SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-124278"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-124278" > Genome-wide high-re...

  • Mantripragada, Kiran K (författare)

Genome-wide high-resolution analysis of DNA copy number alterations in NF1-associated malignant peripheral nerve sheath tumors using 32K BAC array

  • Artikel/kapitelEngelska2009

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • Wiley,2009
  • printrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-124278
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-124278URI
  • https://doi.org/10.1002/gcc.20695DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Neurofibromatosis Type I (NF1) is an autosomal dominant disorder characterized by the development of both benign and malignant tumors. The lifetime risk for developing a malignant peripheral nerve sheath tumor (MPNST) in NF1 patients is approximately 10% with poor survival rates. To date, the molecular basis of MPNST development remains unclear. Here, we report the first genome-wide and high-resolution analysis of DNA copy number alterations in MPNST using the 32K bacterial artificial chromosome microarray on a series of 24 MPNSTs and three neurofibroma samples. In the benign neurofibromas, apart from loss of one copy of the NF1 gene and copy number polymorphisms, no other changes were found. The profiles of malignant samples, however, revealed specific loss of chromosomal regions including 1p35-33, 1p21, 9p21.3, 10q25, 11q22-23, 17q11, and 20p12.2 as well as gain of 1q25, 3p26, 3q13, 5p12, 5q11.2-q14, 5q21-23, 5q31-33, 6p23-p21, 6p12, 6q15, 6q23-q24, 7p22, 7p14-p13, 7q21, 7q36, 8q22-q24, 14q22, and 17q21-q25. Copy number gains were more frequent than deletions in the MPNST samples (62% vs. 38%). The genes resident within common regions of gain were NEDL1 (7p14), AP3B1 (5q14.1), and CUL1 (7q36.1) and these were identified in >63% MPNSTs. The most frequently deleted locus encompassed CDKN2A, CDKN2B, and MTAP genes on 9p21.3 (33% cases). These genes have previously been implicated in other cancer conditions and therefore, should be considered for their therapeutic, prognostic, and diagnostic relevance in NF1 tumorigenesis.

Ämnesord och genrebeteckningar

  • MEDICINE
  • MEDICIN

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Diaz de Ståhl, TeresitaUppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi(Swepub:uu)testahl (författare)
  • Patridge, Chris (författare)
  • Menzel, UweUppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi(Swepub:uu)uwemenze (författare)
  • Andersson, RobinUppsala universitet,Centrum för bioinformatik(Swepub:uu)roand427 (författare)
  • Chuzhanova, Nadia (författare)
  • Kluwe, Lan (författare)
  • Guha, Abhijit (författare)
  • Mautner, Victor (författare)
  • Dumanski, Jan PUppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi(Swepub:uu)janduman (författare)
  • Upadhyaya, Meena (författare)
  • Uppsala universitetInstitutionen för genetik och patologi (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Genes, Chromosomes and Cancer: Wiley48:10, s. 897-9071045-22571098-2264

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy