onr:"swepub:oai:DiVA.org:kth-50450"
Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:kth-50450" > ChloroP, a neural n...
- 1 av 1
- Föregående post
- Nästa post
- Till träfflistan
- Emanuelsson, OlofStockholms unviersitet (författare)
ChloroP, a neural network-based method for predicting chloroplast transit peptides and their cleavage sites.
- Artikel/kapitelEngelska1999
Förlag, utgivningsår, omfång ...
- Wiley,1999
- printrdacarrier
Nummerbeteckningar
- LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:kth-50450
- https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:kth:diva-50450URI
- https://doi.org/10.1110/ps.8.5.978DOI
Kompletterande språkuppgifter
- Språk:engelska
- Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
- SwePubSwePub
Klassifikation
Anmärkningar
- We present a neural network based method (ChloroP) for identifying chloroplast transit peptides and their cleavage sites. Using cross-validation, 88% of the sequences in our homology reduced training set were correctly classified as transit peptides or nontransit peptides. This performance level is well above that of the publicly available chloroplast localization predictor PSORT. Cleavage sites are predicted using a scoring matrix derived by an automatic motif-finding algorithm. Approximately 60% of the known cleavage sites in our sequence collection were predicted to within +/-2 residues from the cleavage sites given in SWISS-PROT. An analysis of 715 Arabidopsis thaliana sequences from SWISS-PROT suggests that the ChloroP method should be useful for the identification of putative transit peptides in genome-wide sequence data. The ChloroP predictor is available as a web-server at http://www.cbs.dtu.dk/services/ChloroP/.
Ämnesord och genrebeteckningar
- NATURVETENSKAP Biologi Bioinformatik och systembiologi hsv//swe
- NATURAL SCIENCES Biological Sciences Bioinformatics and Systems Biology hsv//eng
- chloroplast
- cleavage site
- neural networks
- protein sorting
- transit peptide
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
- Nielsen, HStockholms universitet (författare)
- von Heijne, GStockholms universitet (författare)
- Stockholms unviersitetStockholms universitet (creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
- Ingår i:Protein Science: Wiley8:5, s. 978-9840961-83681469-896X
Internetlänk
- 1 av 1
- Föregående post
- Nästa post
- Till träfflistan
Hitta mer i SwePub
- Av författaren/redakt...
- Emanuelsson, Olo ...
- Nielsen, H
- von Heijne, G
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
- NATURVETENSKAP
- och Biologi
- och Bioinformatik oc ...
- Artiklar i publikationen
- Protein Science
- Av lärosätet
- Kungliga Tekniska Högskolan
Sök utanför SwePub
- Sök vidare i:
- Google Book Search
- Google Scholar
Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.
- Copyright © LIBRIS - Nationella bibliotekssystem
- LIBRIS.kb.se
