DNA based classification of food associated Enterobacteriaceae previously identified by biolog GN microplates

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:kth-45362" > DNA based classific...

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Olsson, CristerLund University,Lunds universitet,Livsmedelsteknik,Avdelningen för livsmedel och läkemedel,Institutionen för processteknik och tillämpad biovetenskap,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Department of Food Technology, Engineering and Nutrition,Division of Food and Pharma,Department of Process and Life Science Engineering,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH (författare)

DNA based classification of food associated Enterobacteriaceae previously identified by biolog GN microplates

Artikel/kapitelEngelska2004

Förlag, utgivningsår, omfång ...

Elsevier BV,2004
printrdacarrier

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:kth-45362
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:kth:diva-45362URI
https://doi.org/10.1078/072320204322881844DOI
https://lup.lub.lu.se/record/139350URI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska
Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

QC 20111031
Enterobacteriaceae are frequently isolated from food products and it is essential to have methods for correct identification for both food hygiene and epidemiology reasons. Phenotypic methods are not always sufficient and have to be supplemented by DNA based methods. In the present study, 70 strains of Enterobacteriaceae derived from milk, fish and meat that had previously been identified by Biolog GN Microplates were genomically classified together with 15 representative type strains of species of Enterobacteriaceae. The field strains were dominated by Hafnia alvei, Serratia liquefaciens and Rahnella aquatilis. All strains were subjected to temporal temperature gel electrophoresis (TTGE) analysis using amplicons encompassing the V3, V4 and V9 variable regions of the 16S rRNA gene. Selected strains were analysed by ribotyping and partial 16S rDNA sequencing. The type strains were differentiated into 10 different TTGE groups. Two of the groups contained two type strains. Enterobacter aerogenes and Klebsiella planticola were not distinguished due to their identical sequences and Yersinia ruckeri and Citrobacter freundii showed the same migration pattern. The 70 food strains could be differentiated into 14 TTGE groups where 33 strains (47.1%) could be assigned to TTGE groups including type or reference strains. Rabnella strains were dispersed into three TTGE groups of which one group corresponded to Rahnella genomospecies 1 and one to genomospecies 3. The grouping of Rabnella strains was supported by ribotyping and phylogenetic analysis. TTGE can be a useful additional tool for identification on the species level of food related Enterobacteriaceae.

Ämnesord och genrebeteckningar

NATURVETENSKAP Biologi hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences hsv//eng
TEKNIK OCH TEKNOLOGIER Annan teknik Livsmedelsteknik hsv//swe
ENGINEERING AND TECHNOLOGY Other Engineering and Technologies Food Engineering hsv//eng
meat
Enterobacteriaceae
Rahnella
Hafnia
Serratia
genomospecies
TTGE
ribotyping
16S rDNA

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Ahrné, SivLund University,Lunds universitet,Livsmedelsteknik,Avdelningen för livsmedel och läkemedel,Institutionen för processteknik och tillämpad biovetenskap,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Department of Food Technology, Engineering and Nutrition,Division of Food and Pharma,Department of Process and Life Science Engineering,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH(Swepub:lu)livt-sah (författare)
Pettersson, BertilKTH,Bioteknologi(Swepub:kth)u14ame13 (författare)
Molin, GöranLund University,Lunds universitet,Livsmedelsteknik,Avdelningen för livsmedel och läkemedel,Institutionen för processteknik och tillämpad biovetenskap,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Department of Food Technology, Engineering and Nutrition,Division of Food and Pharma,Department of Process and Life Science Engineering,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH(Swepub:lu)livt-gmo (författare)
LivsmedelsteknikAvdelningen för livsmedel och läkemedel (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

Ingår i:Systematic and Applied Microbiology: Elsevier BV27:2, s. 219-2280723-20201618-0984

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Systematic and Applied Microbiology (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Olsson, Crister; Ahrné, Siv; Pettersson, Bert ...; Molin, Göran

Om ämnet

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi

TEKNIK OCH TEKNOLOGIER: TEKNIK OCH TEKNO ...; och Annan teknik; och Livsmedelsteknik

Artiklar i publikationen: Systematic and A ...

Av lärosätet: Kungliga Tekniska Högskolan; Lunds universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se