SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:kth-185066"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:kth-185066" > Analysis of the Cer...

  • Emami Khoonsari, PayamUppsala universitet,Cancerfarmakologi och beräkningsmedicin (författare)

Analysis of the Cerebrospinal Fluid Proteome in Alzheimer's Disease

  • Artikel/kapitelEngelska2016

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2016-03-07
  • Public Library of Science (PLoS),2016
  • printrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:kth-185066
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:kth:diva-185066URI
  • https://doi.org/10.1371/journal.pone.0150672DOI
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-283774URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • QC 20160415
  • Alzheimer's disease is a neurodegenerative disorder accounting for more than 50% of cases of dementia. Diagnosis of Alzheimer's disease relies on cognitive tests and analysis of amyloid beta, protein tau, and hyperphosphorylated tau in cerebrospinal fluid. Although these markers provide relatively high sensitivity and specificity for early disease detection, they are not suitable for monitor of disease progression. In the present study, we used label-free shotgun mass spectrometry to analyse the cerebrospinal fluid proteome of Alzheimer's disease patients and non-demented controls to identify potential biomarkers for Alzheimer's disease. We processed the data using five programs (DecyderMS, Maxquant, OpenMS, PEAKS, and Sieve) and compared their results by means of reproducibility and peptide identification, including three different normalization methods. After depletion of high abundant proteins we found that Alzheimer's disease patients had lower fraction of low-abundance proteins in cerebrospinal fluid compared to healthy controls (p<0.05). Consequently, global normalization was found to be less accurate compared to using spiked-in chicken ovalbumin for normalization. In addition, we determined that Sieve and OpenMS resulted in the highest reproducibility and PEAKS was the programs with the highest identification performance. Finally, we successfully verified significantly lower levels (p<0.05) of eight proteins (A2GL, APOM, C1QB, C1QC, C1S, FBLN3, PTPRZ, and SEZ6) in Alzheimer's disease compared to controls using an antibody-based detection method. These proteins are involved in different biological roles spanning from cell adhesion and migration, to regulation of the synapse and the immune system.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Häggmark, AnnaKTH,Proteomik och nanobioteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Affinity Proteomics,KTH Royal Inst Technol, Sch Biotechnol, Affin Prote, Sci Life Lab, Stockholm, Sweden.(Swepub:kth)u1g5roxd (författare)
  • Lönnberg, MariaUppsala universitet,Analytisk kemi(Swepub:uu)malon498 (författare)
  • Mikus, MariaKTH,Proteomik och nanobioteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Affinity Proteomics,KTH Royal Inst Technol, Sch Biotechnol, Affin Prote, Sci Life Lab, Stockholm, Sweden.(Swepub:kth)u1qjoszn (författare)
  • Kilander, LenaUppsala universitet,Geriatrik(Swepub:uu)lekil226 (författare)
  • Lannfelt, LarsUppsala universitet,Geriatrik(Swepub:uu)lalan021 (författare)
  • Bergquist, JonasUppsala universitet,Analytisk kemi(Swepub:uu)jbe25356 (författare)
  • Ingelsson, MartinUppsala universitet,Geriatrik(Swepub:uu)maing121 (författare)
  • Nilsson, PeterKTH,Proteomik och nanobioteknologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Affinity Proteomics,KTH Royal Inst Technol, Sch Biotechnol, Affin Prote, Sci Life Lab, Stockholm, Sweden.(Swepub:kth)u1ws88sk (författare)
  • Kultima, KimUppsala universitet,Cancerfarmakologi och beräkningsmedicin(Swepub:uu)kikul535 (författare)
  • Shevchenko, GannaUppsala universitet,Analytisk kemi,Uppsala Univ, Dept Chem BMC, Analyt Chem, Uppsala, Sweden.(Swepub:uu)gansc354 (författare)
  • Uppsala universitetCancerfarmakologi och beräkningsmedicin (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:PLOS ONE: Public Library of Science (PLoS)11:31932-6203

Internetlänk

Hitta via bibliotek

  • PLOS ONE (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy