Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:liu-143237" >
Automated quantific...
-
Homeyer, AndreFraunhofer MEVIS, Germany
(författare)
Automated quantification of steatosis: agreement with stereological point counting
- Artikel/kapitelEngelska2017
Förlag, utgivningsår, omfång ...
-
2017-11-13
-
BIOMED CENTRAL LTD,2017
-
electronicrdacarrier
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:liu-143237
-
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:liu:diva-143237URI
-
https://doi.org/10.1186/s13000-017-0671-yDOI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Anmärkningar
-
Funding Agencies|Fraunhofer Society, Munich, Germany; Swedish Research Council of Medicine and Health; Swedish Research Council of Science and Engineering; Vinnova
-
Background: Steatosis is routinely assessed histologically in clinical practice and research. Automated image analysis can reduce the effort of quantifying steatosis. Since reproducibility is essential for practical use, we have evaluated different analysis methods in terms of their agreement with stereological point counting (SPC) performed by a hepatologist. Methods: The evaluation was based on a large and representative data set of 970 histological images from human patients with different liver diseases. Three of the evaluated methods were built on previously published approaches. One method incorporated a new approach to improve the robustness to image variability. Results: The new method showed the strongest agreement with the expert. At 20x resolution, it reproduced steatosis area fractions with a mean absolute error of 0.011 for absent or mild steatosis and 0.036 for moderate or severe steatosis. At 10x resolution, it was more accurate than and twice as fast as all other methods at 20x resolution. When compared with SPC performed by two additional human observers, its error was substantially lower than one and only slightly above the other observer. Conclusions: The results suggest that the new method can be a suitable automated replacement for SPC. Before further improvements can be verified, it is necessary to thoroughly assess the variability of SPC between human observers.
Ämnesord och genrebeteckningar
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Nasr, PatrikLinköpings universitet,Avdelningen för kardiovaskulär medicin,Medicinska fakulteten,Region Östergötland, Magtarmmedicinska kliniken(Swepub:liu)patna19
(författare)
-
Engel, ChristianeFraunhofer MEVIS, Germany
(författare)
-
Kechagias, StergiosLinköpings universitet,Avdelningen för kardiovaskulär medicin,Medicinska fakulteten,Region Östergötland, Magtarmmedicinska kliniken(Swepub:liu)steke00
(författare)
-
Lundberg, PeterLinköpings universitet,Avdelningen för radiologiska vetenskaper,Medicinska fakulteten,Centrum för medicinsk bildvetenskap och visualisering, CMIV,Region Östergötland, Radiofysikavdelningen US(Swepub:liu)petlu11
(författare)
-
Ekstedt, MattiasLinköpings universitet,Avdelningen för kardiovaskulär medicin,Medicinska fakulteten,Region Östergötland, Magtarmmedicinska kliniken(Swepub:liu)matek92
(författare)
-
Kost, HenningFraunhofer MEVIS, Germany
(författare)
-
Weiss, NickFraunhofer MEVIS, Germany
(författare)
-
Palmer, TimUniversity of Leeds, England
(författare)
-
Karl Hahn, HorstFraunhofer MEVIS, Germany
(författare)
-
Treanor, DarrenLinköpings universitet,Avdelningen för neuro- och inflammationsvetenskap,Medicinska fakulteten,University of Leeds, England; Leeds Teaching Hospital NHS Trust, England(Swepub:liu)dartr72
(författare)
-
Lundström, ClaesLinköpings universitet,Medie- och Informationsteknik,Tekniska fakulteten,Centrum för medicinsk bildvetenskap och visualisering, CMIV(Swepub:liu)clalu03
(författare)
-
Fraunhofer MEVIS, GermanyAvdelningen för kardiovaskulär medicin
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:Diagnostic Pathology: BIOMED CENTRAL LTD121746-1596
Internetlänk
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Homeyer, Andre
-
Nasr, Patrik
-
Engel, Christian ...
-
Kechagias, Sterg ...
-
Lundberg, Peter
-
Ekstedt, Mattias
-
visa fler...
-
Kost, Henning
-
Weiss, Nick
-
Palmer, Tim
-
Karl Hahn, Horst
-
Treanor, Darren
-
Lundström, Claes
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Cancer och onkol ...
- Artiklar i publikationen
-
Diagnostic Patho ...
- Av lärosätet
-
Linköpings universitet