Production of tissue microarrays, immunohistochemistry staining and digitalization within the human protein atlas

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-175989" > Production of tissu...

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Kampf, CarolineUppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Molekylär och morfologisk patologi (författare)

Production of tissue microarrays, immunohistochemistry staining and digitalization within the human protein atlas

Artikel/kapitelEngelska2012

Förlag, utgivningsår, omfång ...

2012-05-31
MyJove Corporation,2012
electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-175989
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-175989URI
https://doi.org/10.3791/3620DOI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska
Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

The tissue microarray (TMA) technology provides the means for high-throughput analysis of multiple tissues and cells. The technique is used within the Human Protein Atlas project for global analysis of protein expression patterns in normal human tissues, cancer and cell lines. Here we present the assembly of 1 mm cores, retrieved from microscopically selected representative tissues, into a single recipient TMA block. The number and size of cores in a TMA block can be varied from approximately forty 2 mm cores to hundreds of 0.6 mm cores. The advantage of using TMA technology is that large amount of data can rapidly be obtained using a single immunostaining protocol to avoid experimental variability. Importantly, only limited amount of scarce tissue is needed, which allows for the analysis of large patient cohorts (1 2). Approximately 250 consecutive sections (4 μm thick) can be cut from a TMA block and used for immunohistochemical staining to determine specific protein expression patterns for 250 different antibodies. In the Human Protein Atlas project, antibodies are generated towards all human proteins and used to acquire corresponding protein profiles in both normal human tissues from 144 individuals and cancer tissues from 216 different patients, representing the 20 most common forms of human cancer. Immunohistochemically stained TMA sections on glass slides are scanned to create high-resolution images from which pathologists can interpret and annotate the outcome of immunohistochemistry. Images together with corresponding pathology-based annotation data are made publically available for the research community through the Human Protein Atlas portal (www.proteinatlas.org) (Figure 1) (3 4). The Human Protein Atlas provides a map showing the distribution and relative abundance of proteins in the human body. The current version contains over 11 million images with protein expression data for 12.238 unique proteins, corresponding to more than 61% of all proteins encoded by the human genome.

Ämnesord och genrebeteckningar

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper Medicinsk genetik hsv//swe
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES Basic Medicine Medical Genetics hsv//eng
Genetics
Issue 63
Immunology
Molecular Biology
tissue microarray
immunohistochemistry
slide scanning
the Human Protein Atlas
protein profiles

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Olsson, IngmarieUppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Molekylär och morfologisk patologi(Swepub:uu)iol00457 (författare)
Ryberg, UrbanUppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Molekylär och morfologisk patologi (författare)
Sjöstedt, EvelinaUppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Molekylär och morfologisk patologi(Swepub:uu)evesj711 (författare)
Pontén, FredrikUppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Molekylär och morfologisk patologi(Swepub:uu)fredpont (författare)
Uppsala universitetScience for Life Laboratory, SciLifeLab (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

Ingår i:Journal of Visualized Experiments: MyJove Corporation:631940-087X

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Journal of Visualized Experiments (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Kampf, Caroline; Olsson, Ingmarie; Ryberg, Urban; Sjöstedt, Evelin ...; Pontén, Fredrik

Om ämnet

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Medicinska och f ...; och Medicinsk geneti ...

Artiklar i publikationen: Journal of Visua ...

Av lärosätet: Uppsala universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se