Atlas-based analysis of 4D flow CMR: Automated vessel segmentation and flow quantification

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:liu-122197" > Atlas-based analysi...

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Bustamante, MarianaLinköpings universitet,Avdelningen för kardiovaskulär medicin,Medicinska fakulteten (författare)

Atlas-based analysis of 4D flow CMR: Automated vessel segmentation and flow quantification

Artikel/kapitelEngelska2015

Förlag, utgivningsår, omfång ...

2015-10-05
BIOMED CENTRAL LTD,2015
electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:liu-122197
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:liu:diva-122197URI
https://doi.org/10.1186/s12968-015-0190-5DOI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska
Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

Funding Agencies|Swedish Heart and Lung foundation; Swedish Research Council; European Research Council (HEART4FLOW) [310612]
Background: Flow volume quantification in the great thoracic vessels is used in the assessment of several cardiovascular diseases. Clinically, it is often based on semi-automatic segmentation of a vessel throughout the cardiac cycle in 2D cine phase-contrast Cardiovascular Magnetic Resonance (CMR) images. Three-dimensional (3D), time-resolved phase-contrast CMR with three-directional velocity encoding (4D flow CMR) permits assessment of net flow volumes and flow patterns retrospectively at any location in a time-resolved 3D volume. However, analysis of these datasets can be demanding. The aim of this study is to develop and evaluate a fully automatic method for segmentation and analysis of 4D flow CMR data of the great thoracic vessels. Methods: The proposed method utilizes atlas-based segmentation to segment the great thoracic vessels in systole, and registration between different time frames of the cardiac cycle in order to segment these vessels over time. Additionally, net flow volumes are calculated automatically at locations of interest. The method was applied on 4D flow CMR datasets obtained from 11 healthy volunteers and 10 patients with heart failure. Evaluation of the method was performed visually, and by comparison of net flow volumes in the ascending aorta obtained automatically (using the proposed method), and semi-automatically. Further evaluation was done by comparison of net flow volumes obtained automatically at different locations in the aorta, pulmonary artery, and caval veins. Results: Visual evaluation of the generated segmentations resulted in good outcomes for all the major vessels in all but one dataset. The comparison between automatically and semi-automatically obtained net flow volumes in the ascending aorta resulted in very high correlation (r(2) = 0.926). Moreover, comparison of the net flow volumes obtained automatically in other vessel locations also produced high correlations where expected: pulmonary trunk vs. proximal ascending aorta (r(2) = 0.955), pulmonary trunk vs. pulmonary branches (r(2) = 0.808), and pulmonary trunk vs. caval veins (r(2) = 0.906). Conclusions: The proposed method allows for automatic analysis of 4D flow CMR data, including vessel segmentation, assessment of flow volumes at locations of interest, and 4D flow visualization. This constitutes an important step towards facilitating the clinical utility of 4D flow CMR.

Ämnesord och genrebeteckningar

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP Klinisk medicin hsv//swe
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES Clinical Medicine hsv//eng
4D flow cardiovascular magnetic resonance (4D flow CMR); Flow volume; Image segmentation; Image registration; Phase contrast

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Petersson, SvenLinköpings universitet,Institutionen för medicin och hälsa,Centrum för medicinsk bildvetenskap och visualisering, CMIV,Medicinska fakulteten(Swepub:liu)svepe95 (författare)
Eriksson, JonatanLinköpings universitet,Avdelningen för kardiovaskulär medicin,Medicinska fakulteten,Centrum för medicinsk bildvetenskap och visualisering, CMIV(Swepub:liu)joner18 (författare)
Alehagen, UrbanLinköpings universitet,Avdelningen för kardiovaskulär medicin,Medicinska fakulteten,Region Östergötland, Kardiologiska kliniken US(Swepub:liu)urbal84 (författare)
Dyverfeldt, PetterLinköpings universitet,Avdelningen för kardiovaskulär medicin,Medicinska fakulteten,Centrum för medicinsk bildvetenskap och visualisering, CMIV(Swepub:liu)petdy03 (författare)
Carlhäll, CarljohanLinköpings universitet,Avdelningen för kardiovaskulär medicin,Medicinska fakulteten,Centrum för medicinsk bildvetenskap och visualisering, CMIV,Region Östergötland, Fysiologiska kliniken US(Swepub:liu)carca13 (författare)
Ebbers, TinoLinköpings universitet,Avdelningen för kardiovaskulär medicin,Medicinska fakulteten,Centrum för medicinsk bildvetenskap och visualisering, CMIV,Region Östergötland, Fysiologiska kliniken US(Swepub:liu)tineb49 (författare)
Linköpings universitetAvdelningen för kardiovaskulär medicin (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

Ingår i:Journal of Cardiovascular Magnetic Resonance: BIOMED CENTRAL LTD17:871097-66471532-429X

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Journal of Cardiovascular Magnetic Resonance (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Bustamante, Mari ...; Petersson, Sven; Eriksson, Jonata ...; Alehagen, Urban; Dyverfeldt, Pett ...; Carlhäll, Carljo ...; visa fler...; Ebbers, Tino; visa färre...

Om ämnet

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Klinisk medicin

Artiklar i publikationen: Journal of Cardi ...

Av lärosätet: Linköpings universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se