Meta-analysis of genome-wide linkage studies of systemic lupus erythematosus

A genetic contribution to the development of systemic lupus erythematosus (SLE) is well established. Several genome-wide linkage scans have identified a number of putative susceptibility loci for SLE, some of which have been replicated in independent samples. This study aimed to identify the regions showing the most consistent evidence for linkage by applying the genome scan meta-analysis (GSMA) method. The study identified two genome-wide suggestive regions on 6p21.1-q15 and 20p11-q13.13 (P-value=0.0056 and P-value=0.0044, respectively) and a region with P-value<0.01 on 16p13-q12.2.The region on chromosome 6 contains the human leukocyte antigen cluster, and the chromosome 16 and 20 regions have been replicated in several cohorts. The potential importance of the identified genomic regions are also highlighted. These results, in conjunction with data emerging from dense single nucleotide polymorphism typing of specific regions or future genome-wide association studies will help guide efforts to identify the actual predisposing genetic variation contributing to this complex genetic disease.

Gorman, J. D. (författare)
Cleveland, C. (författare)
Kelly, J. A. (författare)
Fisher, S. A. (författare)
Ortmann, W. A. (författare)
Johansson, CeciliaUppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi (författare)
Johanneson, BoUppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi (författare)
Moser, K. L. (författare)
Gaffney, P. M. (författare)
Tsao, B. P. (författare)
Cantor, R. M. (författare)
Alarcón-Riquelme, Marta E.Uppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi(Swepub:uu)martaala (författare)
Behrens, T. W. (författare)
Harley, J. B. (författare)
Lewis, C. M. (författare)
Criswell, Lindsey A. (författare)
Uppsala universitetInstitutionen för genetik och patologi (creator_code:org_t)

Ingår i:Genes and Immunity: Springer Science and Business Media LLC7:7, s. 609-6141466-48791476-5470

Av författaren/redakt...: Forabosco, P.; Gorman, J. D.; Cleveland, C.; Kelly, J. A.; Fisher, S. A.; Ortmann, W. A.; visa fler...; Johansson, Cecil ...; Johanneson, Bo; Moser, K. L.; Gaffney, P. M.; Tsao, B. P.; Cantor, R. M.; Alarcón-Riquelme ...; Behrens, T. W.; Harley, J. B.; Lewis, C. M.; Criswell, Lindse ...; visa färre...

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.