SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:sh-14447"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:sh-14447" > Genomewide analysis...

  • Wiren, MariannaSödertörns högskola,Institutionen för livsvetenskaper,Karolinska Institutet (författare)

Genomewide analysis of nucleosome density histone acetylation and HDAC function in fission yeast

  • Artikel/kapitelEngelska2005

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2005-08-04
  • Wiley,2005
  • printrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:sh-14447
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:sh:diva-14447URI
  • https://doi.org/10.1038/sj.emboj.7600758DOI
  • http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:1955621URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • We have conducted a genomewide investigation into the enzymatic specificity, expression profiles, and binding locations of four histone deacetylases (HDACs), representing the three different phylogenetic classes in fission yeast ( Schizosaccharomyces pombe). By directly comparing nucleosome density, histone acetylation patterns and HDAC binding in both intergenic and coding regions with gene expression profiles, we found that Sir2 ( class III) and Hos2 ( class I) have a role in preventing histone loss; Clr6 ( class I) is the principal enzyme in promoter-localized repression. Hos2 has an unexpected role in promoting high expression of growth-related genes by deacetylating H4K16Ac in their open reading frames. Clr3 ( class II) acts cooperatively with Sir2 throughout the genome, including the silent regions: rDNA, centromeres, mat2/3 and telomeres. The most significant acetylation sites are H3K14Ac for Clr3 and H3K9Ac for Sir2 at their genomic targets. Clr3 also affects subtelomeric regions which contain clustered stress- and meiosis-induced genes. Thus, this combined genomic approach has uncovered different roles for fission yeast HDACs at the silent regions in repression and activation of gene expression.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Silverstein, Rebecca ASödertörns högskola,Institutionen för livsvetenskaper,Karolinska Institutet(Swepub:sh)SHRASN (författare)
  • Sinha, IndranilSödertörns högskola,Institutionen för livsvetenskaper,Karolinska Institutet(Swepub:sh)shilsa04 (författare)
  • Walfridsson, JulianSödertörns högskola,Institutionen för livsvetenskaper,Karolinska Institutet(Swepub:sh)SH99JNWN (författare)
  • Lee, Hang-maoSödertörns högskola,Institutionen för livsvetenskaper,Karolinska Institutet(Swepub:sh)shhole04 (författare)
  • Laurenson, PUniversity of California, San Diego, USA (författare)
  • Pillus, LUniversity of California, San Diego, USA (författare)
  • Robyr, DUniversity of California, Los Angeles, USA (författare)
  • Grunstein, MUniversity of California, Los Angeles, USA (författare)
  • Ekwall, KarlSödertörns högskola,Institutionen för livsvetenskaper,Karolinska Institutet(Swepub:sh)SHKLEL (författare)
  • Södertörns högskolaInstitutionen för livsvetenskaper (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:EMBO Journal: Wiley24:16, s. 2906-29180261-41891460-2075

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy