogena belastningen står jordbruket för den största andelen (19 470 ton/år kväve samt 710 ton/år fosfor), följt av utsläpp från avloppsreningsverk (14 050 ton/år kväve samt 230 ton/år fosfor). Belastningen från skogsmark ingår enbart i bakgrund och den antropogena belastningen från hyggen bidrar endast med 1 540 ton/år kväve och 20 ton/år fosfor.Bottenhavet, Egentliga Östersjön och Kattegatt är de bassänger som tar emot mest kväve av Sveriges totala belastning på havet (28 560 ton/år, 26 150 ton/år respektive 27 700 ton/år, vilket motsvarar cirka 25 % vardera). I Bottenhavet är dock en stor del av belastningen naturlig bakgrundsbelastning. Egentliga Östersjön och Kattegatt tar emot mest av Sveriges antropogena belastning av kväve, 30 % respektive 31 %. I jämförelse mellan vilka havsbassänger som är mest belastade av fosfor, så är det Bottenhavet som tar emot mest (1 040 ton/år eller 32 % av den totala belastningen). Strax under en fjärdedel av Sveriges totala belastning på havet, rinner till Egentliga Östersjön (790 ton/år) och omkring en femtedel belastar Bottenviken och Kattegatt (640 respektive 620 ton/år). Aktionsplanen för Östersjön (Baltic Sea Action Plan, BSAP) anger utsläppsmål för alla länder kring Östersjön, med syfte att nå ”God miljöstatus” i Östersjön och Kattegatt. För fosfor är målet uppnått i alla bassänger utom Egentliga Östersjön, där det är ett utmanande mål och det kommer att bli mycket svårt att minska fosforbelastningen under belastningstaket (308 ton/år). Det krävs omfattande åtgärder av de antropogena källorna, men dessutom så utgör bakgrundsbelastningen en betydande del av den totala belastningen. Total nettobelastning av fosfor till Egentliga Östersjön är 790 ton enligt dessa beräkningar, varav 230 ton är beräknat som bakgrundsbelastning. För att Egentliga Östersjön ska kunna uppnå god miljöstatus med avseende på övergödning kommer det även att behövas åtgärder i Östersjöns andra delbassänger. På grund av skillnader i metoder och indata, är det inte möjligt att direkt jämföra hur belastningen från diffusa källor har ändrats sedan PLC6 (2014). En metodikskillnad som särskilt bör noteras är beräkningen av bakgrundsbelastningen av fosfor från jordbruksmark. Beräkningsmetoden för bakgrunden har utvecklats mellan olika PLC-beräkningar, vilket också lett till starkt skiftande resultat för bakgrundsbelastningen. I PLC6-beräkningen blev bakgrundsbelastningen hög eftersom en förändring i modellen visade sig ha gett en förmodad alltför stor förlust av partikulärt fosfor. Detta har korrigerats i den senaste modellversionen (PLC6.5 och PLC7) vilket är en av anledningarna till att bakgrundsbelastningen är lägre i PLC7 än i PLC6. Det är dock viktigt att notera att bakgrundsberäkningen alltid kommer att vara osäker eftersom den dels i mycket stor utsträckning bygger på antaganden och eftersom det dels saknas mätdata för att jämföra beräkningsresultaten med.För att resultaten för de diffusa källorna ska vara jämförbara mellan åren krävs att det görs en omräkning, antingen med gamla PLC-data och med den nya metoden eller med nya data och med den gamla metoden. En sådan omräkning kan bringa klarhet i hur mycket av skillnaden i resultaten som beror av förfinade indata eller förbättrade metoder och hur mycket som beror på implementerade åtgärder för att minska belastningen. Belastningen från punktkällorna beräknas på samma sätt som i PLC6. Utsläppen till havet i PLC 7 (2017) från avloppsreningsverk är ungefär i samma storleksordning som i PLC 6 (år 2014) 230 respektive 240 ton fosfor samt 14 000 ton kväve (netto). Industrier har minskat sin belastning på havet och svarar 2017 för 210 ton fosfor samt 3 320 ton kväve, jämfört med 250 fosfor och 3 800 ton kväve år 2014.
|
|
| 4. |
- Heid, Iris M, et al.
(author)
-
Meta-analysis identifies 13 new loci associated with waist-hip ratio and reveals sexual dimorphism in the genetic basis of fat distribution
- 2010
-
In: Nature Genetics. - : Springer Science and Business Media LLC. - 1061-4036 .- 1546-1718. ; 42:11, s. 949-960
-
Journal article (peer-reviewed)abstract
- Waist-hip ratio (WHR) is a measure of body fat distribution and a predictor of metabolic consequences independent of overall adiposity. WHR is heritable, but few genetic variants influencing this trait have been identified. We conducted a meta-analysis of 32 genome-wide association studies for WHR adjusted for body mass index (comprising up to 77,167 participants), following up 16 loci in an additional 29 studies (comprising up to 113,636 subjects). We identified 13 new loci in or near RSPO3, VEGFA, TBX15-WARS2, NFE2L3, GRB14, DNM3-PIGC, ITPR2-SSPN, LY86, HOXC13, ADAMTS9, ZNRF3-KREMEN1, NISCH-STAB1 and CPEB4 (P = 1.9 × 10⁻⁹ to P = 1.8 × 10⁻⁴⁰) and the known signal at LYPLAL1. Seven of these loci exhibited marked sexual dimorphism, all with a stronger effect on WHR in women than men (P for sex difference = 1.9 × 10⁻³ to P = 1.2 × 10⁻¹³). These findings provide evidence for multiple loci that modulate body fat distribution independent of overall adiposity and reveal strong gene-by-sex interactions.
|
|
| 5. |
- Holmer, Helene, et al.
(author)
-
Improved general and oral health in diabetic patients by an okinawan-based nordic diet : A pilot study
- 2018
-
In: International Journal of Molecular Sciences. - : MDPI AG. - 1661-6596 .- 1422-0067. ; 19:7
-
Journal article (peer-reviewed)abstract
- Periodontal disease, periodontitis as well as the preceding gingivitis, has been associated with both obesity and diabetes. Studies have shown that diet changes can lead to a lower incidence of such inflammation. The aim of the present case series over four weeks was to study the effects on medical and dental conditions in patients with type 2 diabetes of the consumption of the Okinawan-based Nordic Diet (OBND®). Medical and dental examinations were performed to estimate the general health and gingivitis/periodontitis. Serum cytokine levels were assessed using Luminex technology. Eight of ten study participants completed the study. All participants lost weight (p = 0.012). Six out of seven that were treated with insulin could reduce their insulin intake after two weeks with OBND®. The reduction was about 16 units which corresponds to a 34% relative reduction compared to the starting point (range 15–63%). Fasting blood glucose values fell (p = 0.035). Hemoglobin A1c (HbA1c) (p = 0.01), triglycerides (p = 0.05), and low-density lipoprotein (LDL) (p = 0.05) were also reduced. Bleeding on probing changed from ~28% before any dietary changes to ~13% after two weeks with OBND® (p = 0.01). The reduction in gingival bleeding was as substantial as might be expected from one session of professional tooth cleaning. Markers of inflammation were also reduced. The OBND® thus showed significant promise in alleviating the impact of diabetes on dental as well as general health.
|
|
| 6. |
- Lango Allen, Hana, et al.
(author)
-
Hundreds of variants clustered in genomic loci and biological pathways affect human height.
- 2010
-
In: Nature. - : Springer Science and Business Media LLC. - 1476-4687 .- 0028-0836. ; 467:7317, s. 832-8
-
Journal article (peer-reviewed)abstract
- Most common human traits and diseases have a polygenic pattern of inheritance: DNA sequence variants at many genetic loci influence the phenotype. Genome-wide association (GWA) studies have identified more than 600 variants associated with human traits, but these typically explain small fractions of phenotypic variation, raising questions about the use of further studies. Here, using 183,727 individuals, we show that hundreds of genetic variants, in at least 180 loci, influence adult height, a highly heritable and classic polygenic trait. The large number of loci reveals patterns with important implications for genetic studies of common human diseases and traits. First, the 180 loci are not random, but instead are enriched for genes that are connected in biological pathways (P = 0.016) and that underlie skeletal growth defects (P<0.001). Second, the likely causal gene is often located near the most strongly associated variant: in 13 of 21 loci containing a known skeletal growth gene, that gene was closest to the associated variant. Third, at least 19 loci have multiple independently associated variants, suggesting that allelic heterogeneity is a frequent feature of polygenic traits, that comprehensive explorations of already-discovered loci should discover additional variants and that an appreciable fraction of associated loci may have been identified. Fourth, associated variants are enriched for likely functional effects on genes, being over-represented among variants that alter amino-acid structure of proteins and expression levels of nearby genes. Our data explain approximately 10% of the phenotypic variation in height, and we estimate that unidentified common variants of similar effect sizes would increase this figure to approximately 16% of phenotypic variation (approximately 20% of heritable variation). Although additional approaches are needed to dissect the genetic architecture of polygenic human traits fully, our findings indicate that GWA studies can identify large numbers of loci that implicate biologically relevant genes and pathways.
|
|
| 7. |
- Liljeberg, Marcus, et al.
(author)
-
Hantering av kopplingen mellan markanvändning, läckagekoefficienter och avrinning för PLC6
- 2013
-
Reports (other academic/artistic)abstract
- Havs- och vattenmyndigheten har uppdragit åt SMED att beräknanäringsämnesbelastningen till Sveriges omgivande havsbassänger.Uppdraget utgör underlag till HELCOM-rapporteringen Pollution LoadCompilation (PLC Periodical).Inom SMED sker en kontinuerlig utveckling av metoder och modeller föratt förbättra kvalitén på dessa beräkningar. I denna rapport undersöksmöjligheterna att kombinera tidigare framtagen metodik för att beräknakällfördelningen av kväve och fosfor med ny förbättrad beräkning avavrinning genom att utnyttja en redan kalibrerad högupplöst hydrologiskmodell för Sverige, kallad S-HYPE.Den belastning som avses i denna rapport är det diffusa markläckaget somgenereras av olika slags markanvändning, beräknat som en produkt avmarkanvändningsslag och specifik typhalt. S-HYPE har kalibrerats med endefinition av markanvändning som skiljer sig från den markanvändning somanvänts tidigare. För att det ska vara möjligt att använda de typhalter somtagits fram i tidigare beräkningar behöver de olika definitionerna avmarkanvändning relateras till varandra. För test och validering av den nyaavrinningsberäkningen genom en anpassning av tidigare kalibrerad S-HYPEtill SMED – HYPE bedöms skillnader i arealer hos markanvändningen haen försumbar effekt. För en fullständig beräkning av närsaltsläckagebehöver markanvändning däremot harmoniseras.Data om jordbrukets arealer tas i PLC-beräkningarna från jordbruksblockenoch de stödsökta grödorna. I PLC6 ändras metodiken för jordbruksblocksom saknar stödsökta grödor så att dessa beräknas som odefinierade grödormed läckaget för extensiv vall, istället för att de klassas som öppen marksom i PLC5. Om möjligt ska de konstaterade grödarealerna istället för demer preliminära stödsökta arealerna användas.
|
|
| 8. |
- Lin, Jay, et al.
(author)
-
High prevalence of hepatitis E virus in Swedish moose : A phylogenetic characterization and comparison of the virus from different regions
- 2015
-
In: PLoS ONE. - : Public Library of Science (PLoS). - 1932-6203. ; 10:4
-
Journal article (peer-reviewed)abstract
- Background: Hepatitis E virus (HEV) infects a range of species, including humans, pigs, wild boars and deer. Zoonotic transmission may contribute to the high HEV seroprevalence in the human population of many countries. A novel divergent HEV from moose (Alces alces) in Sweden was recently identified by partial genome sequencing. Since only one strain was found, its classification within the HEV family, prevalence in moose and zoonotic potential was unclear. We therefore investigated samples from 231 moose in seven Swedish counties for HEV, and sequenced a near complete moose HEV genome. Phylogenetic analysis to classify this virus within the family Hepeviridae and to explore potential host specific determinants was performed. Methods and Findings: The HEV prevalence of moose was determined by PCR (marker for active infection) and serological assays (marker of past infection) of sera and 51 fecal samples from 231 Swedish moose. Markers of active and past infection were found in 67 (29%) animals, while 34 (15%) were positive for HEV RNA, 43 (19%) were seropositive for anti-HEV antibodies, and 10 (4%) had both markers. The number of young individuals positive for HEV RNA was larger than for older individuals, and the number of anti-HEV antibody positive individuals increased with age. The high throughput sequenced moose HEV genome was 35-60% identical to existing HEVs. Partial ORF1 sequences from 13 moose strains showed high similarity among them, forming a distinct monophyletic clade with a common ancestor to HEV genotype 1-6 group, which includes members known for zoonotic transmission. Conclusions: This study demonstrates a high frequency of HEV in moose in Sweden, with markers of current and past infection demonstrated in 30% of the animals. Moose is thus an important animal reservoir of HEV. The phylogenetic relationship demonstrated that the moose HEV belonged to the genotype 1-6 group, which includes strains that also infect humans, and therefore may signify a potential for zoonotic transmission of this HEV. © 2015 Lin et al.
|
|
| 9. |
- Lin, J., et al.
