onr:"swepub:oai:DiVA.org:su-158253"
Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:su-158253" > Spatial maps of pro...
- 1 av 1
- Föregående post
- Nästa post
- Till träfflistan
Spatial maps of prostate cancer transcriptomes reveal an unexplored landscape of heterogeneity
-
- Berglund, Emelie (författare)
- KTH,Genteknologi,Royal Inst Technol KTH, Sci Life Lab, Dept Gene Technol, Sch Engn Sci Chem Biotechnol & Hlth, Tomtebodavagen 23, S-17165 Solna, Sweden
-
- Maaskola, Jonas (författare)
- KTH,Genteknologi,Royal Inst Technol KTH, Sci Life Lab, Dept Gene Technol, Sch Engn Sci Chem Biotechnol & Hlth, Tomtebodavagen 23, S-17165 Solna, Sweden
-
- Schultz, Niklas (författare)
- Karolinska Institutet,Karolinska Inst, Dept Oncol Pathol, Sci Life Lab, Tomtebodavagen 23, S-17165 Solna, Sweden
- visa fler...
- visa färre...
- (creator_code:org_t)
- 2018-06-20
- 2018
- Engelska.
- Ingår i: Nature Communications. - : Springer Science and Business Media LLC. - 2041-1723. ; 9
- Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Intra-tumor heterogeneity is one of the biggest challenges in cancer treatment today. Here we investigate tissue-wide gene expression heterogeneity throughout a multifocal prostate cancer using the spatial transcriptomics (ST) technology. Utilizing a novel approach for deconvolution, we analyze the transcriptomes of nearly 6750 tissue regions and extract distinct expression profiles for the different tissue components, such as stroma, normal and PIN glands, immune cells and cancer. We distinguish healthy and diseased areas and thereby provide insight into gene expression changes during the progression of prostate cancer. Compared to pathologist annotations, we delineate the extent of cancer foci more accurately, interestingly without link to histological changes. We identify gene expression gradients in stroma adjacent to tumor regions that allow for re-stratification of the tumor microenvironment. The establishment of these profiles is the first step towards an unbiased view of prostate cancer and can serve as a dictionary for future studies.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine (hsv//eng)
Nyckelord
- Biochemistry towards Bioinformatics
- biokemi med inriktning mot bioinformatik
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
- 1 av 1
- Föregående post
- Nästa post
- Till träfflistan
Hitta mer i SwePub
- Av författaren/redakt...
- Berglund, Emelie
- Maaskola, Jonas
- Schultz, Niklas
- Friedrich, Stefa ...
- Marklund, Maja
- Bergenstråhle, ...
- visa fler...
- Tarish, Firas
- Tanoglidi, Anna
- Vickovic, Sanja
- Larsson, Ludvig
- Salmén, Fredrik
- Ogris, Christoph
- Wallenborg, Karo ...
- Lagergren, Jens
- Ståhl, Patrik, D ...
- Sonnhammer, Erik
- Helleday, Thomas
- Lundeberg, Joaki ...
- visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
- NATURVETENSKAP
- och Biologi
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
- MEDICIN OCH HÄLS ...
- och Klinisk medicin
- och Cancer och onkol ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
- MEDICIN OCH HÄLS ...
- och Klinisk medicin
- Artiklar i publikationen
- Nature Communica ...
Sök utanför SwePub
- Sök vidare i:
- Google Book Search
- Google Scholar
Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.
- Copyright © LIBRIS - Nationella bibliotekssystem
- LIBRIS.kb.se
