Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-154280" >
GWAS of Follicular ...
-
Smedby, Karin E.Karolinska Institutet
(författare)
GWAS of Follicular Lymphoma Reveals Allelic Heterogeneity at 6p21.32 and Suggests Shared Genetic Susceptibility with Diffuse Large B-cell Lymphoma
- Artikel/kapitelEngelska2011
Förlag, utgivningsår, omfång ...
-
2011-04-21
-
Public Library of Science (PLoS),2011
-
printrdacarrier
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-154280
-
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-154280URI
-
https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1001378DOI
-
http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:122562197URI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Anmärkningar
-
Non-Hodgkin lymphoma (NHL) represents a diverse group of hematological malignancies, of which follicular lymphoma (FL) is a prevalent subtype. A previous genome-wide association study has established a marker, rs10484561 in the human leukocyte antigen (HLA) class II region on 6p21.32 associated with increased FL risk. Here, in a three-stage genome-wide association study, starting with a genome-wide scan of 379 FL cases and 791 controls followed by validation in 1,049 cases and 5,790 controls, we identified a second independent FL-associated locus on 6p21.32, rs2647012 (ORcombined = 0.64, P-combined= 2x10(-21)) located 962 bp away from rs10484561 (r(2)< 0.1 in controls). After mutual adjustment, the associations at the two SNPs remained genome-wide significant (rs2647012: ORadjusted = 0.70, P-adjusted= 4x10(-12); rs10484561: ORadjusted = 1.64, P-adjusted= 5x10(-15)). Haplotype and coalescence analyses indicated that rs2647012 arose on an evolutionarily distinct haplotype from that of rs10484561 and tags a novel allele with an opposite (protective) effect on FL risk. Moreover, in a follow-up analysis of the top 6 FL-associated SNPs in 4,449 cases of other NHL subtypes, rs10484561 was associated with risk of diffuse large B-cell lymphoma (ORcombined = 1.36, P-combined = 1.4x10(-7)). Our results reveal the presence of allelic heterogeneity within the HLA class II region influencing FL susceptibility and indicate a possible shared genetic etiology with diffuse large B-cell lymphoma. These findings suggest that the HLA class II region plays a complex yet important role in NHL.
Ämnesord och genrebeteckningar
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Foo, Jia Nee
(författare)
-
Skibola, Christine F.
(författare)
-
Darabi, HatefKarolinska Institutet
(författare)
-
Conde, Lucia
(författare)
-
Hjalgrim, HenrikKarolinska Institutet
(författare)
-
Kumar, Vikrant
(författare)
-
Chang, Ellen T.
(författare)
-
Rothman, Nathaniel
(författare)
-
Cerhan, James R.
(författare)
-
Brooks-Wilson, Angela R.
(författare)
-
Rehnberg, Emil
(författare)
-
Irwan, Ishak D.
(författare)
-
Ryder, Lars P.Karolinska Institutet
(författare)
-
Brown, Peter N.
(författare)
-
Bracci, Paige M.
(författare)
-
Agana, Luz
(författare)
-
Riby, Jacques
(författare)
-
Cozen, Wendy
(författare)
-
Davis, Scott
(författare)
-
Hartge, Patricia
(författare)
-
Morton, Lindsay M.
(författare)
-
Severson, Richard K.
(författare)
-
Wang, Sophia S.
(författare)
-
Slager, Susan L.
(författare)
-
Fredericksen, Zachary S.
(författare)
-
Novak, Anne J.
(författare)
-
Kay, Neil E.
(författare)
-
Habermann, Thomas M.
(författare)
-
Armstrong, Bruce
(författare)
-
Kricker, Anne
(författare)
-
Milliken, Sam
(författare)
-
Purdue, Mark P.
(författare)
-
Vajdic, Claire M.
(författare)
-
Boyle, Peter
(författare)
-
Lan, Qing
(författare)
-
Zahm, Shelia H.
(författare)
-
Zhang, Yawei
(författare)
-
Zheng, Tongzhang
(författare)
-
Leach, Stephen
(författare)
-
Spinelli, John J.
(författare)
-
Smith, Martyn T.
(författare)
-
Chanock, Stephen J.
(författare)
-
Padyukov, Leonid
(författare)
-
Alfredsson, LarsKarolinska Institutet
(författare)
-
Klareskog, LarsKarolinska Institutet
(författare)
-
Glimelius, BengtUppsala universitet,Enheten för onkologi(Swepub:uu)bengglim
(författare)
-
Melbye, Mads
(författare)
-
Liu, Edison T.
(författare)
-
Adami, Hans-Olov
(författare)
-
Humphreys, KeithKarolinska Institutet
(författare)
-
Liu, Jianjun
(författare)
-
Karolinska InstitutetEnheten för onkologi
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:PLoS Genetics: Public Library of Science (PLoS)7:4, s. e1001378-1553-73901553-7404
Internetlänk
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Smedby, Karin E.
-
Foo, Jia Nee
-
Skibola, Christi ...
-
Darabi, Hatef
-
Conde, Lucia
-
Hjalgrim, Henrik
-
visa fler...
-
Kumar, Vikrant
-
Chang, Ellen T.
-
Rothman, Nathani ...
-
Cerhan, James R.
-
Brooks-Wilson, A ...
-
Rehnberg, Emil
-
Irwan, Ishak D.
-
Ryder, Lars P.
-
Brown, Peter N.
-
Bracci, Paige M.
-
Agana, Luz
-
Riby, Jacques
-
Cozen, Wendy
-
Davis, Scott
-
Hartge, Patricia
-
Morton, Lindsay ...
-
Severson, Richar ...
-
Wang, Sophia S.
-
Slager, Susan L.
-
Fredericksen, Za ...
-
Novak, Anne J.
-
Kay, Neil E.
-
Habermann, Thoma ...
-
Armstrong, Bruce
-
Kricker, Anne
-
Milliken, Sam
-
Purdue, Mark P.
-
Vajdic, Claire M ...
-
Boyle, Peter
-
Lan, Qing
-
Zahm, Shelia H.
-
Zhang, Yawei
-
Zheng, Tongzhang
-
Leach, Stephen
-
Spinelli, John J ...
-
Smith, Martyn T.
-
Chanock, Stephen ...
-
Padyukov, Leonid
-
Alfredsson, Lars
-
Klareskog, Lars
-
Glimelius, Bengt
-
Melbye, Mads
-
Liu, Edison T.
-
Adami, Hans-Olov
-
Humphreys, Keith
-
Liu, Jianjun
-
visa färre...
- Artiklar i publikationen
-
PLoS Genetics
- Av lärosätet
-
Uppsala universitet
-
Karolinska Institutet