(author)
-
Novel hepatitis E like virus found in Swedish moose
- 2014
-
In: Journal of General Virology. - : Microbiology Society. - 0022-1317 .- 1465-2099. ; 95:PART3, s. 557-570
-
Journal article (peer-reviewed)abstract
- A novel virus was detected in a sample collected from a Swedish moose (Alces alces). The virus was suggested as a member of the Hepeviridae family, although it was found to be highly divergent from the known four genotypes (gt1-4) of hepatitis E virus (HEV). Moose are regularly hunted for consumption in the whole of Scandinavia. Thus, the finding of this virus may be important from several aspects: (a) as a new diverged HEV in a new animal species, and (b) potential unexplored HEV transmission pathways for human infections. Considering these aspects, we have started the molecular characterization of this virus. A 5.1 kb amplicon was sequenced, and corresponded to the partial ORF1, followed by complete ORF2, ORF3 and poly(A) sequence. In comparison with existing HEVs, the moose HEV genome showed a general nucleotide sequence similarity of 37-63% and an extensively divergent putative ORF3 sequence. The junction region between the ORFs was also highly divergent; however, two putative secondary stem-loop structures were retained when compared to gt1-4, but with altered structural appearance. In the phylogenetic analysis, the moose HEV deviated and formed its own branch between the gt1-4 and other divergent animal HEVs. The characterization of this highly divergent genome provides important information regarding the diversity of HEV infecting various mammalian species. However, further studies are needed to investigate its prevalence in the moose populations and possibly in other host species, including the risk for human infection. © 2014 Statens Veterinarmedicinska Anstalt.
|
|
| 10. |
- Persson, G. Rutger, et al.
(author)
-
Impact of an Okinawa/Nordic based diet on endocrinological and periodontal conditions in individuals with type 2 diabetes. A randomized case–control study
- 2023
-
In: BMC Oral Health. - : BioMed Central Ltd.. - 1472-6831. ; 23:1
-
Journal article (peer-reviewed)abstract
- Objectives: To assess if the results following intake of a diet using an Okinawan-based Nordic diet (OBND) over one month differs in endocrinological, periodontal clinical outcome, and serum cytokine levels compared to a standard hospital care diet in individuals with diabetes type 2 (T2D) (control group). Background: Scientific evidence suggests that the use of diet for individuals with T2D may be beneficial. Methods: Participating individuals with T2D were randomly assigned to a test (OBND) (n = 14), or control group (n = 16). Anthropometric data, blood glucose levels, HbA1c levels, lipids, serum inflammation markers (CRP, and a routine panel of 24 cytokines), blood pressure, gingival bleeding on probing (BOP), probing pocket depths (PPD), and clinical attachment levels (CAL) were studied. Results: Statistical analyses of baseline study data failed to demonstrate study group differences. The mean weight reduction was greater in the OBND group (4.1 kg) versus the control group (1.3 kg) (p < 0.01). The reduction in BMI was 1.4 kg/m2 in OBND (p < 0.001) and 0.5 kg/m2 in the control group, respectively (p < 0.01). Diastolic and systolic blood pressure reductions were greater in the OBND group than in the control group (p < 0.01). Periodontal study parameters (BOP % scores) and (PPD values) decreased (p < 0.001) overall with no between group differences. The OBND resulted in reduction of serum levels of IFNγ, Eotaxin IL-9, IP10,IL17a, MCP-1,m and PDFBB compared to the control diet. Conclusions: A strict T2D- diet provides an association between reduction in serum HbA1c and BOP scores. Serum levels decreases in IFNγ, Eotaxin IL-9, IP-10, IL17a. MCP-1, and PDFBB were only found in the test group.
|
|
