The Finnish New Variant of Chlamydia trachomatis with a Single Nucleotide Polymorphism in the 23S rRNA Target Escapes Detection by the Aptima Combo 2 Test

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:oru-75561" > The Finnish New Var...

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hokynar, KatiVirology, University of Helsinki and Helsinki University Hospital, Helsinki, Finland (författare)

The Finnish New Variant of Chlamydia trachomatis with a Single Nucleotide Polymorphism in the 23S rRNA Target Escapes Detection by the Aptima Combo 2 Test

Artikel/kapitelEngelska2019

Förlag, utgivningsår, omfång ...

2019-07-31
MDPI,2019
printrdacarrier

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:oru-75561
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:oru:diva-75561URI
https://doi.org/10.3390/microorganisms7080227DOI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska
Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

Funding Agencies:Helsinki University Hospital Academy of Finland 1285975
In 2019, more than 200 cases of Chlamydia trachomatis negative/equivocal by the Aptima Combo 2 assay (AC2, target: 23S rRNA) with slightly elevated relative light units (RLUs), but positive by the Aptima Chlamydia trachomatis assay (ACT, target: 16S rRNA) have been detected in Finland To identify the cause of the AC2 CT false-negative specimens, we sequenced parts of the CT 23S rRNA gene in 40 specimens that were AC2 negative/equivocal but ACT positive. A single nucleotide polymorphism (SNP; C1515T in the C. trachomatis 23S rRNA gene) was revealed in 39 AC2/ACT discordant specimens. No decrease in the number of mandatorily notified C. trachomatis cases was observed nationally in Finland in 2010-2019. When RLUs obtained for AC2 negative specimens were retrospectively evaluated in 2011-2019, a continuous increase in the proportion of samples with RLUs 10-19 was observed since 2014, and a slight increase in the proportion of samples with RLUs 20-84 in 2017-2019, indicating that the Finnish new variant of C. trachomatis might have been spreading nationally for several years. This emphasizes that careful surveillance of epidemiology, positivity rate and test performance are mandatory to detect any changes affecting detection of infections.

Ämnesord och genrebeteckningar

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP Klinisk medicin Infektionsmedicin hsv//swe
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES Clinical Medicine Infectious Medicine hsv//eng
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper Mikrobiologi inom det medicinska området hsv//swe
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES Basic Medicine Microbiology in the medical area hsv//eng
Chlamydia trachomatis
diagnostics
false negative
mutation
nucleic acid amplification test

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Rantakokko-Jalava, KaisuDepartment of Clinical Microbiology, Turku University Hospital, Turku, Finland; Department of Virology, University of Turku, Turku, Finland (författare)
Hakanen, AnttiDepartment of Clinical Microbiology, Turku University Hospital, Turku, Finland; Department of Virology, University of Turku, Turku, Finland (författare)
Havana, MarikaYNLAB Finland, Helsinki, Finland (författare)
Mannonen, LauraVirology, University of Helsinki and Helsinki University Hospital, Helsinki, Finland (författare)
Jokela, PiaVirology, University of Helsinki and Helsinki University Hospital, Helsinki, Finland (författare)
Kurkela, SatuVirology, University of Helsinki and Helsinki University Hospital, Helsinki, Finland (författare)
Lappalainen, MaijaVirology, University of Helsinki and Helsinki University Hospital, Helsinki, Finland (författare)
Unemo, Magnus,1970-Örebro universitet,Institutionen för medicinska vetenskaper,Region Örebro län,World Health Organization (WHO) Collaborating Centre for Gonorrhoea and other Sexually Transmitted Infections (STIs), National Reference Laboratory for STIs, Department of Laboratory Medicine(Swepub:oru)muo (författare)
Puolakkainen, MirjaVirology, University of Helsinki and Helsinki University Hospital, Helsinki, Finland (författare)
Virology, University of Helsinki and Helsinki University Hospital, Helsinki, FinlandDepartment of Clinical Microbiology, Turku University Hospital, Turku, Finland; Department of Virology, University of Turku, Turku, Finland (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

Ingår i:Microorganisms: MDPI7:82076-2607

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Microorganisms (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Hokynar, Kati; Rantakokko-Jalav ...; Hakanen, Antti; Havana, Marika; Mannonen, Laura; Jokela, Pia; visa fler...; Kurkela, Satu; Lappalainen, Mai ...; Unemo, Magnus, 1 ...; Puolakkainen, Mi ...; visa färre...

Om ämnet

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Klinisk medicin; och Infektionsmedici ...

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Medicinska och f ...; och Mikrobiologi ino ...

Artiklar i publikationen: Microorganisms

Av lärosätet: Örebro universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se